54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0047 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0047  hypothetical protein  100 
 
 
142 aa  285  1e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3731  hypothetical protein  49.23 
 
 
145 aa  125  2e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3253  type VI secretion system lysozyme-related protein  41.73 
 
 
143 aa  103  7e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1072  type VI secretion system lysozyme-related protein  41.73 
 
 
143 aa  103  8e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2805  type VI secretion system lysozyme-related protein  40.29 
 
 
143 aa  97.1  8e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2527  type VI secretion system lysozyme-related protein  38.52 
 
 
141 aa  96.3  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0388  type VI secretion system lysozyme-related protein  38.62 
 
 
146 aa  95.1  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3903  hypothetical protein  38.62 
 
 
146 aa  95.1  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0315  hypothetical protein  38.62 
 
 
146 aa  95.1  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1198  GPW/gp25 family protein  36.3 
 
 
145 aa  93.6  8e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.308622  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0029  hypothetical protein  40.44 
 
 
141 aa  89.4  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.475972  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000439  hypothetical protein  33.33 
 
 
136 aa  71.2  5e-12  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.319963  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05861  hypothetical protein  33.33 
 
 
136 aa  70.9  6e-12  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3312  hypothetical protein  37.07 
 
 
136 aa  68.6  3e-11  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0236  hypothetical protein  35.19 
 
 
137 aa  64.7  4e-10  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0238  hypothetical protein  35.19 
 
 
137 aa  64.7  4e-10  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1109  type VI secretion system lysozyme-related protein  30.5 
 
 
138 aa  64.7  4e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0244  hypothetical protein  32.87 
 
 
137 aa  64.3  5e-10  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1228  hypothetical protein  30.5 
 
 
138 aa  63.9  6e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.225537 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0430  tail lysozyme, putative  35.34 
 
 
135 aa  63.5  1e-09  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1122  putative type VI secretion protein VasS  34.91 
 
 
141 aa  60.5  8e-09  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.111003  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3226  type VI secretion system lysozyme-related protein  31.73 
 
 
136 aa  57.8  6e-08  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0092  GPW/gp25 family protein  36.04 
 
 
142 aa  56.6  1e-07  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2622  hypothetical protein  30.77 
 
 
136 aa  55.5  2e-07  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2125  GPW/gp25 family protein  30.77 
 
 
136 aa  54.7  4e-07  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.718172  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4076  hypothetical protein  29.81 
 
 
136 aa  53.5  9e-07  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000287373  unclonable  7.59929e-07 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50830  hypothetical protein  31.4 
 
 
150 aa  52.8  2e-06  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0626343  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0741  hypothetical protein  34.45 
 
 
153 aa  50.1  1e-05  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.228212  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0607  hypothetical protein  34.45 
 
 
153 aa  50.1  1e-05  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0718  hypothetical protein  34.45 
 
 
153 aa  50.1  1e-05  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.236426  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1676  hypothetical protein  34.45 
 
 
153 aa  50.1  1e-05  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0537  hypothetical protein  36 
 
 
153 aa  49.3  2e-05  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2126  hypothetical protein  36 
 
 
153 aa  49.3  2e-05  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.753195  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2028  hypothetical protein  36 
 
 
153 aa  49.3  2e-05  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5593  hypothetical protein  32.73 
 
 
135 aa  48.1  4e-05  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3613  hypothetical protein  29.03 
 
 
135 aa  48.1  4e-05  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.231309  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5431  hypothetical protein  31.19 
 
 
135 aa  48.1  4e-05  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2545  hypothetical protein  33.33 
 
 
135 aa  48.1  5e-05  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0298259  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43020  hypothetical protein  30.28 
 
 
135 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.434691 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3134  hypothetical protein  30.09 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34020  hypothetical protein  33.93 
 
 
141 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.311323  normal  0.0827701 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2270  hypothetical protein  26.79 
 
 
160 aa  43.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0020  hypothetical protein  23.97 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.845021  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2893  hypothetical protein  32.86 
 
 
141 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2365  hypothetical protein  32.04 
 
 
154 aa  42.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0867  hypothetical protein  30.63 
 
 
158 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02048  hypothetical protein  28.78 
 
 
162 aa  40.8  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.103916  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0470  hypothetical protein  28.7 
 
 
161 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000139842  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0448  type VI secretion system lysozyme-related protein  28.7 
 
 
161 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.42159  normal  0.655562 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3562  hypothetical protein  28.7 
 
 
161 aa  40.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.132433  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2636  hypothetical protein  28.7 
 
 
161 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0433868  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1803  GPW/gp25 family protein  27.73 
 
 
149 aa  40.4  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200889  normal  0.04666 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4916  type VI secretion system lysozyme-related protein  31.08 
 
 
159 aa  40  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00677472  decreased coverage  0.00161069 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2961  hypothetical protein  32.43 
 
 
160 aa  40  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>