More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0064 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



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Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 210 aa  429  1e-119  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0765  transcriptional regulator, TetR family protein  59.81 
 
 		 222 aa  263  1e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2638  TetR family transcriptional regulator  55.24 
 
 		 210 aa  254  7e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1527  TetR family transcriptional regulator  61.17 
 
 		 212 aa  248  4e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  55.83 
 
 		 212 aa  238  6.999999999999999e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25370  Transcriptional regulatory protein, TetR  59.52 
 
 		 209 aa  238  6.999999999999999e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2754  regulatory protein, TetR  58.16 
 
 		 219 aa  237  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.396057  normal  0.0231562 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0809  transcriptional regulator, TetR family  57.35 
 
 		 214 aa  237  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18450  transcriptional regulator, TetR family  62.36 
 
 		 179 aa  237  1e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  55.61 
 
 		 213 aa  236  2e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  57.35 
 
 		 211 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  59.04 
 
 		 212 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  59.04 
 
 		 212 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  59.04 
 
 		 212 aa  231  5e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4870  TetR family transcriptional regulator  59.24 
 
 		 186 aa  230  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.318456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  59.57 
 
 		 212 aa  229  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  60.33 
 
 		 186 aa  227  9e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4476  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 220 aa  217  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000182515 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4749  TetR family transcriptional regulator  47.42 
 
 		 207 aa  209  3e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.590058  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0083  TetR family transcriptional regulator  51.98 
 
 		 219 aa  201  7e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.201393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1435  TetR family regulatory protein  51.98 
 
 		 219 aa  201  9e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1674  transcriptional regulator, TetR family  53.4 
 
 		 204 aa  197  1.0000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0730  TetR family transcriptional regulator  45.64 
 
 		 214 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2969  hypothetical protein  58.17 
 
 		 162 aa  185  4e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0448916  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  42.41 
 
 		 196 aa  169  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013440  Hoch_4778  transcriptional regulator, TetR family  46.6 
 
 		 227 aa  165  4e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 215 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  41.36 
 
 		 196 aa  162  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2518  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 221 aa  157  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.382378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 193 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  34.74 
 
 		 198 aa  148  6e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 193 aa  146  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0480  transcriptional regulator, TetR family  34.33 
 
 		 205 aa  122  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  38.64 
 
 		 209 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
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NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  34.41 
 
 		 192 aa  119  3e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0208  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 191 aa  118  7e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0316  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 176 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0187  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 202 aa  114  7.999999999999999e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4681  transcriptional regulator  35.71 
 
 		 196 aa  112  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0962  TetR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53410  transcriptional regulator  35.16 
 
 		 196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.733487  normal  0.037637 
 
 
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NC_007614  Nmul_A1967  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 202 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5089  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 198 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3100  putative transcriptional regulator  35.71 
 
 		 194 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36300  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 194 aa  101  8e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.564712  normal  0.0790295 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4360  regulatory protein TetR  35.33 
 
 		 200 aa  100  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009439  Pmen_0971  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 200 aa  99  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.325702 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1201  transcription regulator protein  34.66 
 
 		 209 aa  97.1  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.871194 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1980  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 206 aa  96.7  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_011094  SeSA_A1534  transcriptional regulator, TetR family  32.6 
 
 		 199 aa  96.7  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.239413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1607  TetR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 199 aa  96.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1547  TetR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 199 aa  96.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.58457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1906  TetR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 199 aa  96.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3076  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 193 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192901  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2231  TetR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 194 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.558633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1737  transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 		 199 aa  95.1  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.151738  n/a   
 
 
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NC_009436  Ent638_1797  TetR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 199 aa  94.4  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0497705  normal  0.0268872 
 
 
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NC_013457  VEA_001314  transcriptional regulator  30.22 
 
 		 199 aa  94.4  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1045  transcriptional regulator, TetR family  32.02 
 
 		 222 aa  93.6  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0016  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 206 aa  93.6  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.951687  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1549  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 199 aa  92.8  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0178403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1014  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 212 aa  92.8  3e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  34.22 
 
 		 196 aa  92.4  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1137  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 209 aa  92  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.13929  normal  0.961099 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2361  transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 		 199 aa  91.7  8e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000141293  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1991  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 199 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000115862  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2475  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 197 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000212819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1726  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 199 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.716564  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 196 aa  90.9  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1860  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 199 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0204447  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1980  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 199 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00264568  hitchhiker  0.00106159 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1841  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 199 aa  90.9  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.170954  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2933  regulatory protein, TetR  30 
 
 		 193 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.316351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0476  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 196 aa  89.7  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.146337 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 193 aa  89.7  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1351  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 212 aa  88.6  7e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1100  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 194 aa  88.2  7e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0669836  normal  0.61487 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 190 aa  88.2  7e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2203  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 206 aa  87.8  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0627793  hitchhiker  0.000036044 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1606  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 206 aa  87  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0686792  normal  0.0717181 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0268  transcriptional regulator, TetR family  32.74 
 
 		 198 aa  86.7  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4221  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 206 aa  85.9  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.360052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4097  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 194 aa  85.9  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5954  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 206 aa  85.1  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.419182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0287  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 200 aa  85.5  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000147212 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3964  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 206 aa  85.1  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4403  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 206 aa  85.1  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.504175 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4102  TetR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 211 aa  84.3  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4292  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 206 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0262  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 198 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000117006 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0378  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 202 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3993  transcriptional regulator, TetR family protein  29.24 
 
 		 194 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000102791  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0264  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 198 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0272  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 198 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010814  Glov_3438  transcriptional regulator, TetR family  29.12 
 
 		 190 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.547681  n/a   
 
 
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NC_009052  Sbal_0272  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 198 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 194 aa  82.4  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
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NC_010159  YpAngola_A2564  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 199 aa  81.6  0.000000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000186036  normal  1 
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_1763  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 199 aa  81.6  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000139552  n/a   
 
 
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NC_010465  YPK_1872  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 199 aa  81.6  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0047199  n/a   
 
 
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