20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0055 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_0055  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  416  9.999999999999999e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0324  hypothetical protein  37.86 
 
 		 228 aa  115  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0397  hypothetical protein  37.86 
 
 		 228 aa  115  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3722  hypothetical protein  39.35 
 
 		 211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1101  type VI secretion-associated protein, family  31.58 
 
 		 240 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1220  type VI secretion-associated protein  31.1 
 
 		 245 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.225071 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1207  hypothetical protein  29.77 
 
 		 208 aa  99.8  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.131804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0236  type VI secretion-associated protein, VC_A0118 family  34.08 
 
 		 247 aa  98.6  6e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0228  type VI secretion-associated protein  34.08 
 
 		 247 aa  98.2  7e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0230  type VI secretion-associated protein  34.08 
 
 		 247 aa  98.2  7e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2518  hypothetical protein  31.94 
 
 		 213 aa  94.7  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.356894  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4073  hypothetical protein  33.51 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000242305  unclonable  0.000000767708 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0019  hypothetical protein  34.62 
 
 		 227 aa  78.6  0.00000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2128  hypothetical protein  29.44 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2625  hypothetical protein  30.46 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0930026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3223  hypothetical protein  29.21 
 
 		 245 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2796  type VI secretion-associated protein, VC_A0118 family  31.65 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3244  type VI secretion-associated protein, VC_A0118 family  33.14 
 
 		 186 aa  62.8  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1081  type VI secretion-associated protein, VC_A0118 family  33.91 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.212059  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6163  hypothetical protein  23.28 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.689253  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>