152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0052 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0052  hypothetical protein  100 
 
 
445 aa  887  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.808473  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3726  hypothetical protein  61.12 
 
 
444 aa  555  1e-157  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.529361  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2522  type VI secretion protein  54.83 
 
 
444 aa  522  1e-147  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.711445  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1203  hypothetical protein  52.93 
 
 
444 aa  490  1e-137  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.816844  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1077  type VI secretion protein, VC_A0114 family  55.86 
 
 
445 aa  480  1e-134  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.414986  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3248  type VI secretion protein, VC_A0114 family  55.41 
 
 
445 aa  477  1e-133  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2800  type VI secretion protein, VC_A0114 family  54.95 
 
 
445 aa  473  1e-132  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0393  type VI secretion protein  51.01 
 
 
448 aa  455  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0320  hypothetical protein  51.01 
 
 
448 aa  455  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3231  type VI secretion protein  50.79 
 
 
445 aa  438  1e-122  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2120  hypothetical protein  50.79 
 
 
445 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2617  hypothetical protein  50.79 
 
 
445 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.500578  normal  0.0201893 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4080  hypothetical protein  50.68 
 
 
445 aa  405  1e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365614  hitchhiker  0.000139294 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00940  hypothetical protein  45.27 
 
 
444 aa  385  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0112579  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0150  hypothetical protein  45.17 
 
 
444 aa  386  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0112018  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2318  hypothetical protein  44.59 
 
 
444 aa  383  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0487552  hitchhiker  0.00103904 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2090  hypothetical protein  45.72 
 
 
443 aa  379  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.612247  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0239  hypothetical protein  45.05 
 
 
443 aa  379  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.892408 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0233  hypothetical protein  44.59 
 
 
443 aa  376  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0231  hypothetical protein  44.59 
 
 
443 aa  376  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1104  hypothetical protein  46.17 
 
 
443 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1223  hypothetical protein  46.17 
 
 
443 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.629455 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1524  hypothetical protein  38.57 
 
 
445 aa  352  7e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000430  uncharacterized protein ImpJ/VasE  38.88 
 
 
441 aa  341  2e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.959162  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26730  hypothetical protein  44.37 
 
 
455 aa  340  4e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05852  hypothetical protein  39.33 
 
 
441 aa  338  8e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1594  hypothetical protein  42.79 
 
 
472 aa  332  9e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12244  normal  0.339701 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1591  hypothetical protein  41.85 
 
 
467 aa  330  4e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2967  hypothetical protein  41.85 
 
 
467 aa  330  4e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0397  hypothetical protein  41.85 
 
 
467 aa  330  4e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0991372  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1776  hypothetical protein  41.85 
 
 
467 aa  330  4e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364892  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1207  ImpJ  41.85 
 
 
454 aa  330  4e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.740729  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0446  hypothetical protein  41.85 
 
 
467 aa  330  4e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2842  hypothetical protein  41.63 
 
 
467 aa  329  7e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6043  hypothetical protein  41.18 
 
 
446 aa  328  2e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0252  hypothetical protein  41.76 
 
 
468 aa  327  2e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00252  ImpJ  41.24 
 
 
445 aa  327  3e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3844  type VI secretion protein  39.64 
 
 
444 aa  327  3e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0110826  normal  0.484763 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2998  hypothetical protein  43.99 
 
 
448 aa  323  3e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1471  hypothetical protein  40.99 
 
 
444 aa  320  3e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0560986  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3605  hypothetical protein  38.83 
 
 
443 aa  320  3e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0211  type VI secretion protein, VC_A0114 family  39.09 
 
 
458 aa  319  7e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0514  type VI secretion protein, VC_A0114 family  40.58 
 
 
443 aa  318  1e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42920  hypothetical protein  38.37 
 
 
443 aa  318  1e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.227035 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5579  hypothetical protein  37.47 
 
 
443 aa  315  1e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0102  hypothetical protein  37.98 
 
 
443 aa  314  2e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5420  hypothetical protein  37.25 
 
 
443 aa  311  2e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.957862  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3033  hypothetical protein  40 
 
 
443 aa  309  7e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0153643  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4055  type VI secretion protein  39.46 
 
 
445 aa  300  3e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.69036e-06 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2375  hypothetical protein  35.62 
 
 
442 aa  290  4e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2466  type VI secretion protein, VC_A0114 family  38.41 
 
 
446 aa  286  5e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0024  hypothetical protein  52.77 
 
 
301 aa  285  1e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.668164  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2552  hypothetical protein  38.25 
 
 
432 aa  274  3e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0100062  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1115  putative type VI secretion protein VasE  33.64 
 
 
440 aa  271  2e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1675  type VI secretion protein, VC_A0114 family  35.49 
 
 
447 aa  264  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.88528  hitchhiker  0.0077822 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2354  type VI secretion protein, VC_A0114 family  34.54 
 
 
446 aa  259  6e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.401785 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6110  type VI secretion protein  33.71 
 
 
448 aa  251  3e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.396717 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3046  type VI secretion protein, VC_A0114 family  35.06 
 
 
445 aa  249  5e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00998983  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0161  hypothetical protein  34.38 
 
 
449 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0138  hypothetical protein  34.38 
 
 
452 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1608  hypothetical protein  34.38 
 
 
480 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.25923  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1371  hypothetical protein  32.13 
 
 
449 aa  248  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1483  type VI secretion protein  32.13 
 
 
449 aa  248  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2875  hypothetical protein  32.13 
 
 
449 aa  248  2e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0125  hypothetical protein  33.93 
 
 
480 aa  244  2e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6677  type VI secretion protein  34.15 
 
 
449 aa  244  3e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3024  type VI secretion protein  34.38 
 
 
449 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0302  hypothetical protein  32.21 
 
 
447 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.392469  normal  0.385972 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0313  type VI secretion protein, family  32.21 
 
 
447 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.471816 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0319  type VI secretion protein, family  32.21 
 
 
447 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.329314  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0307  type VI secretion protein  32.21 
 
 
447 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.300554  normal  0.0525484 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0936  type VI secretion protein, VC_A0114 family  32.59 
 
 
447 aa  236  5e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601087  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0984  hypothetical protein  31.18 
 
 
448 aa  229  6e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000014  uncharacterized protein ImpJ/VasE  32.1 
 
 
429 aa  227  3e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2089  putative temperature-dependent protein secretion, ImpJ  33.85 
 
 
448 aa  226  9e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2188  hypothetical protein  32.59 
 
 
448 aa  221  1e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0329  hypothetical protein  33.04 
 
 
448 aa  221  1e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1691  hypothetical protein  33.04 
 
 
448 aa  222  1e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.802444  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0926  hypothetical protein  32.59 
 
 
448 aa  221  1e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0238  hypothetical protein  33.04 
 
 
448 aa  222  1e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1213  hypothetical protein  32.59 
 
 
448 aa  221  1e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1913  hypothetical protein  32.59 
 
 
448 aa  221  1e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3478  hypothetical protein  31.92 
 
 
447 aa  221  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.486884 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3913  type VI secretion protein  31.8 
 
 
416 aa  211  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0023  hypothetical protein  60.13 
 
 
159 aa  211  3e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2451  hypothetical protein  31.03 
 
 
444 aa  201  3e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0187575  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3423  hypothetical protein  30.77 
 
 
451 aa  194  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3552  type VI secretion protein  30.77 
 
 
451 aa  194  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0196523  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3485  hypothetical protein  34.34 
 
 
442 aa  185  2e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.778826  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2088  hypothetical protein  33.56 
 
 
453 aa  173  6e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0852077  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0715  hypothetical protein  33.56 
 
 
453 aa  173  6e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.147759  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0803  hypothetical protein  33.56 
 
 
453 aa  173  6e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.533915  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3129  hypothetical protein  33.18 
 
 
442 aa  173  7e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.000877531  normal  0.24855 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1887  hypothetical protein  33.56 
 
 
453 aa  173  7e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1178  type VI secretion protein  24.72 
 
 
452 aa  161  2e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5264  hypothetical protein  29.31 
 
 
448 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2264  hypothetical protein  28.6 
 
 
448 aa  156  7e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1181  putative type VI secretion protein VasE-1  25.78 
 
 
438 aa  154  3e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.100124  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2933  type VI secretion protein  27.81 
 
 
448 aa  154  3e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.159534  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02042  hypothetical protein  27.73 
 
 
433 aa  152  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>