More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0080 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0080  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 
112 aa  224  3e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416357  normal  0.780104 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2406  nitrogen regulatory protein P-II  89.29 
 
 
112 aa  204  4e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  85.71 
 
 
112 aa  199  1e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6030  nitrogen regulatory protein P-II 2  85.71 
 
 
112 aa  196  9e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0259  nitrogen regulatory protein P-II  85.71 
 
 
112 aa  196  9e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69810  nitrogen regulatory protein P-II 2  85.71 
 
 
112 aa  196  9e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.241854 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0523  nitrogen regulatory protein P-II  83.04 
 
 
112 aa  194  4e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278087  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2866  nitrogen regulatory protein P-II  82.14 
 
 
136 aa  192  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138557  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47790  Nitrogen regulatory protein P-II GlnK  83.93 
 
 
112 aa  192  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.144153  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2877  nitrogen regulatory protein P-II  82.14 
 
 
112 aa  191  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.58077  normal  0.596742 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0437  nitrogen regulatory protein P-II  82.14 
 
 
112 aa  191  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2783  nitrogen regulatory protein P-II  82.14 
 
 
112 aa  191  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.190051  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2921  nitrogen regulatory protein P-II  82.14 
 
 
112 aa  191  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0772673  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3163  nitrogen regulatory protein P-II  81.25 
 
 
112 aa  191  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105283  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2252  nitrogen regulatory protein P-II  82.14 
 
 
112 aa  191  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0233324  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3656  nitrogen regulatory protein P-II  81.25 
 
 
112 aa  191  3e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0217  nitrogen regulatory protein P-II  83.93 
 
 
112 aa  190  5e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.531374  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0238  nitrogen regulatory protein P-II  83.93 
 
 
112 aa  190  5e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0928138  normal  0.898368 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5506  nitrogen regulatory protein P-II  83.93 
 
 
112 aa  190  5e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.851812  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0190  nitrogen regulatory protein P-II  83.93 
 
 
112 aa  190  5e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5143  nitrogen regulatory protein P-II  83.93 
 
 
112 aa  190  5e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5234  nitrogen regulatory protein P-II  83.93 
 
 
112 aa  190  5e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5295  nitrogen regulatory protein P-II  83.93 
 
 
112 aa  190  5e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0218  nitrogen regulatory protein P-II  83.93 
 
 
112 aa  190  7e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2513  nitrogen regulatory protein P-II  81.25 
 
 
112 aa  189  1e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00284343  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0183  nitrogen regulatory protein P-II  83.04 
 
 
112 aa  189  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.320277  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0291  nitrogen regulatory protein P-II  80.36 
 
 
112 aa  189  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4190  nitrogen regulatory protein P-II  81.25 
 
 
112 aa  188  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.959597 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1400  nitrogen regulatory protein P-II  81.25 
 
 
112 aa  189  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0193  nitrogen regulatory protein P-II  81.25 
 
 
112 aa  189  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.431486  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0232  nitrogen regulatory protein P-II  82.14 
 
 
112 aa  188  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312248  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0256  nitrogen regulatory protein P-II  81.25 
 
 
112 aa  188  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0487  nitrogen regulatory protein P-II  81.25 
 
 
112 aa  189  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.188054  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0525  nitrogen regulatory protein P-II  81.25 
 
 
112 aa  188  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.887906  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6195  nitrogen regulatory protein P-II  81.25 
 
 
136 aa  189  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0468  nitrogen regulatory protein P-II  81.25 
 
 
112 aa  189  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.409463  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2827  nitrogen regulatory protein P-II  81.25 
 
 
112 aa  189  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.994537  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0651  nitrogen regulatory protein P-II  81.25 
 
 
112 aa  189  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.888486  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3218  P-II family regulatory protein  81.25 
 
 
112 aa  189  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472285  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0407  nitrogen regulatory protein P-II  81.25 
 
 
112 aa  189  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32852  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  80.36 
 
 
112 aa  187  3e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0594  nitrogen regulatory protein P-II  81.25 
 
 
112 aa  187  4e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0173  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 
112 aa  187  6e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  2.93377e-06  normal  0.353092 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3314  nitrogen regulatory protein P-II  81.25 
 
 
112 aa  186  7e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.258343  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0053  nitrogen regulatory protein P-II  81.25 
 
 
112 aa  186  9e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0041295  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0240  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  79.46 
 
 
112 aa  186  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.289663  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0233  nitrogen regulatory protein P-II  82.14 
 
 
112 aa  186  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0217  nitrogen regulatory protein P-II  80.36 
 
 
112 aa  185  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  3.68327e-06 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0198  nitrogen regulatory protein P-II  80.36 
 
 
112 aa  185  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.485304 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 
112 aa  185  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0195  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 
112 aa  185  2e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.863029 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0163  nitrogen regulatory protein P-II  80.36 
 
 
112 aa  184  3e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.814781 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0181  nitrogen regulatory protein P-II  80.36 
 
 
112 aa  184  3e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.153981  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0302  nitrogen regulatory protein P-II  79.46 
 
 
112 aa  184  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0472  nitrogen regulatory protein P-II  80.36 
 
 
112 aa  184  4e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0120  nitrogen regulatory protein P-II  79.46 
 
 
112 aa  184  5e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0723912 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1116  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 
112 aa  184  5e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3942  nitrogen regulatory protein P-II  81.25 
 
 
112 aa  183  6e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0433  nitrogen regulatory protein P-II  78.57 
 
 
112 aa  183  6e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0037358  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1957  nitrogen regulatory protein P-II  78.57 
 
 
112 aa  183  6e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0342  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  78.57 
 
 
112 aa  182  9e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2346  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  77.68 
 
 
112 aa  182  1e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.235899 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2137  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 
112 aa  181  2e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.573897  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2043  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 
112 aa  182  2e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.242523  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0171  nitrogen regulatory protein P-II  79.46 
 
 
112 aa  182  2e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.138781  normal  0.605066 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0240  nitrogen regulatory protein P-II  78.57 
 
 
112 aa  181  4e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.806951 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3161  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 
112 aa  181  4e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0791702  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0641  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
112 aa  181  4e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252116  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1760  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
112 aa  180  5e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.654192  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00479  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 
112 aa  180  7e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2530  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
112 aa  179  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2915  nitrogen regulatory protein P-II 2  75.89 
 
 
112 aa  179  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0326538  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0626  nitrogen regulatory protein  74.11 
 
 
112 aa  178  2e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0642  nitrogen regulatory protein  74.11 
 
 
112 aa  178  2e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4461  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 
112 aa  178  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188449  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0491  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
112 aa  177  6e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3586  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 
112 aa  176  8e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0323305  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0969  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 
112 aa  176  8e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.916041  hitchhiker  0.000334887 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0146  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
112 aa  176  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220304  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0135  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 
121 aa  175  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.14835e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1779  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
112 aa  176  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.903734 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1345  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
112 aa  176  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.934318 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3770  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 
116 aa  175  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.929056 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
112 aa  175  2e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0156  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
112 aa  175  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0912  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  72.32 
 
 
112 aa  175  2e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  4.42242e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4094  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 
116 aa  175  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.52607  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2085  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  74.11 
 
 
112 aa  174  3e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1663  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
112 aa  174  3e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.824699  normal  0.572812 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2357  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 
112 aa  174  3e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0683  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 
112 aa  174  4e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.173796  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4239  nitrogen regulatory protein PII  70.54 
 
 
116 aa  174  4e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1545  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 
112 aa  173  6e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4580  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 
112 aa  173  7e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.495708  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1516  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
112 aa  173  7e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.14536 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1885  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  74.11 
 
 
112 aa  173  8e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.614675  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1181  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 
112 aa  173  8e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  6.88194e-07 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2550  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 
112 aa  173  8e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0188103  normal  0.0743791 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0485  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 
112 aa  172  1e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.65619  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03567  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 
114 aa  172  1e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.918332  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>