156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0053 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0053  hypothetical protein  100 
 
 
271 aa  547  1e-155  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3725  hypothetical protein  50.41 
 
 
273 aa  249  3e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364927  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2521  hypothetical protein  50.44 
 
 
261 aa  234  1e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.49989  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0022  hypothetical protein  49.34 
 
 
257 aa  226  3e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.828521  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3247  type IV / VI secretion system protein, DotU family  57.14 
 
 
258 aa  198  9e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2799  type IV / VI secretion system protein, DotU family  57.76 
 
 
258 aa  197  1e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.514043  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1078  type IV / VI secretion system protein, DotU family  55.9 
 
 
258 aa  196  4e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.149197  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1204  hypothetical protein  37.29 
 
 
258 aa  194  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0809723  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1103  Aec26  49.69 
 
 
252 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1222  hypothetical protein  49.69 
 
 
252 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.619966 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0321  hypothetical protein  48.47 
 
 
255 aa  174  1e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0394  hypothetical protein  48.47 
 
 
255 aa  174  1e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0232  hypothetical protein  48.47 
 
 
253 aa  174  2e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3232  hypothetical protein  40.09 
 
 
289 aa  172  4e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0230  hypothetical protein  47.85 
 
 
253 aa  172  4e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2616  hypothetical protein  37.86 
 
 
289 aa  172  4e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0188045 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0238  hypothetical protein  47.24 
 
 
253 aa  170  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2119  hypothetical protein  40.95 
 
 
289 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4081  hypothetical protein  38.7 
 
 
310 aa  168  8e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.767126  hitchhiker  0.000110004 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3385  hypothetical protein  35.8 
 
 
282 aa  155  5e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.373526  normal  0.718715 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2859  hypothetical protein  34.38 
 
 
290 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0486796  normal  0.274768 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0103  hypothetical protein  38.14 
 
 
293 aa  151  9e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42910  hypothetical protein  35.71 
 
 
289 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.386497 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3604  hypothetical protein  35.71 
 
 
289 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2553  hypothetical protein  39.33 
 
 
290 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00740521  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2558  hypothetical protein  36.49 
 
 
282 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.654353  normal  0.0571699 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5578  hypothetical protein  36.96 
 
 
291 aa  149  7e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2372  hypothetical protein  34.51 
 
 
282 aa  147  1e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5419  hypothetical protein  35.9 
 
 
291 aa  145  6e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0447  hypothetical protein  38.35 
 
 
438 aa  141  1e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.554546  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2841  hypothetical protein  38.35 
 
 
438 aa  141  1e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.548037  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2966  hypothetical protein  38.35 
 
 
438 aa  141  1e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1592  hypothetical protein  38.35 
 
 
438 aa  141  1e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1777  hypothetical protein  38.35 
 
 
438 aa  141  1e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0253  hypothetical protein  38.35 
 
 
437 aa  141  1e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1205  hypothetical protein  38.35 
 
 
438 aa  141  1e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.145712  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0398  hypothetical protein  38.35 
 
 
438 aa  141  1e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.344138  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2465  hypothetical protein  34.76 
 
 
413 aa  140  3e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3845  hypothetical protein  34.09 
 
 
443 aa  136  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00641884  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1593  hypothetical protein  36.89 
 
 
440 aa  134  1e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442796  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0515  type IV / VI secretion system protein, DotU family  38.17 
 
 
442 aa  133  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1472  hypothetical protein  32.73 
 
 
452 aa  130  2e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0650495  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2374  OmpA/MotB domain-containing protein  33.04 
 
 
429 aa  129  7e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26720  hypothetical protein  40.68 
 
 
430 aa  127  2e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0212  hypothetical protein  42.95 
 
 
460 aa  125  9e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.468684  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2999  hypothetical protein  35.56 
 
 
406 aa  122  5e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00925  hypothetical protein  42.29 
 
 
449 aa  122  9e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0257059  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05851  hypothetical protein  40.24 
 
 
263 aa  121  1e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1114  putative type VI secretion protein VasF  34.36 
 
 
275 aa  120  2e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000429  ImpK/VasF outer membrane protein  44.7 
 
 
263 aa  120  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0149  hypothetical protein  36.24 
 
 
449 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0371837  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4056  hypothetical protein  39.13 
 
 
460 aa  117  2e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.6515e-06 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1758  IcmH  31.72 
 
 
257 aa  115  8e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0429  hypothetical protein  31.72 
 
 
257 aa  114  2e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00251  OmpA family membrane protein  45.52 
 
 
438 aa  113  3e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000015  Flagellar motor rotation protein MotB  28.38 
 
 
430 aa  110  2e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1523  hypothetical protein  32 
 
 
469 aa  110  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.414466  normal  0.78534 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2317  hypothetical protein  35 
 
 
453 aa  109  6e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0027894  hitchhiker  0.000887894 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7017  hypothetical protein  29.89 
 
 
429 aa  107  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0927  hypothetical protein  30 
 
 
421 aa  105  8e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2189  hypothetical protein  30 
 
 
421 aa  105  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1914  hypothetical protein  30 
 
 
426 aa  105  8e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1214  hypothetical protein  30 
 
 
421 aa  105  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3921  hypothetical protein  33.63 
 
 
431 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0328  hypothetical protein  30.18 
 
 
421 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1690  hypothetical protein  30.18 
 
 
421 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0237  hypothetical protein  30.18 
 
 
421 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0303  hypothetical protein  35.23 
 
 
434 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.459512 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0320  hypothetical protein  35.23 
 
 
434 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.246257  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0308  hypothetical protein  35.23 
 
 
434 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.677173  normal  0.0357421 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0314  hypothetical protein  35.23 
 
 
434 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.497389 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1674  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  31.39 
 
 
415 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.169962  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2088  hypothetical protein  29.57 
 
 
443 aa  97.4  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3484  hypothetical protein  27.69 
 
 
432 aa  95.9  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0805528  normal  0.565487 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1609  hypothetical protein  31.63 
 
 
433 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269396  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0162  hypothetical protein  31.63 
 
 
433 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0139  hypothetical protein  31.63 
 
 
433 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0126  hypothetical protein  31.63 
 
 
433 aa  93.2  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1514  type IV / VI secretion system protein, DotU family  30.1 
 
 
327 aa  92  9e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.568631  normal  0.950361 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2089  OmpA/MotB domain-containing protein  30.36 
 
 
456 aa  90.5  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.975848  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3023  hypothetical protein  34.21 
 
 
434 aa  90.1  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0991  hypothetical protein  27.4 
 
 
434 aa  89  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.441975 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1179  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit B (Asp/Glu-ADT subunit B)  29.94 
 
 
254 aa  89  8e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6678  hypothetical protein  34.81 
 
 
436 aa  88.6  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0935  hypothetical protein  31.01 
 
 
414 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6109  hypothetical protein  26.27 
 
 
447 aa  85.9  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.480365 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2353  type IV / VI secretion system protein, DotU family  28.57 
 
 
494 aa  82.4  8e-15  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.565328 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1484  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  30.49 
 
 
458 aa  77.8  2e-13  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.287067  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1372  OmpA domain-containing protein  30.49 
 
 
458 aa  77.8  2e-13  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6042  OmpA-type porin  34.57 
 
 
511 aa  77.4  2e-13  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3047  type IV / VI secretion system protein, DotU family  31.48 
 
 
489 aa  77  3e-13  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.166638  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3181  hypothetical protein  27.86 
 
 
313 aa  75.1  1e-12  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.117699 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3034  OmpA/MotB  28.26 
 
 
487 aa  72.4  7e-12  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.047877  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1182  putative type VI secretion protein VasF-1  27.08 
 
 
374 aa  72.4  8e-12  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.29093  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1886  hypothetical protein  30.97 
 
 
594 aa  71.6  1e-11  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.419438  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1027  hypothetical protein  29.65 
 
 
560 aa  71.2  2e-11  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2001  hypothetical protein  29.65 
 
 
552 aa  71.2  2e-11  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.66757  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0453  hypothetical protein  29.65 
 
 
571 aa  70.9  2e-11  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0732  hypothetical protein  29.65 
 
 
552 aa  71.2  2e-11  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0245739  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2089  hypothetical protein  29.65 
 
 
571 aa  70.5  3e-11  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0458657  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>