More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0077 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0077  ABC transporter related  100 
 
 
216 aa  418  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0734436  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2409  ABC transporter related  48.6 
 
 
201 aa  177  1e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3121  ABC transporter related  49.3 
 
 
207 aa  156  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.522166  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0166  ABC transporter related  51.26 
 
 
225 aa  152  3e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3634  ABC transporter related  44.5 
 
 
212 aa  152  3e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0768  ABC transporter related  44.9 
 
 
199 aa  143  3e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0197  ABC transporter related protein  48.17 
 
 
206 aa  142  4e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.994247 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0122  ABC transporter related protein  42.49 
 
 
205 aa  141  8e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.60914  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2103  ABC transporter related  44.1 
 
 
213 aa  135  5e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.71434  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0701  ABC transporter related  42.93 
 
 
197 aa  134  1e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0073  ABC transporter related  44.81 
 
 
223 aa  124  8e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.606283 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0129  ABC transporter related  40.1 
 
 
202 aa  124  1e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00335673  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1836  ABC transporter, ATPase subunit  45.73 
 
 
209 aa  124  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2240  ABC transporter related  43.94 
 
 
206 aa  121  1e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.748351  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7996  ABC transporter related  42.93 
 
 
206 aa  115  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0883006  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2481  ABC transporter related  25.69 
 
 
220 aa  90.9  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000539797  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2530  ABC transporter related  25.69 
 
 
220 aa  90.9  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00573558  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2038  ABC transporter, ATP-binding protein  28.23 
 
 
220 aa  87.8  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436914  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0321  ABC transporter related  30.4 
 
 
227 aa  86.7  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1967  hemin importer ATP-binding subunit  34.8 
 
 
269 aa  85.9  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2320  ABC transporter, ATP-binding protein  40.47 
 
 
276 aa  85.9  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21300  ABC transporter, ATP binding component  36.45 
 
 
352 aa  85.9  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2152  ABC transporter, ATP-binding protein  40.47 
 
 
264 aa  85.9  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1798  ABC transporter related  35.81 
 
 
233 aa  85.9  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2189  ABC transporter, ATP-binding protein  40.47 
 
 
231 aa  85.5  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1068  ABC transporter, ATP-binding protein  40.47 
 
 
231 aa  85.1  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.393113  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1797  ABC transporter, ATP-binding protein  40.47 
 
 
231 aa  85.1  7e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.515092  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1310  ABC transporter, ATP-binding protein  40.47 
 
 
231 aa  85.1  7e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0098  ABC transporter, ATP-binding protein  40.47 
 
 
231 aa  85.1  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.432018  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0467  hypothetical protein  28.37 
 
 
352 aa  85.1  7e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.548776  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3494  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  28.05 
 
 
621 aa  84.7  1e-15  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2267  ABC transporter, ATP-binding protein  38.6 
 
 
276 aa  84.7  1e-15  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.600879  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1864  ABC transporter related  35.78 
 
 
242 aa  82.8  3e-15  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00206412  normal  0.0919522 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6370  ABC transporter related  36.64 
 
 
363 aa  82.8  3e-15  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3849  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  30.18 
 
 
609 aa  83.2  3e-15  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000408655 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1075  ATPase  32.89 
 
 
324 aa  82.8  4e-15  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.243658  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5071  ABC transporter, ATPase subunit  35.68 
 
 
233 aa  81.6  7e-15  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.310601  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1598  ABC transporter, ATP-binding protein  24.31 
 
 
502 aa  81.3  1e-14  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2055  ABC transporter related  31.88 
 
 
250 aa  81.3  1e-14  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.351163  normal  0.0720953 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0081  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  35.62 
 
 
253 aa  80.9  1e-14  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3954  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  35.65 
 
 
381 aa  80.9  2e-14  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.320364  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1920  ABC transporter related  35.19 
 
 
235 aa  80.5  2e-14  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6306  ABC transporter related  35.35 
 
 
233 aa  80.9  2e-14  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.846899  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4040  ABC transporter related  31.8 
 
 
365 aa  80.5  2e-14  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0098  ABC transporter related  34.25 
 
 
242 aa  80.5  2e-14  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0987  ABC transporter related  35.02 
 
 
246 aa  80.9  2e-14  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1465  ABC transporter related  29.68 
 
 
371 aa  80.1  2e-14  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.778579  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4667  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  30.45 
 
 
225 aa  80.5  2e-14  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1773  ABC transporter related  35.35 
 
 
233 aa  80.9  2e-14  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.057555  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2473  ABC transporter related protein  29.82 
 
 
258 aa  80.5  2e-14  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.200808  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0688  ABC transporter, ATP-binding protein  27.62 
 
 
218 aa  79.7  3e-14  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.580982  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2334  ABC transporter related protein  34.88 
 
 
232 aa  79.7  3e-14  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00373453  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01090  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  30.86 
 
 
233 aa  80.1  3e-14  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.848315  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0733  ABC transporter related  28.5 
 
 
258 aa  79.7  3e-14  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  1.20086e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1628  ABC transporter related protein  32.27 
 
 
250 aa  80.1  3e-14  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0231  ABC transporter-like protein  35.81 
 
 
266 aa  79.3  4e-14  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0026  hypothetical protein  28.92 
 
 
647 aa  79.3  4e-14  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1716  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  28.69 
 
 
355 aa  79.3  4e-14  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198407  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  31.58 
 
 
255 aa  79.3  4e-14  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1935  ABC transporter related  32.57 
 
 
352 aa  79  5e-14  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2658  ABC transporter-related protein  32.27 
 
 
227 aa  79  5e-14  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0553  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  33.48 
 
 
228 aa  78.6  6e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2373  ABC transporter related  36.73 
 
 
225 aa  79  6e-14  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1930  ABC transporter related  35.16 
 
 
258 aa  78.6  6e-14  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304098  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0570  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  33.48 
 
 
228 aa  78.6  6e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.661781 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1033  ABC transporter related  31.6 
 
 
248 aa  78.6  6e-14  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4307  ABC transporter related  27.65 
 
 
360 aa  78.6  6e-14  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0457918  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0560  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  33.48 
 
 
228 aa  78.6  6e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0400  ABC transporter  26.73 
 
 
568 aa  79  6e-14  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.429151  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0872  ABC transporter-like protein  34.23 
 
 
248 aa  78.6  6e-14  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.175759  normal  0.103583 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0519  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  31.25 
 
 
364 aa  78.6  7e-14  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal  0.744926 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1602  ABC transporter related  29.67 
 
 
242 aa  78.6  7e-14  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.752612 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0493  ABC transporter-related protein  30.86 
 
 
224 aa  78.2  8e-14  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0198  ABC transporter related  34.26 
 
 
251 aa  78.2  8e-14  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6023  ABC transporter-related protein  29.09 
 
 
367 aa  78.2  8e-14  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9257  ABCB8; ATP-binding cassette, sub-family B (MDR/TAP), member 8  34.78 
 
 
586 aa  78.2  9e-14  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1890  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  32.23 
 
 
665 aa  78.2  9e-14  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.508621  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1824  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  32.23 
 
 
665 aa  78.2  9e-14  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.807702  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1843  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like protein  32.23 
 
 
665 aa  78.2  9e-14  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5622  ABC transporter related protein  35.85 
 
 
239 aa  77.8  1e-13  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.630537  normal  0.214066 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1461  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  31.98 
 
 
605 aa  77.4  1e-13  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2002  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.59 
 
 
574 aa  77.8  1e-13  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393049  normal  0.619669 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3834  ABC transporter related  31.34 
 
 
359 aa  77.8  1e-13  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28040  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  30.88 
 
 
350 aa  77.8  1e-13  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.539146  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0833  ABC transporter related  29.55 
 
 
224 aa  77.8  1e-13  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2322  ABC transporter, ATPase subunit  32.89 
 
 
242 aa  77.4  1e-13  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2397  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.59 
 
 
574 aa  77.8  1e-13  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.894313  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1589  ABC transporter related  36.95 
 
 
239 aa  77.4  2e-13  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0191  ABC transporter related  32.88 
 
 
247 aa  77.4  2e-13  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00111007  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2699  cytochrome c biogenesis protein CcmA  34.23 
 
 
209 aa  77  2e-13  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1716  ABC transporter related  28.91 
 
 
365 aa  76.6  2e-13  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0970  ABC transporter related  26.94 
 
 
241 aa  77.4  2e-13  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3586  type I secretion system ATPase  32.58 
 
 
598 aa  77  2e-13  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1712  ABC transporter related  34.25 
 
 
266 aa  77  2e-13  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3041  ABC transporter related  31.14 
 
 
372 aa  76.3  3e-13  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383047  normal  0.901224 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1498  ABC transporter related  35.19 
 
 
233 aa  76.3  3e-13  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0282182 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3396  ABC opine/polyamine transporter, ATPase subunit  31.14 
 
 
372 aa  76.6  3e-13  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1788  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  30.77 
 
 
370 aa  76.3  3e-13  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0784  hemin importer ATP-binding subunit  32.09 
 
 
254 aa  76.6  3e-13  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1684  ABC transporter related  34.25 
 
 
233 aa  76.6  3e-13  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>