183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0035 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  100 
 
 
73 aa  145  2e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3147  thiamine biosynthesis protein ThiS  57.58 
 
 
66 aa  80.1  8e-15  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.054012  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3235  thiamine biosynthesis protein ThiS  60.61 
 
 
66 aa  80.5  8e-15  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.320513  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3504  thiamine biosynthesis protein ThiS  60.61 
 
 
66 aa  79.7  1e-14  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169395  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2465  thiamine biosynthesis protein ThiS  58.82 
 
 
68 aa  72.4  2e-12  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04970  sulfur carrier protein ThiS  53.03 
 
 
66 aa  69.7  1e-11  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0479  sulfur carrier protein ThiS  53.03 
 
 
66 aa  69.7  1e-11  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738565  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4741  sulfur carrier protein ThiS  56.06 
 
 
66 aa  68.9  2e-11  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.243463 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02970  thiamine biosynthesis protein ThiS  56.06 
 
 
66 aa  68.9  2e-11  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0360  sulfur carrier protein ThiS  53.03 
 
 
66 aa  68.2  4e-11  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.18682  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2400  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.95 
 
 
74 aa  68.2  4e-11  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5105  sulfur carrier protein ThiS  53.03 
 
 
92 aa  68.2  4e-11  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.205609  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5155  sulfur carrier protein ThiS  53.03 
 
 
66 aa  68.2  4e-11  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404683  normal  0.862246 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4978  sulfur carrier protein ThiS  53.03 
 
 
66 aa  68.2  4e-11  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.94 
 
 
66 aa  66.2  1e-10  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91579  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5331  sulfur carrier protein ThiS  54.55 
 
 
71 aa  66.6  1e-10  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.883696  normal  0.241111 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4168  thiamine biosynthesis protein ThiS  53.03 
 
 
66 aa  66.6  1e-10  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852753  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1077  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  48.48 
 
 
326 aa  66.2  1e-10  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129832  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3474  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.45 
 
 
66 aa  65.5  2e-10  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0252712  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1345  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.45 
 
 
66 aa  65.9  2e-10  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1633  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  48.48 
 
 
347 aa  65.5  2e-10  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0433  thiamine biosynthesis protein ThiS  53.03 
 
 
66 aa  64.3  5e-10  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4701  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  43.84 
 
 
374 aa  62  2e-09  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468322  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2098  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.37 
 
 
76 aa  62.4  2e-09  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.219145  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0792  thiamine biosynthesis protein ThiS  50 
 
 
66 aa  62  3e-09  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.464856  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0642  thiamine biosynthesis protein ThiS  50 
 
 
66 aa  62  3e-09  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3189  sulfur carrier protein ThiS  51.52 
 
 
66 aa  60.5  7e-09  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580772  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2933  ThiS, thiamine-biosynthesis  44.12 
 
 
98 aa  59.7  1e-08  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0004662  hitchhiker  3.85019e-16 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0044  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.62 
 
 
72 aa  59.3  2e-08  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.164239  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1268  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.94 
 
 
67 aa  59.3  2e-08  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0448831  hitchhiker  0.00213488 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2062  sulfur carrier protein ThiS  42.47 
 
 
98 aa  58.2  4e-08  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1984  sulfur carrier protein ThiS  42.47 
 
 
93 aa  57.4  6e-08  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0093  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 
66 aa  57  9e-08  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.704796  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2567  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 
66 aa  57  1e-07  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.823918  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0777  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 
66 aa  56.2  1e-07  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1317  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 
66 aa  56.2  1e-07  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0610  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 
67 aa  56.6  1e-07  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00214937  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2522  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.36 
 
 
77 aa  55.8  2e-07  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01842  sulfur carrier protein ThiS  43.94 
 
 
66 aa  55.5  2e-07  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4103  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.31 
 
 
90 aa  56.2  2e-07  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.189024  decreased coverage  0.00486776 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0071  thiamine biosynthesis protein ThiS  55.32 
 
 
162 aa  55.5  2e-07  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.290426  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2136  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.84 
 
 
73 aa  55.8  2e-07  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1554  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.81 
 
 
211 aa  55.1  3e-07  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.636206  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2638  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.79 
 
 
68 aa  55.1  3e-07  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1142  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.18 
 
 
68 aa  55.1  3e-07  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3862  ThiS, thiamine-biosynthesis  36.36 
 
 
67 aa  54.7  4e-07  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0818304  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0452  sulfur carrier protein ThiS  36.23 
 
 
71 aa  53.9  8e-07  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  1.34216e-07 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0344  sulfur carrier protein ThiS  36.23 
 
 
71 aa  53.9  8e-07  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1455  hypothetical protein  31.94 
 
 
75 aa  53.9  8e-07  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.282408  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0589  hypothetical protein  36.36 
 
 
65 aa  53.5  9e-07  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.519327  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3289  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 
66 aa  53.5  1e-06  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425824  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3718  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 
66 aa  53.1  1e-06  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.827217  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0726  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 
66 aa  53.1  1e-06  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00139474  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1262  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.33 
 
 
67 aa  53.1  1e-06  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2519  thiamine biosynthesis protein ThiS  48.48 
 
 
66 aa  53.1  1e-06  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1773  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.29 
 
 
72 aa  52.4  2e-06  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6223  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 
65 aa  52.8  2e-06  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392752  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2127  thiamine-biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 
67 aa  52.8  2e-06  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1334  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.97 
 
 
66 aa  52  3e-06  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0203428  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5046  hypothetical protein  36.23 
 
 
70 aa  52  3e-06  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.461936  normal  0.383391 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2458  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 
66 aa  52  3e-06  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4065  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 
67 aa  52  3e-06  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.58887  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0217  sulfur carrier protein ThiS  37.88 
 
 
66 aa  51.6  3e-06  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1432  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.97 
 
 
66 aa  52  3e-06  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0567426  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4439  sulfur carrier protein ThiS  37.88 
 
 
66 aa  51.6  4e-06  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000189024 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2482  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 
66 aa  51.2  4e-06  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.116747  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3658  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 
67 aa  50.8  6e-06  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5998  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.89 
 
 
81 aa  50.8  6e-06  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.786244 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1915  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 
66 aa  50.8  6e-06  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0010  thiamine biosynthesis protein ThiS  48.48 
 
 
65 aa  50.8  6e-06  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.209764 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0667  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 
75 aa  50.8  6e-06  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.20728e-26 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1153  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.55 
 
 
68 aa  50.4  8e-06  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0612  sulfur carrier protein ThiS  37.31 
 
 
67 aa  50.1  9e-06  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2432  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  37.88 
 
 
329 aa  50.1  9e-06  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.129281  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2907  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.33 
 
 
75 aa  50.1  9e-06  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2584  hypothetical protein  31.88 
 
 
80 aa  49.7  1e-05  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0963  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.08 
 
 
68 aa  50.1  1e-05  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0620  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.84 
 
 
67 aa  49.7  1e-05  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1339  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 
66 aa  49.7  1e-05  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0038066 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4225  sulfur carrier protein ThiS  37.88 
 
 
66 aa  48.9  2e-05  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4533  sulfur carrier protein ThiS  37.88 
 
 
66 aa  48.9  2e-05  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2892  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 
65 aa  49.3  2e-05  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.502448  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4003  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 
66 aa  48.9  2e-05  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03821  hypothetical protein  37.88 
 
 
66 aa  48.9  2e-05  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4034  sulfur carrier protein ThiS  37.88 
 
 
66 aa  48.9  2e-05  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00848806 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4093  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 
65 aa  49.3  2e-05  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00467775  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0801  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 
66 aa  48.9  2e-05  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03868  sulfur carrier protein ThiS  37.88 
 
 
66 aa  48.9  2e-05  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0654  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 
75 aa  49.3  2e-05  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0130451  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4482  sulfur carrier protein ThiS  37.88 
 
 
66 aa  48.9  2e-05  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5459  sulfur carrier protein ThiS  37.88 
 
 
66 aa  48.5  3e-05  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.179752 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1058  hypothetical protein  34.78 
 
 
70 aa  48.5  3e-05  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000643593  normal  0.078632 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0213  sulfur carrier protein ThiS  36.36 
 
 
66 aa  47.8  5e-05  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0877  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 
65 aa  47.8  5e-05  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0304024  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0281  sulfur carrier protein ThiS  34.85 
 
 
66 aa  47.8  5e-05  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00415569 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0146  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.36 
 
 
69 aa  47.8  6e-05  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0774  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.71 
 
 
68 aa  47.4  7e-05  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.176558 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2465  ThiS, thiamine-biosynthesis  37.88 
 
 
65 aa  47.4  7e-05  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.637315  normal  0.928732 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2683  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.94 
 
 
75 aa  47.4  7e-05  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.809629  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3433  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.94 
 
 
75 aa  47.4  7e-05  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>