148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0083 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0083  putative cytochrome c  100 
 
 
184 aa  368  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0149  cytochrome c class I  35.26 
 
 
287 aa  92.4  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.481052  normal  0.118184 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0029  cytochrome c class I  37.61 
 
 
163 aa  77  1e-13  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00298904  hitchhiker  7.95968e-06 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0336  cytochrome c, class I  47.95 
 
 
288 aa  75.9  3e-13  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.358353 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0461  cytochrome c, class I  32.91 
 
 
137 aa  75.5  4e-13  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.943206  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0263  cytochrome c, class I  42.47 
 
 
293 aa  74.7  7e-13  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0150  cytochrome c class I  39.02 
 
 
302 aa  74.3  9e-13  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0315  cytochrome c class I  36.64 
 
 
179 aa  73.6  1e-12  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.326458  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0033  cytochrome c, class I  43.9 
 
 
167 aa  73.6  1e-12  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.198707  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0320  cytochrome c, class I  36.64 
 
 
180 aa  73.6  1e-12  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.388168 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0138  cytochrome c, class I  39.02 
 
 
302 aa  74.3  1e-12  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0498  cytochrome c class I  43.42 
 
 
180 aa  73.2  2e-12  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3322  cytochrome c, class I  42.68 
 
 
297 aa  72.4  3e-12  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0120  cytochrome c family protein  37.97 
 
 
299 aa  72.4  3e-12  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.830572  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3068  cytochrome c family protein  37.97 
 
 
275 aa  72.4  3e-12  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3990  cytochrome c family protein  37.97 
 
 
299 aa  72.4  3e-12  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3918  cytochrome c5  37.97 
 
 
299 aa  72.4  3e-12  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00486957  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3003  cytochrome c family protein  37.97 
 
 
299 aa  72.4  3e-12  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1534  cytochrome c family protein  37.97 
 
 
299 aa  72.4  3e-12  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3302  cytochrome c family protein  37.97 
 
 
299 aa  72.4  3e-12  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.933009  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0385  cytochrome c, class I  46.58 
 
 
299 aa  72.4  4e-12  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0147  cytochrome c class I  37.8 
 
 
297 aa  72  5e-12  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.206313  normal  0.547254 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3330  cytochrome c, class I  37.8 
 
 
296 aa  72  5e-12  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.606623  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3473  cytochrome c, class I  33.9 
 
 
294 aa  71.2  8e-12  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4983  cytochrome c, class I  42.11 
 
 
183 aa  71.2  8e-12  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3261  cytochrome c family protein  37.97 
 
 
300 aa  70.9  9e-12  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00078  cytochrome c5  43.06 
 
 
135 aa  71.2  9e-12  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0061  cytochrome c family protein  39.02 
 
 
298 aa  70.5  1e-11  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3020  cytochrome c class I  36.36 
 
 
298 aa  70.5  1e-11  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.731004 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3367  cytochrome c class I  36.36 
 
 
297 aa  70.1  1e-11  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0164  cytochrome c class I  41.43 
 
 
295 aa  69.7  2e-11  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2999  cytochrome c class I  41.46 
 
 
319 aa  69.7  2e-11  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0221845 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2904  cytochrome c, class I  41.43 
 
 
295 aa  69.7  2e-11  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0151  cytochrome c, class I  41.43 
 
 
295 aa  69.7  2e-11  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3876  cytochrome c class I  40.51 
 
 
300 aa  68.9  3e-11  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2655  hypothetical protein  28.57 
 
 
142 aa  69.7  3e-11  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3091  cytochrome c class I  40.48 
 
 
273 aa  68.9  4e-11  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.994793  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0459  cytochrome c, class I  42.67 
 
 
225 aa  68.2  6e-11  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0133127  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2786  hypothetical protein  28.57 
 
 
142 aa  68.2  6e-11  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0205  cytochrome c, class I  41.56 
 
 
185 aa  68.2  6e-11  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.641753  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0250  cytochrome c class I  42.5 
 
 
148 aa  67.4  1e-10  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  2.96226e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0072  cytochrome c, class I  33.33 
 
 
136 aa  66.6  2e-10  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.663637  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0425  cytochrome C, class I  41.33 
 
 
223 aa  67  2e-10  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.501458  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2059  diheme cytochrome c SoxD  37.5 
 
 
382 aa  65.9  3e-10  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  1.73988e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0605  cytochrome c, class I  29.13 
 
 
216 aa  65.9  3e-10  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00227735  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3650  cytochrome c class I  36.25 
 
 
112 aa  65.5  4e-10  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3084  hypothetical protein  37.8 
 
 
294 aa  65.5  4e-10  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0093  cytochrome c  36.61 
 
 
135 aa  65.1  6e-10  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0144946  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0146  cytochrome c5  31.91 
 
 
266 aa  65.1  6e-10  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00484  cb-type cytochrome oxidase subunit III  32.65 
 
 
131 aa  64.7  7e-10  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6074  cytochrome c5  46.97 
 
 
142 aa  64.3  9e-10  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0095  cytochrome c family protein  40.54 
 
 
129 aa  63.5  1e-09  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69970  cytochrome c5  46.97 
 
 
136 aa  63.9  1e-09  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1247  Caa(3)-type oxidase, subunit IV  30.09 
 
 
230 aa  63.5  2e-09  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2000  cytochrome c, class I  25.64 
 
 
192 aa  63.5  2e-09  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0804521  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0208  cytochrome c, class I  36.84 
 
 
180 aa  63.5  2e-09  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3859  cytochrome c5  39.47 
 
 
206 aa  62.4  3e-09  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  7.64521e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4130  cytochrome c class I  41.33 
 
 
350 aa  62.4  4e-09  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001977  cytochrome c5  28.85 
 
 
137 aa  62  4e-09  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  3.75428e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1307  cytochrome c class I  35 
 
 
174 aa  62.4  4e-09  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.466199 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4834  cytochrome c class I  36.7 
 
 
202 aa  62  5e-09  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.62683  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3726  cytochrome c, class I  38.96 
 
 
99 aa  61.2  8e-09  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.334938  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3542  putative cytochrome  36.25 
 
 
181 aa  61.2  9e-09  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.510228  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0170  cytochrome c, class I  31.71 
 
 
145 aa  59.7  2e-08  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1169  putative cytochrome c  47.76 
 
 
174 aa  59.3  3e-08  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0183  cellulose binding, type IV  39.19 
 
 
134 aa  59.3  3e-08  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.314607  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0264  cytochrome c  38.16 
 
 
99 aa  58.9  4e-08  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4023  cytochrome c class I  37.66 
 
 
99 aa  58.5  5e-08  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000136046  hitchhiker  2.37935e-05 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2556  cytochrome c5  28.28 
 
 
135 aa  58.5  5e-08  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  7.40682e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0229  cytochrome c class I  37.66 
 
 
99 aa  58.5  5e-08  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  2.4603e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0229  cytochrome c class I  37.66 
 
 
99 aa  58.5  5e-08  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  5.37114e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3877  cytochrome c, class I  37.5 
 
 
147 aa  58.2  6e-08  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0232  cytochrome c class I  37.66 
 
 
99 aa  58.2  7e-08  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  4.96502e-06  normal  0.108907 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47940  cytochrome c5 protein  45 
 
 
134 aa  58.2  7e-08  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0232  cytochrome c, class I  37.66 
 
 
99 aa  58.2  7e-08  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0199425  unclonable  3.31566e-11 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0227  cytochrome c, class I  37.66 
 
 
99 aa  58.2  7e-08  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.495989  hitchhiker  0.00493696 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0232  cytochrome c, class I  37.66 
 
 
99 aa  58.2  7e-08  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  unclonable  2.38576e-11 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0180  cytochrome c, class I  39.47 
 
 
97 aa  57.8  9e-08  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.245077  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0249  cytochrome c5-like protein  48.33 
 
 
136 aa  57.4  1e-07  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0216  cytochrome c class I  36.84 
 
 
97 aa  57.8  1e-07  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0309264  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0142  cytochrome c5-like protein  36.14 
 
 
100 aa  56.2  2e-07  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.228578  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0125  cytochrome c-type protein  36.14 
 
 
100 aa  56.2  2e-07  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0350268  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0840  putative cytochrome c5  41.56 
 
 
157 aa  56.6  2e-07  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.674138  normal  0.844917 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4658  cytochrome c, class I  35.44 
 
 
97 aa  56.6  2e-07  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000774786 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5319  cytochrome c5  40.91 
 
 
140 aa  56.2  3e-07  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.241325 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4286  cytochrome c, class I  38.16 
 
 
97 aa  55.8  3e-07  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  4.19984e-05 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3568  cytochrome c, class I  34.18 
 
 
97 aa  55.5  5e-07  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.199847  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5267  cytochrome c5  39.39 
 
 
121 aa  55.1  5e-07  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70340  putative cytochrome c(mono-heme type)  35.21 
 
 
129 aa  55.1  6e-07  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5522  cytochrome c5  39.39 
 
 
138 aa  55.1  6e-07  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.224479 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0140  cytochrome c-type protein  34.94 
 
 
100 aa  54.7  7e-07  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5177  cytochrome c5  39.39 
 
 
140 aa  54.7  7e-07  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.129919  normal  0.155967 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0239  cytochrome c5  36.84 
 
 
107 aa  54.7  7e-07  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2262  cytochrome c family protein  35 
 
 
164 aa  54.7  7e-07  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0203  cytochrome c5  41.67 
 
 
140 aa  54.7  7e-07  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.768078  hitchhiker  0.00155687 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2122  cytochrome c family protein  35 
 
 
164 aa  54.7  7e-07  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2067  cytochrome c family protein  35 
 
 
164 aa  54.7  7e-07  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.272994  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1141  cytochrome c, class I  37.8 
 
 
159 aa  54.7  8e-07  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.828692  normal  0.616371 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1062  cytochrome c class I  37.8 
 
 
159 aa  54.7  8e-07  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4170  cytochrome c class I  37.5 
 
 
140 aa  54.3  9e-07  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>