124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0068 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0068  hypothetical protein  100 
 
 
123 aa  256  6e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2342  hypothetical protein  61.74 
 
 
144 aa  159  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0058  protein of unknown function DUF971  63.39 
 
 
121 aa  151  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.563148  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0104  protein of unknown function DUF971  63.39 
 
 
121 aa  151  3e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3645  hypothetical protein  61.67 
 
 
140 aa  150  5e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.785691  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2270  hypothetical protein  58.97 
 
 
139 aa  150  6e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.647055  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0403  hypothetical protein  62.5 
 
 
130 aa  149  1e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.337193  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0370  hypothetical protein  59.84 
 
 
138 aa  147  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.040295  normal  0.643412 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0699  hypothetical protein  65.18 
 
 
124 aa  146  7e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5462  hypothetical protein  60.34 
 
 
140 aa  145  1e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271725  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0430  hypothetical protein  61.74 
 
 
138 aa  145  2e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0623601  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0457  hypothetical protein  59.66 
 
 
138 aa  141  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.82157 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0795  protein of unknown function DUF971  56.9 
 
 
138 aa  140  6e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.8673  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0866  hypothetical protein  56.9 
 
 
138 aa  140  7e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.214574  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2736  hypothetical protein  59.48 
 
 
138 aa  140  8e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0298076 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1315  hypothetical protein  56.9 
 
 
138 aa  139  1e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.1813  hitchhiker  0.00777852 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2016  hypothetical protein  58.41 
 
 
121 aa  139  1e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.485395  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0347  protein of unknown function DUF971  59.13 
 
 
138 aa  137  6e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.288464 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2397  hypothetical protein  54.55 
 
 
137 aa  136  8e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0666  hypothetical protein  54.55 
 
 
137 aa  136  8e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2761  hypothetical protein  54.55 
 
 
137 aa  136  8e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.255112  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2317  hypothetical protein  54.55 
 
 
137 aa  136  8e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.615217  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0682  hypothetical protein  54.55 
 
 
137 aa  136  8e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4130  protein of unknown function DUF971  56.03 
 
 
137 aa  136  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.178996  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0552  hypothetical protein  54.55 
 
 
137 aa  135  3e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0332  protein of unknown function DUF971  58.26 
 
 
138 aa  135  3e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.591786  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0531  hypothetical protein  53.33 
 
 
123 aa  134  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0147  hypothetical protein  55.65 
 
 
132 aa  134  5e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.793552 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1603  protein of unknown function DUF971  54.1 
 
 
132 aa  134  5e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2699  heat shock protein DnaJ  58.1 
 
 
134 aa  134  6e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00021338 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0220  protein of unknown function DUF971  54.87 
 
 
140 aa  133  8e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.635086  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3513  hypothetical protein  55.65 
 
 
135 aa  132  1e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164721 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4118  hypothetical protein  52 
 
 
140 aa  132  1e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2784  hypothetical protein  52.59 
 
 
137 aa  132  2e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.652126  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0780  hypothetical protein  52.59 
 
 
137 aa  132  2e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2651  hypothetical protein  52.59 
 
 
137 aa  132  2e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.624861  normal  0.511328 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0859  hypothetical protein  52.59 
 
 
137 aa  132  2e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.114116 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6060  hypothetical protein  51.72 
 
 
137 aa  131  2e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.961945 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1898  hypothetical protein  51.64 
 
 
128 aa  132  2e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.32912  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1309  hypothetical protein  58.04 
 
 
122 aa  131  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.159335  hitchhiker  0.00415423 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2733  hypothetical protein  51.72 
 
 
137 aa  130  4e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.964648  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2121  hypothetical protein  51.72 
 
 
137 aa  130  4e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.59794  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2760  hypothetical protein  51.72 
 
 
137 aa  130  4e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0566  hypothetical protein  51.72 
 
 
137 aa  131  4e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.946647  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4051  hypothetical protein  54.31 
 
 
137 aa  131  4e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0648  protein of unknown function DUF971  54.31 
 
 
137 aa  130  7e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.887571 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0393  hypothetical protein  53.1 
 
 
123 aa  130  8e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0395  hypothetical protein  53.51 
 
 
125 aa  129  1e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.185206 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66800  hypothetical protein  50.83 
 
 
123 aa  128  2e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2126  hypothetical protein  55.36 
 
 
120 aa  128  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1290  hypothetical protein  52.59 
 
 
137 aa  128  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5142  hypothetical protein  51.3 
 
 
128 aa  127  5e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5792  hypothetical protein  51.67 
 
 
123 aa  127  5e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0648081  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0462  hypothetical protein  52.5 
 
 
125 aa  125  1e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0373  hypothetical protein  50.86 
 
 
137 aa  126  1e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.426487 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4130  hypothetical protein  52.21 
 
 
127 aa  125  1e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  6.31548e-07 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5002  hypothetical protein  52.5 
 
 
125 aa  124  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4876  hypothetical protein  52.5 
 
 
151 aa  124  4e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0440599  normal  0.136179 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0598  hypothetical protein  51.28 
 
 
127 aa  122  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.302332  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0373  hypothetical protein  53.45 
 
 
131 aa  122  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3523  hypothetical protein  52.63 
 
 
128 aa  122  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4164  hypothetical protein  52.63 
 
 
128 aa  122  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3701  hypothetical protein  52.63 
 
 
128 aa  122  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0432  hypothetical protein  55.88 
 
 
128 aa  121  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.620375 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1325  protein of unknown function DUF971  52.25 
 
 
140 aa  121  3e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.887374  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0527  hypothetical protein  52.59 
 
 
128 aa  121  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3783  hypothetical protein  54.39 
 
 
131 aa  121  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0429  hypothetical protein  58.33 
 
 
126 aa  121  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5052  hypothetical protein  51.67 
 
 
125 aa  121  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4431  hypothetical protein  51.75 
 
 
131 aa  121  4e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.690938  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1557  hypothetical protein  50.43 
 
 
117 aa  120  5e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.147587  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3766  hypothetical protein  55.05 
 
 
128 aa  120  5e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  2.39528e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0461  hypothetical protein  52.63 
 
 
128 aa  120  5e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0445  hypothetical protein  52.63 
 
 
128 aa  120  6e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3869  hypothetical protein  52.63 
 
 
128 aa  120  6e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0471  protein of unknown function DUF971  52.63 
 
 
128 aa  120  6e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45400  hypothetical protein  51.3 
 
 
124 aa  118  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.40933  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0528  hypothetical protein  50.88 
 
 
130 aa  117  4e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1386  hypothetical protein  55.05 
 
 
124 aa  117  4e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2649  hypothetical protein  51.72 
 
 
142 aa  117  5e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.265334 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2876  protein of unknown function DUF971  52.68 
 
 
142 aa  117  7e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2230  hypothetical protein  50 
 
 
119 aa  117  7e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3363  hypothetical protein  57.01 
 
 
127 aa  115  1e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1784  hypothetical protein  48.28 
 
 
126 aa  115  2e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.56936  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0949  hypothetical protein  49.11 
 
 
119 aa  115  2e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2773  protein of unknown function DUF971  50 
 
 
142 aa  115  2e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.174226  normal  0.0905596 
 
 
-
 
NC_004310  BR0959  hypothetical protein  49.11 
 
 
119 aa  115  2e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.145353  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3899  hypothetical protein  54.46 
 
 
140 aa  115  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.491521 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6713  protein of unknown function DUF971  50.89 
 
 
124 aa  111  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.919555  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6196  hypothetical protein  48.31 
 
 
124 aa  108  2e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.710102  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1580  hypothetical protein  47.37 
 
 
124 aa  107  8e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.253463  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2074  hypothetical protein  46.49 
 
 
121 aa  106  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.555272  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2940  hypothetical protein  54.95 
 
 
100 aa  105  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2024  protein of unknown function DUF971  49.11 
 
 
124 aa  104  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.09777  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2246  protein of unknown function DUF971  49.11 
 
 
125 aa  103  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.44916 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1632  hypothetical protein  45.13 
 
 
135 aa  98.6  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0464057  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1054  protein of unknown function DUF971  44.64 
 
 
132 aa  97.4  5e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109891 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0978  protein of unknown function DUF971  51.11 
 
 
100 aa  73.9  7e-13  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.039823 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0852  hypothetical protein  51.11 
 
 
100 aa  73.9  7e-13  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4371  hypothetical protein  33.33 
 
 
125 aa  57.4  6e-08  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.854444  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>