176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0048 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_2526  type VI secretion protein  55.21 
 
 
588 aa  659  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1199  hypothetical protein  56.14 
 
 
588 aa  662  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.241231  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3730  hypothetical protein  61.36 
 
 
590 aa  733  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0048  hypothetical protein  100 
 
 
587 aa  1186  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0028  hypothetical protein  57.58 
 
 
589 aa  673  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3252  type VI secretion protein, VC_A0110 family  51.87 
 
 
588 aa  613  1e-174  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1073  type VI secretion protein, VC_A0110 family  51.87 
 
 
588 aa  613  1e-174  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.889843  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2804  type VI secretion protein, VC_A0110 family  51.53 
 
 
588 aa  608  1e-172  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0389  type VI secretion protein  49.34 
 
 
606 aa  598  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0316  hypothetical protein  49.34 
 
 
606 aa  598  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4077  hypothetical protein  47.77 
 
 
588 aa  552  1e-156  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0270196  unclonable  1.24343e-06 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3227  type VI secretion protein  46.93 
 
 
588 aa  549  1e-155  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2621  hypothetical protein  46.56 
 
 
588 aa  544  1e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.264727  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2124  hypothetical protein  46.22 
 
 
588 aa  540  1e-152  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.369008  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000438  protein ImpG/VasA  42.3 
 
 
582 aa  490  1e-137  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.877491  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05860  hypothetical protein  42.3 
 
 
582 aa  486  1e-136  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0237  hypothetical protein  42.6 
 
 
616 aa  469  1e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0235  hypothetical protein  42.6 
 
 
616 aa  468  1e-130  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0243  hypothetical protein  42.6 
 
 
616 aa  468  1e-130  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.956418 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1108  type VI secretion protein, family  41.79 
 
 
617 aa  464  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1227  hypothetical protein  41.95 
 
 
617 aa  465  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.366123 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0095  hypothetical protein  41.68 
 
 
596 aa  451  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5586  hypothetical protein  40.99 
 
 
595 aa  444  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2546  hypothetical protein  39.24 
 
 
595 aa  424  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0583684  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3612  hypothetical protein  41.45 
 
 
595 aa  405  1e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.332362  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1121  putative type VI secretion protein VasA  34.18 
 
 
583 aa  359  6e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0138508  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43000  hypothetical protein  38.85 
 
 
526 aa  350  5e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.333671 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0431  hypothetical protein  39.32 
 
 
577 aa  342  1e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5427  hypothetical protein  37.48 
 
 
517 aa  341  2e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2271  hypothetical protein  36.63 
 
 
611 aa  318  2e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3313  hypothetical protein  36.87 
 
 
576 aa  318  2e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3657  type VI secretion protein  33.82 
 
 
604 aa  317  3e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.360075  normal  0.494654 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1211  type VI secretion protein, VC_A0110 family  36.81 
 
 
590 aa  314  3e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3039  type VI secretion protein, VC_A0110 family  35.7 
 
 
590 aa  310  4e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0635  hypothetical protein  35.25 
 
 
606 aa  306  9e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0758526 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2625  hypothetical protein  35.2 
 
 
606 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0740  hypothetical protein  34.86 
 
 
580 aa  301  3e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1677  hypothetical protein  34.86 
 
 
580 aa  301  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2029  hypothetical protein  34.86 
 
 
580 aa  301  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0719  hypothetical protein  34.86 
 
 
580 aa  301  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.133879  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0608  hypothetical protein  34.86 
 
 
580 aa  301  3e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.301701  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0538  hypothetical protein  34.69 
 
 
580 aa  300  7e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2127  hypothetical protein  34.69 
 
 
580 aa  300  7e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5273  hypothetical protein  36.22 
 
 
608 aa  299  9e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3097  hypothetical protein  34.88 
 
 
606 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4956  hypothetical protein  33.98 
 
 
610 aa  297  4e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2767  type VI secretion protein  34.3 
 
 
606 aa  294  3e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399932  normal  0.648894 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2507  type VI secretion protein  34.24 
 
 
606 aa  294  4e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0116993  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0866  hypothetical protein  34.67 
 
 
580 aa  281  3e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.500942  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2818  hypothetical protein  31.73 
 
 
585 aa  280  6e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0198  type VI secretion protein, VC_A0110 family  32.59 
 
 
623 aa  276  6e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3245  type VI secretion protein  34.08 
 
 
589 aa  271  3e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01961  hypothetical protein  35.08 
 
 
616 aa  270  5e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0957236  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1800  hypothetical protein  32 
 
 
584 aa  269  1e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.765675  normal  0.114304 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2587  type VI secretion protein  32.72 
 
 
587 aa  265  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2489  hypothetical protein  32.72 
 
 
587 aa  265  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2993  hypothetical protein  32.55 
 
 
587 aa  264  3e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  decreased coverage  4.48613e-07 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0800  hypothetical protein  32.72 
 
 
587 aa  262  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02049  EvpF  33.66 
 
 
611 aa  263  1e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0842725  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2329  hypothetical protein  33.49 
 
 
619 aa  261  3e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0250142  normal  0.0432073 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0160  hypothetical protein  33.02 
 
 
619 aa  254  2e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4917  type VI secretion protein, VC_A0110 family  33.5 
 
 
612 aa  254  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.263892  hitchhiker  0.00583234 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2831  hypothetical protein  33.12 
 
 
623 aa  254  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.843813  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1196  hypothetical protein  32.96 
 
 
623 aa  253  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1604  hypothetical protein  32.96 
 
 
623 aa  252  2e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1787  hypothetical protein  32.96 
 
 
623 aa  252  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.973782  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0457  hypothetical protein  32.96 
 
 
623 aa  252  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0407  hypothetical protein  32.96 
 
 
623 aa  252  2e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.941773  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2956  hypothetical protein  32.96 
 
 
623 aa  250  4e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1584  hypothetical protein  33.44 
 
 
623 aa  251  4e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468978  normal  0.21502 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01070  hypothetical protein  32.7 
 
 
619 aa  248  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.970936  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2173  hypothetical protein  32.56 
 
 
610 aa  248  3e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0216331  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0449  type VI secretion protein  33.67 
 
 
611 aa  247  5e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.869573 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0471  hypothetical protein  33.67 
 
 
611 aa  247  5e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.056714  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2635  hypothetical protein  33.67 
 
 
611 aa  247  5e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.881877  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0406  type VI secretion protein  33.72 
 
 
611 aa  247  5e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3563  hypothetical protein  33.5 
 
 
611 aa  246  6e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0385  hypothetical protein  33.33 
 
 
611 aa  246  7e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0262  hypothetical protein  32.49 
 
 
623 aa  245  1e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2926  type VI secretion protein  33.66 
 
 
611 aa  246  1e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3076  hypothetical protein  32.19 
 
 
605 aa  245  1e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00261  SciC protein  31.97 
 
 
625 aa  245  2e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.527979  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2960  hypothetical protein  32.78 
 
 
612 aa  243  5e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3631  hypothetical protein  33 
 
 
612 aa  240  4e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3656  hypothetical protein  33 
 
 
612 aa  240  5e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0056  hypothetical protein  33 
 
 
612 aa  240  5e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3640  hypothetical protein  33 
 
 
612 aa  240  5e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36511  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1711  hypothetical protein  33 
 
 
612 aa  240  5e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26630  hypothetical protein  32.96 
 
 
620 aa  239  9e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.268806  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3011  hypothetical protein  30.9 
 
 
628 aa  236  1e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.548541  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1480  hypothetical protein  30.43 
 
 
624 aa  234  5e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6046  hypothetical protein  31.86 
 
 
593 aa  234  5e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.739276  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0527  type VI secretion protein, VC_A0110 family  31.58 
 
 
630 aa  233  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4086  type VI secretion protein  32.03 
 
 
638 aa  232  1e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.36966e-08 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3030  hypothetical protein  32.03 
 
 
592 aa  232  1e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.104636  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5982  type VI secretion protein  32.12 
 
 
589 aa  230  4e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50840  hypothetical protein  32.63 
 
 
597 aa  225  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.232659  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1729  hypothetical protein  31.67 
 
 
586 aa  224  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.162099  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3859  type VI secretion protein  30.46 
 
 
624 aa  224  3e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353527  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2892  hypothetical protein  32.02 
 
 
597 aa  223  6e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>