259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0073 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0073  spermidine synthase  100 
 
 
286 aa  589  1e-167  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.116459  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0119  spermidine synthase  60.07 
 
 
292 aa  364  1e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3123  spermidine synthase  60.07 
 
 
283 aa  362  4e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.873579  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2411  spermidine synthase  62.32 
 
 
278 aa  356  2e-97  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0521  spermidine synthase  56.54 
 
 
293 aa  350  1e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.402925  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0558  spermidine synthase  60.22 
 
 
284 aa  348  9e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.587029  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0201  spermidine synthase  58.3 
 
 
283 aa  347  2e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.386649 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2046  spermidine synthase  60.44 
 
 
285 aa  343  2e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03650  spermidine synthase  57.71 
 
 
285 aa  334  8e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0120  spermidine synthase  56.99 
 
 
285 aa  331  1e-89  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0292397  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0105  spermidine synthase  56.99 
 
 
285 aa  330  2e-89  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.381293  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3769  spermidine synthase  54.06 
 
 
283 aa  323  3e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0335  spermidine synthase  55.98 
 
 
278 aa  298  6e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.404656 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0156  spermidine synthase  55.98 
 
 
316 aa  297  1e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.870744  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2353  spermidine synthase  46.91 
 
 
307 aa  228  7e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0206  spermidine synthase  44.24 
 
 
277 aa  226  4e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2794  spermidine synthase  42.24 
 
 
279 aa  225  7e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.401374  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0602  spermidine synthase  37.99 
 
 
279 aa  225  8e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1825  spermidine synthase  37.63 
 
 
280 aa  224  1e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0896  spermidine synthase  37.28 
 
 
279 aa  224  1e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1580  spermidine synthase  40.71 
 
 
277 aa  224  2e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1086  spermidine synthase  37.28 
 
 
280 aa  223  2e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0831  spermidine synthase  37.28 
 
 
280 aa  222  6e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1979  spermidine synthase  43.96 
 
 
275 aa  221  8e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  4.50983e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0488  spermidine synthase  39.93 
 
 
277 aa  216  3e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000641505  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0694  spermidine synthase  37.41 
 
 
275 aa  206  3e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.251821  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0060  spermidine synthase  40.99 
 
 
281 aa  204  1e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1314  spermidine synthase  39.93 
 
 
278 aa  204  2e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1075  spermidine synthase  38.65 
 
 
289 aa  203  3e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  3.10388e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4705  spermidine synthase  45.16 
 
 
283 aa  201  1e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.725574 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0668  spermidine synthase  39.78 
 
 
273 aa  198  9e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.672197  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2794  spermidine synthase  36.07 
 
 
286 aa  197  1e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2546  spermidine synthase  39.3 
 
 
291 aa  196  4e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1816  spermidine synthase  42.03 
 
 
283 aa  193  3e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.150426  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1199  spermidine synthase  39.07 
 
 
279 aa  192  7e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.928058  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1627  spermidine synthase  38.27 
 
 
290 aa  190  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3567  spermidine synthase  41.01 
 
 
275 aa  188  8e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3351  spermidine synthase  38.49 
 
 
275 aa  187  1e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000337487  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0570  spermidine synthase  37.1 
 
 
302 aa  187  2e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.758892  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0182  spermidine synthase  35.82 
 
 
284 aa  186  5e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.25359e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3461  spermidine synthase  39.13 
 
 
278 aa  183  2e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0515  spermidine synthase  33.21 
 
 
283 aa  184  2e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84352  predicted protein  36.11 
 
 
300 aa  182  7e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0529  spermidine synthase  32.86 
 
 
283 aa  181  1e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0886  spermidine synthase  39.39 
 
 
280 aa  180  2e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0155  spermidine synthase  34.16 
 
 
276 aa  180  2e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.164944  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3054  spermidine synthase  33.8 
 
 
283 aa  177  1e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5164  spermidine synthase  37.55 
 
 
275 aa  178  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5067  spermidine synthase  37.18 
 
 
275 aa  177  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.694497  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5500  spermidine synthase  37.18 
 
 
275 aa  176  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5219  spermidine synthase  37.18 
 
 
275 aa  176  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5548  spermidine synthase  37.18 
 
 
275 aa  176  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5619  spermidine synthase  37.18 
 
 
275 aa  176  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5051  spermidine synthase  37.18 
 
 
275 aa  176  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5458  spermidine synthase  37.18 
 
 
275 aa  176  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5492  spermidine synthase  37.18 
 
 
275 aa  176  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3884  spermidine synthase  36.82 
 
 
275 aa  175  6e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5462  spermidine synthase  36.82 
 
 
275 aa  175  7e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1016  spermidine synthase  35.52 
 
 
287 aa  172  5e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0536  spermidine synthase  36.75 
 
 
289 aa  172  5e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.326149  normal  0.292064 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3129  spermidine synthase  35.54 
 
 
287 aa  172  5e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00687  SPEE_NEUCR Spermidine synthase (Putrescine aminopropyltransferase) (SPDSY)Spermidine synthase ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96UK1]  35.07 
 
 
292 aa  172  7e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0245042  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1417  spermidine synthase  32.97 
 
 
288 aa  171  1e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01150  spermidine synthase, putative  35.21 
 
 
748 aa  170  2e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2191  spermidine synthase  37.32 
 
 
287 aa  170  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0930161  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1691  spermidine synthase  38.46 
 
 
283 aa  170  3e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0277  spermidine synthase  33.68 
 
 
296 aa  168  8e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.173175  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3584  spermidine synthase  35.82 
 
 
286 aa  168  9e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0275  spermidine synthase  33.68 
 
 
293 aa  167  1e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0154876  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1326  spermidine synthase  35.9 
 
 
295 aa  167  1e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4001  spermidine synthase  35.19 
 
 
287 aa  167  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_55177  spermine/spermidine synthase  34.41 
 
 
299 aa  166  3e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3482  spermidine synthase  35.15 
 
 
296 aa  165  7e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00378102  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3354  spermidine synthase  35.15 
 
 
296 aa  165  7e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.76507e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0182  spermidine synthase  33.9 
 
 
286 aa  165  7e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23820  spermidine synthase  34.33 
 
 
286 aa  165  9e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0198  spermidine synthase  33.9 
 
 
286 aa  164  1e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0309  spermidine synthase  35.4 
 
 
271 aa  164  1e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0190  spermidine synthase  33.9 
 
 
286 aa  164  1e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.241142  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1023  spermidine synthase  35.15 
 
 
296 aa  164  1e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0114  spermidine synthase  34.25 
 
 
288 aa  164  1e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.847e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0181  spermidine synthase  33.9 
 
 
286 aa  164  1e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0185  spermidine synthase  33.9 
 
 
286 aa  164  2e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.506874 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42690  spermidine synthase  35.32 
 
 
286 aa  164  2e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3481  spermidine synthase  34.25 
 
 
288 aa  163  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00013489  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00120  spermidine synthase  34.25 
 
 
288 aa  163  3e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00387054  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0125  spermidine synthase  34.25 
 
 
288 aa  163  3e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  5.67912e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00119  hypothetical protein  34.25 
 
 
288 aa  163  3e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00179737  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0123  spermidine synthase  34.25 
 
 
288 aa  163  3e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.705101  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0628  spermidine synthase  38.18 
 
 
286 aa  163  3e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.414724  normal  0.905176 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3538  spermidine synthase  34.25 
 
 
288 aa  163  3e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00580941  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0131  spermidine synthase  34.25 
 
 
288 aa  163  3e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.316229  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0128  spermidine synthase  33.9 
 
 
288 aa  162  4e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000545109  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2836  spermidine synthase  34.48 
 
 
287 aa  162  5e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13386  spermine/spermidine synthase  35.87 
 
 
275 aa  161  1e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1864  spermidine synthase  34.57 
 
 
286 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0174037  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2055  spermidine synthase  34.57 
 
 
286 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1732  spermidine synthase  34.29 
 
 
291 aa  159  5e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0669  spermidine synthase  33.9 
 
 
289 aa  158  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000146027  normal  0.395519 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2884  spermidine synthase  31.97 
 
 
292 aa  154  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>