More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0067 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_4373  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  71.69 
 
 
443 aa  660  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.611238 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0112  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  71.01 
 
 
443 aa  655  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0374  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  70.14 
 
 
441 aa  637  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.191094  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0067  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  100 
 
 
440 aa  888  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2739  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  70.34 
 
 
444 aa  634  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4491  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  71.46 
 
 
443 aa  657  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4163  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  71.69 
 
 
443 aa  661  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4467  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  71.46 
 
 
443 aa  658  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4793  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  70.56 
 
 
444 aa  651  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  2.60414e-05 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4307  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  71.46 
 
 
443 aa  657  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.114857  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4192  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  69.3 
 
 
443 aa  635  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4430  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  70.36 
 
 
441 aa  638  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.193952  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4423  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  71.46 
 
 
443 aa  657  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4421  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  71.46 
 
 
443 aa  657  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.732607  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0112  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  71.01 
 
 
443 aa  655  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4413  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  71.46 
 
 
443 aa  657  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.137212  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4104  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  71.01 
 
 
443 aa  655  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4087  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  71.69 
 
 
443 aa  661  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5388  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  71.46 
 
 
443 aa  659  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4337  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  71.46 
 
 
443 aa  657  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.321775  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3798  heat shock protein HslVU, ATPase subunit HslU  71.24 
 
 
443 aa  649  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03765  hypothetical protein  71.69 
 
 
443 aa  661  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2015  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  69.61 
 
 
440 aa  637  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.788051  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0165  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  71.69 
 
 
443 aa  653  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0440  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  70.81 
 
 
441 aa  635  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4370  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  68.62 
 
 
443 aa  640  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.347338  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0179  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  71.91 
 
 
443 aa  657  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.763175  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1204  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  76.47 
 
 
442 aa  659  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0113  heat shock protein HslVU, ATPase subunit HslU  70.56 
 
 
443 aa  647  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4042  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  71.24 
 
 
443 aa  654  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4163  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  69.84 
 
 
440 aa  637  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03816  ATP-dependent protease ATP-binding subunit  71.69 
 
 
443 aa  661  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4054  heat shock protein HslVU, ATPase subunit HslU  71.69 
 
 
443 aa  661  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0817  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  70.72 
 
 
443 aa  640  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.544231  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0057  heat shock protein HslVU, ATPase subunit HslU  72.42 
 
 
444 aa  640  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.408482  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0599  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  70.36 
 
 
441 aa  634  1e-180  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0711171  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0115  heat shock protein HslVU, ATPase subunit HslU  69.66 
 
 
444 aa  631  1e-180  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.928834  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3362  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  69 
 
 
441 aa  628  1e-179  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0446  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  68.85 
 
 
442 aa  629  1e-179  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0695  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  69.7 
 
 
441 aa  630  1e-179  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0678  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  69.7 
 
 
441 aa  630  1e-179  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3700  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  69.07 
 
 
442 aa  630  1e-179  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.62855  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0433  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  69.07 
 
 
442 aa  628  1e-179  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.715653 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3522  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  69.07 
 
 
442 aa  630  1e-179  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3765  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  69.68 
 
 
441 aa  630  1e-179  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  2.46667e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0530  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  69 
 
 
441 aa  629  1e-179  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.10008  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3868  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  68.17 
 
 
442 aa  625  1e-178  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0462  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  68.17 
 
 
442 aa  625  1e-178  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0528  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  68.92 
 
 
442 aa  627  1e-178  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45390  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  68.99 
 
 
446 aa  627  1e-178  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3782  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  69.91 
 
 
441 aa  627  1e-178  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.268349  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0472  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  68.17 
 
 
442 aa  625  1e-178  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0168  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  67.19 
 
 
446 aa  622  1e-177  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00723  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  69.44 
 
 
443 aa  622  1e-177  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1542  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  68.02 
 
 
443 aa  622  1e-177  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4129  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  71.66 
 
 
440 aa  618  1e-176  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  8.6324e-07 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001749  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  68.69 
 
 
443 aa  620  1e-176  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.28369  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5001  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  69.13 
 
 
447 aa  619  1e-176  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4875  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  69.13 
 
 
447 aa  619  1e-176  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.129232  normal  0.155967 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2341  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  71.36 
 
 
447 aa  619  1e-176  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.320663  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5141  heat shock protein HslVU, ATPase subunit HslU  69.21 
 
 
445 aa  619  1e-176  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2247  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  68.69 
 
 
443 aa  615  1e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0394  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  68.76 
 
 
445 aa  615  1e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.934917  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0463  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  68.9 
 
 
447 aa  615  1e-175  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5051  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  68.9 
 
 
447 aa  617  1e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2698  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  68.86 
 
 
438 aa  611  1e-174  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.408772  decreased coverage  0.000313907 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0164  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  66.22 
 
 
447 aa  611  1e-174  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121323  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0532  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  69.66 
 
 
446 aa  609  1e-173  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0789  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  67.49 
 
 
445 aa  605  1e-172  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.312061  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0003  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  65.84 
 
 
444 aa  604  1e-172  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.834513 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5791  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  68.16 
 
 
447 aa  604  1e-172  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364939  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3087  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  67.11 
 
 
447 aa  604  1e-171  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0225725 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0204  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  66.89 
 
 
446 aa  602  1e-171  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.337304  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4381  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  65.48 
 
 
448 aa  601  1e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66790  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  67.71 
 
 
447 aa  601  1e-171  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3092  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  66.44 
 
 
447 aa  598  1e-170  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.486059  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0342  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  65.26 
 
 
448 aa  601  1e-170  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0404  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  66.06 
 
 
440 aa  598  1e-170  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0953822  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3001  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  66.44 
 
 
447 aa  599  1e-170  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.259081 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3109  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  66.44 
 
 
447 aa  598  1e-170  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.104887 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6442  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  66.22 
 
 
447 aa  599  1e-170  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.377581  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03516  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  68.4 
 
 
442 aa  600  1e-170  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.63794  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0396  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  69.44 
 
 
445 aa  600  1e-170  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.213827 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2478  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  66.44 
 
 
447 aa  598  1e-170  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0166011  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3139  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  66 
 
 
447 aa  597  1e-169  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0385  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  65.77 
 
 
447 aa  594  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.333539  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2546  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  65.32 
 
 
443 aa  594  1e-169  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2915  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  65.55 
 
 
447 aa  593  1e-168  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.389847  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0190  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  65.55 
 
 
447 aa  593  1e-168  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0200  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  65.55 
 
 
447 aa  593  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.947608  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3433  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  65.55 
 
 
447 aa  593  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0738  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  65.63 
 
 
459 aa  591  1e-168  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2174  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  65.55 
 
 
447 aa  593  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.715778  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0168  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  67.05 
 
 
443 aa  592  1e-168  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3253  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  65.55 
 
 
447 aa  593  1e-168  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.198365  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0132  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  66.82 
 
 
439 aa  590  1e-167  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0500755 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0072  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  66.44 
 
 
447 aa  588  1e-167  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2114  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  66.22 
 
 
465 aa  588  1e-167  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0827  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  65.41 
 
 
459 aa  590  1e-167  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.198289  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3385  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  65.99 
 
 
443 aa  585  1e-166  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>