54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0059 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0059  PAAR repeat-containing protein  100 
 
 
99 aa  195  2e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0945  hypothetical protein  45.05 
 
 
176 aa  85.1  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00120455  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3606  PAAR repeat-containing protein  48.28 
 
 
96 aa  84.3  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2560  PAAR repeat-containing protein  50.51 
 
 
174 aa  82.8  1e-15  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.801514  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0034  hypothetical protein  51.85 
 
 
94 aa  80.9  5e-15  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.543283  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4258  PAAR repeat-containing protein  48.28 
 
 
169 aa  78.2  3e-14  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3448  PAAR repeat-containing protein  50 
 
 
88 aa  73.6  9e-13  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.86089  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2662  PAAR repeat-containing protein  51.9 
 
 
323 aa  73.2  1e-12  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3775  helix-turn-helix, AraC type  44.05 
 
 
540 aa  70.9  5e-12  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2184  PAAR repeat-containing protein  48 
 
 
88 aa  69.7  1e-11  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.062242  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0335  phosphomethylpyrimidine kinase  45.78 
 
 
466 aa  69.3  2e-11  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.135685 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0532  PAAR repeat-containing protein  45.12 
 
 
88 aa  63.9  7e-10  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2373  hypothetical protein  44.16 
 
 
94 aa  62.4  2e-09  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2512  PAAR repeat-containing protein  42.7 
 
 
461 aa  62.4  2e-09  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1762  S-type Pyocin domain protein  39.78 
 
 
592 aa  59.7  1e-08  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.842268  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1513  PAAR repeat-containing protein  38.2 
 
 
94 aa  58.9  2e-08  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.462725  normal  0.806121 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1293  PAAR  42.86 
 
 
96 aa  58.2  3e-08  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.455231 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2824  PAAR repeat-containing protein  39.33 
 
 
456 aa  57.4  6e-08  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1157  PAAR repeat-containing protein  40 
 
 
100 aa  57  9e-08  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.811725  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3237  PAAR repeat-containing protein  38.89 
 
 
456 aa  56.6  1e-07  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3257  phospholipase  35.16 
 
 
101 aa  52.8  2e-06  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2589  hypothetical protein  35.96 
 
 
87 aa  51.6  3e-06  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.254981  normal  0.133425 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0211  PAAR repeat-containing protein  37.08 
 
 
93 aa  52  3e-06  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05511  paar motif family  35.87 
 
 
86 aa  51.6  4e-06  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0211513  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2996  hypothetical protein  37.08 
 
 
88 aa  50.4  9e-06  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.401348 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4969  PAAR  37.93 
 
 
102 aa  49.3  2e-05  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2190  PAAR  39.77 
 
 
88 aa  49.3  2e-05  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5509  hypothetical protein  35.56 
 
 
87 aa  48.5  3e-05  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7018  PAAR repeat-containing protein  37.62 
 
 
92 aa  47.8  5e-05  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.893923 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5741  PAAR repeat-containing protein  34.38 
 
 
94 aa  47.4  7e-05  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0643815  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0990  hypothetical protein  40 
 
 
93 aa  46.2  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.880013 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03898  paar motif family  34.12 
 
 
137 aa  45.4  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.356089  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3217  hypothetical protein  35.87 
 
 
90 aa  45.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0242808 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1266  YD repeat-containing protein  35.44 
 
 
1381 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0238  YD repeat-containing protein  35.44 
 
 
1541 aa  44.3  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.691901  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2570  YD repeat-containing protein  35.44 
 
 
1541 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1059  YD repeat-containing protein  35.44 
 
 
1541 aa  44.3  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1322  substrate-binding repeat-containing protein  35.44 
 
 
1541 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0509  YD repeat-containing protein  35.44 
 
 
1541 aa  44.3  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575036  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3483  PAAR repeat-containing protein  38.89 
 
 
92 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.22158  normal  0.485236 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2227  PAAR repeat-containing protein  35.29 
 
 
83 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0798766  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7616  hypothetical protein  31.46 
 
 
86 aa  43.9  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.38657 
 
 
-
 
NC_003296  RS05224  hypothetical protein  36.47 
 
 
88 aa  43.5  0.0009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1832  hypothetical protein  35.06 
 
 
118 aa  43.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.643007 
 
 
-
 
NC_003296  RS00394  hypothetical protein  32.58 
 
 
88 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.33074  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0685  PAAR  38.96 
 
 
379 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1288  PAAR repeat-containing protein  35.96 
 
 
83 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0430607 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3920  PAAR repeat-containing protein  40.45 
 
 
92 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6434  PAAR repeat-containing protein  35.96 
 
 
83 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1677  PAAR repeat-containing protein  38.2 
 
 
91 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.954396  hitchhiker  0.00616072 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0961  hypothetical protein  32.56 
 
 
88 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.915695 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2590  PAAR repeat-containing protein  34.12 
 
 
83 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0281  hypothetical protein  33.73 
 
 
84 aa  41.2  0.005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3756  hypothetical protein  37.93 
 
 
386 aa  40.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.136459  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>