More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0054 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0054  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  100 
 
 
525 aa  1038  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3723  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  44.87 
 
 
521 aa  380  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.946977  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2519  putative sigma54 specific transcriptional regulator  40.78 
 
 
517 aa  362  1e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.431147  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1206  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  40.86 
 
 
516 aa  349  6e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.628402  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0020  sigma-54 dependent transcriptional regulator  40.76 
 
 
530 aa  340  4e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2797  putative sigma54 specific transcriptional regulator  42.71 
 
 
512 aa  328  1e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0424  Sigma 54 interacting domain protein  43.05 
 
 
533 aa  327  2e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1080  Sigma 54 interacting domain protein  42.04 
 
 
512 aa  309  8e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.171864  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3245  Sigma 54 interacting domain protein  41.11 
 
 
512 aa  308  1e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2692  putative sigma54 specific transcriptional regulator  42.54 
 
 
532 aa  302  1e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.152723  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1613  Sigma 54 interacting domain protein  40.59 
 
 
532 aa  301  3e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4153  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  46.08 
 
 
466 aa  272  9e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.11717 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0173  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  44.75 
 
 
463 aa  266  6e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.127235  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2345  two component signal transduction response regulator  43.9 
 
 
455 aa  265  1e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00459366  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0098  Fis family transcriptional regulator  48.23 
 
 
510 aa  263  8e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3651  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis Family  46.18 
 
 
474 aa  262  1e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.071917  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5108  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  46.3 
 
 
684 aa  261  3e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2041  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  44.34 
 
 
455 aa  258  1e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05873  nitric oxide reductase regulator  38.07 
 
 
542 aa  258  2e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0848  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  48.4 
 
 
437 aa  258  2e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0592297  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03965  two-component system regulatory protein  49.36 
 
 
448 aa  258  2e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1430  acetoacetate metabolism regulatory protein AtoC  43.22 
 
 
461 aa  257  3e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.324678  hitchhiker  0.00137179 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3335  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  43.75 
 
 
458 aa  258  3e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0776  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  43.95 
 
 
454 aa  257  4e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5583  Fis family transcriptional regulator  45.03 
 
 
508 aa  256  6e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.468143  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02106  hypothetical protein  42.11 
 
 
461 aa  256  7e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02147  fused response regulator of ato operon, in two-component system with AtoS: response regulator/sigma54 interaction protein  42.11 
 
 
461 aa  256  7e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2361  acetoacetate metabolism regulatory protein AtoC  42.11 
 
 
461 aa  256  7e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.18992  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1438  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  42.11 
 
 
461 aa  256  7e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.445705  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2369  acetoacetate metabolism regulatory protein AtoC  43.22 
 
 
461 aa  256  8e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0790211  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2158  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  42.99 
 
 
453 aa  254  2e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0508  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  43.83 
 
 
495 aa  254  3e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0172  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  49.84 
 
 
458 aa  253  4e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.833234  hitchhiker  0.00415361 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0608  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  43.77 
 
 
461 aa  253  5e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0447  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  43.77 
 
 
461 aa  253  5e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0710  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  43.47 
 
 
456 aa  253  6e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5424  sigma-54 dependent transcriptional regulator  46.3 
 
 
505 aa  252  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0214  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  40.34 
 
 
455 aa  251  2e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.662344 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2499  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  46.58 
 
 
448 aa  251  3e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0553938  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1320  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  43.19 
 
 
460 aa  251  3e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2412  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  46.58 
 
 
448 aa  250  4e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.408341  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1992  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  44.87 
 
 
460 aa  250  5e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4240  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  47.25 
 
 
469 aa  249  7e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2020  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  46.79 
 
 
466 aa  249  8e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.29433  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0848  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  41.29 
 
 
482 aa  248  1e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.23473  normal  0.837957 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2092  NifA subfamily transcriptional regulator  40.66 
 
 
606 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.103572 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0700  hydrogenase sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  41.29 
 
 
482 aa  248  1e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0621  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  41.38 
 
 
472 aa  248  1e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0516  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  40.44 
 
 
468 aa  249  1e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000971097  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2453  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  45.08 
 
 
461 aa  248  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.96128e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3625  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  44.27 
 
 
449 aa  248  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0498  two component response regulator  48.92 
 
 
451 aa  248  2e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1976  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family protein  42.26 
 
 
438 aa  248  2e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1397  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  42.53 
 
 
458 aa  248  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3251  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  46.47 
 
 
465 aa  247  3e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4373  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  47.25 
 
 
469 aa  247  3e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4396  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  47.25 
 
 
469 aa  247  3e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4152  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  46.37 
 
 
480 aa  247  4e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.038607 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0961  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  43.95 
 
 
454 aa  247  4e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2245  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  44.97 
 
 
460 aa  247  5e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1032  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  46.35 
 
 
461 aa  246  8e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.454426 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0446  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  45.34 
 
 
481 aa  246  8e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000451  transcriptional regulator  41.64 
 
 
543 aa  245  1e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.219758  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0018  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  43.41 
 
 
461 aa  246  1e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.709029  normal  0.924426 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4389  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  45.73 
 
 
495 aa  245  1e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.205713  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2095  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  41.55 
 
 
471 aa  245  1e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3424  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  48.55 
 
 
466 aa  246  1e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.25481 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1258  two component Fis family transcriptional regulator  42.94 
 
 
486 aa  246  1e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1555  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  45.63 
 
 
467 aa  246  1e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.21045  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2500  two component Fis family transcriptional regulator  44.65 
 
 
476 aa  245  2e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2001  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  41.76 
 
 
482 aa  244  2e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2591  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  42.63 
 
 
457 aa  244  2e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.313706  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0417  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  45.34 
 
 
474 aa  245  2e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.45134  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0445  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  45.02 
 
 
481 aa  244  2e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0532  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  44.65 
 
 
470 aa  244  2e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00706375  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2310  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  44.66 
 
 
469 aa  245  2e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.294968  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0962  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  51.69 
 
 
458 aa  244  3e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.277353 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1973  response regulator receiver protein  42.78 
 
 
491 aa  244  3e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2398  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  44.66 
 
 
469 aa  244  3e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.313034  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2312  sigma 54 dependent transcription regulator  39.78 
 
 
493 aa  244  3e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2084  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  39.89 
 
 
477 aa  244  3e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.327808  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4418  transcriptional regulatory protein ZraR  42.39 
 
 
441 aa  244  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.298897  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1635  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  40.63 
 
 
457 aa  244  3e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1129  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  45.02 
 
 
453 aa  244  3e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1017  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  45.19 
 
 
445 aa  244  4e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.246569  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3076  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  44.13 
 
 
454 aa  244  4e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1624  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  43.85 
 
 
561 aa  244  4e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.714408  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6059  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  47.78 
 
 
458 aa  244  4e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0839917 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4418  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  41.59 
 
 
466 aa  244  4e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3592  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  45.14 
 
 
519 aa  244  4e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.312261 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2807  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  40 
 
 
466 aa  243  5e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.75933  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3483  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  47.59 
 
 
455 aa  243  5e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0480061  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2549  sigma-54 dependent transcriptional regulator  44.19 
 
 
509 aa  243  5e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0908365  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51000  Nif-specific sigma54-dependent transcriptional activator protein, NifA  40.69 
 
 
522 aa  243  5e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.519777  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2534  anaerobic nitric oxide reductase transcription regulator  40.69 
 
 
517 aa  243  5e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.847277  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3413  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  43.92 
 
 
453 aa  243  6e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3263  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  42.81 
 
 
464 aa  243  6e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  2.57125e-09 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1013  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  42.09 
 
 
456 aa  243  6e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0616674 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0256  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis Family  40.35 
 
 
490 aa  243  7e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2258  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  44.66 
 
 
468 aa  243  7e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.428008  normal  0.0222917 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>