140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0045 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0045  hypothetical protein  100 
 
 
169 aa  333  5e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3733  hypothetical protein  64.56 
 
 
165 aa  213  7e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2807  type VI secretion protein, VC_A0107 family  66.46 
 
 
167 aa  213  7e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1070  type VI secretion protein, VC_A0107 family  64.63 
 
 
167 aa  209  1e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.533436  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3255  type VI secretion protein, VC_A0107 family  64.63 
 
 
167 aa  207  4e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0313  hypothetical protein  65.61 
 
 
165 aa  206  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3905  hypothetical protein  65.61 
 
 
165 aa  206  1e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0386  type VI secretion protein  65.61 
 
 
165 aa  206  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2529  type VI secretion protein  59.01 
 
 
162 aa  202  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1196  hypothetical protein  62.11 
 
 
166 aa  198  3e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0239  hypothetical protein  56.25 
 
 
166 aa  181  3e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0241  hypothetical protein  56.25 
 
 
166 aa  181  3e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0247  hypothetical protein  55 
 
 
166 aa  180  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.788284 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2127  hypothetical protein  53.01 
 
 
167 aa  176  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2624  hypothetical protein  53.01 
 
 
167 aa  175  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.799752  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3224  type VI secretion protein  53.05 
 
 
167 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05863  hypothetical protein  53.16 
 
 
168 aa  172  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000441  uncharacterized protein ImpB  53.16 
 
 
168 aa  172  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1231  type VI secretion protein  53.42 
 
 
167 aa  170  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.137782 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1111  type VI secretion protein, family  53.42 
 
 
167 aa  170  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1124  putative type VI secretion protein VasQ  49.7 
 
 
164 aa  166  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4074  hypothetical protein  52.56 
 
 
167 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000649214  unclonable  0.000000799186 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0278  hypothetical protein  49.37 
 
 
162 aa  161  4.0000000000000004e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0090  hypothetical protein  50.63 
 
 
168 aa  160  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2543  hypothetical protein  48.73 
 
 
166 aa  159  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0150995  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0870  hypothetical protein  50.62 
 
 
164 aa  158  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5595  hypothetical protein  50.63 
 
 
167 aa  157  5e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0744  hypothetical protein  48.75 
 
 
164 aa  156  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0196457  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0533  hypothetical protein  48.75 
 
 
164 aa  156  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.56183  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0604  hypothetical protein  48.75 
 
 
164 aa  156  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0715  hypothetical protein  48.75 
 
 
164 aa  156  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.750715  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2123  hypothetical protein  48.75 
 
 
164 aa  156  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2025  hypothetical protein  48.75 
 
 
164 aa  156  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.393017  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1672  hypothetical protein  48.75 
 
 
164 aa  156  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.873681  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43040  hypothetical protein  47.02 
 
 
168 aa  155  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.138878 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3615  hypothetical protein  47.31 
 
 
168 aa  155  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.668584  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5433  hypothetical protein  50.31 
 
 
168 aa  154  4e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3172  hypothetical protein  49.69 
 
 
161 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1181  type VI secretion protein  46.15 
 
 
161 aa  144  7.0000000000000006e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0011  hypothetical protein  46.79 
 
 
168 aa  135  3.0000000000000003e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0777  hypothetical protein  42.67 
 
 
166 aa  121  6e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2600  type VI secretion protein  43.33 
 
 
166 aa  120  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0798  type VI secretion protein  43.33 
 
 
166 aa  120  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.153288  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0726  hypothetical protein  43.33 
 
 
166 aa  120  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2511  hypothetical protein  43.33 
 
 
166 aa  120  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2978  hypothetical protein  43.33 
 
 
166 aa  120  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000439438 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5266  hypothetical protein  45.75 
 
 
168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3649  type VI secretion protein  42.86 
 
 
170 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.629046 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0176  hypothetical protein  42.67 
 
 
166 aa  117  6e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.026937  hitchhiker  0.000000135076 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0625  hypothetical protein  42.21 
 
 
171 aa  114  6e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0562318 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1783  hypothetical protein  42 
 
 
165 aa  114  8.999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.309687  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0031  hypothetical protein  61.62 
 
 
103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.841066  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3123  hypothetical protein  37.74 
 
 
166 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.489353  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2916  hypothetical protein  38.67 
 
 
165 aa  109  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.318874 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2814  hypothetical protein  35 
 
 
175 aa  107  6e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3261  type VI secretion protein  37.34 
 
 
167 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.30542  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0032  hypothetical protein  68.97 
 
 
58 aa  90.5  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.865838  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0161  hypothetical protein  31.37 
 
 
200 aa  85.9  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.535252  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2268  hypothetical protein  33.95 
 
 
177 aa  79.3  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.923124  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1171  putative type VI secretion protein VasQ-1  32.3 
 
 
169 aa  77.4  0.00000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.242549  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3025  hypothetical protein  33.33 
 
 
167 aa  77  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0474697  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6051  hypothetical protein  32.67 
 
 
171 aa  73.9  0.0000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3073  hypothetical protein  32.21 
 
 
168 aa  71.6  0.000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.747125  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3100  hypothetical protein  32.3 
 
 
191 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.310088  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2369  hypothetical protein  32.21 
 
 
166 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2622  hypothetical protein  32.3 
 
 
179 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4953  hypothetical protein  32.45 
 
 
177 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2764  type VI secretion protein  32.45 
 
 
179 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0599499  normal  0.364663 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02045  EvpA  35.51 
 
 
166 aa  68.6  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.792135  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2510  type VI secretion protein  31.79 
 
 
177 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.203105  normal  0.816356 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1733  hypothetical protein  34.81 
 
 
182 aa  68.2  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.541869  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0402  type VI secretion protein  34.38 
 
 
171 aa  67.4  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000194603  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3559  hypothetical protein  34.38 
 
 
171 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00132458  normal  0.648001 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2639  hypothetical protein  34.38 
 
 
171 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00139416  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0381  hypothetical protein  34.38 
 
 
171 aa  67.4  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00433333  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0467  hypothetical protein  34.38 
 
 
171 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00157357  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0445  type VI secretion protein  34.38 
 
 
171 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.493585  normal  0.482575 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3477  hypothetical protein  31.68 
 
 
176 aa  67  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.772504  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3043  type VI secretion protein, VC_A0107 family  36.42 
 
 
176 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3121  hypothetical protein  34.16 
 
 
176 aa  66.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.241786  normal  0.0428701 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000020  uncharacterized protein ImpB  30.87 
 
 
176 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.100303  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2443  hypothetical protein  30.72 
 
 
180 aa  65.1  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.485859  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2964  EvpA  34.44 
 
 
172 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1207  type VI secretion protein, VC_A0107 family  35.19 
 
 
176 aa  63.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3645  EvpA  34.87 
 
 
172 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0328511  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3635  hypothetical protein  34.87 
 
 
172 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0300878  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3660  hypothetical protein  34.87 
 
 
172 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.471211  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2177  hypothetical protein  35.46 
 
 
170 aa  62  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000024001  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3041  type VI secretion protein, VC_A0107 family  33.54 
 
 
178 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2930  type VI secretion protein  33.12 
 
 
171 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00592536  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1529  hypothetical protein  33.91 
 
 
167 aa  60.1  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5978  type VI secretion protein  31.45 
 
 
190 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.332632  normal  0.785874 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2360  type VI secretion protein, VC_A0107 family  33.61 
 
 
183 aa  59.7  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109575 
 
 
-
 
NC_003296  RS01965  hypothetical protein  31.62 
 
 
170 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.380992  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3406  hypothetical protein  31.62 
 
 
180 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4913  type VI secretion protein, VC_A0107 family  35.04 
 
 
182 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468167  normal  0.0151327 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50800  hypothetical protein  32.85 
 
 
187 aa  56.2  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34070  hypothetical protein  30.88 
 
 
181 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0502886  normal  0.0617525 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2896  hypothetical protein  30.88 
 
 
181 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2095  putative cytoplasmic protein  31.16 
 
 
182 aa  53.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>