More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0029 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
320 aa  649  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0390  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.6 
 
 
320 aa  307  1e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0332  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.96 
 
 
314 aa  305  7e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2332  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.75 
 
 
320 aa  294  2e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.665439  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0963  male sterility protein  47.69 
 
 
338 aa  275  6e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1078  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.69 
 
 
338 aa  275  6e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0087  putative NADH-ubiquinone oxidoreductase protein  48.82 
 
 
334 aa  275  9e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4134  NAD-dependent epimerase/dehydratase:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase:NmrA-like  45.96 
 
 
320 aa  268  1e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0701  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.42 
 
 
318 aa  259  6e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3028  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.71 
 
 
319 aa  256  4e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.563899 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2454  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.63 
 
 
320 aa  250  3e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3663  NADH dehydrogenase  46.84 
 
 
334 aa  249  4e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6380  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.77 
 
 
319 aa  249  4e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.851831  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3340  NADH dehydrogenase  46.52 
 
 
334 aa  248  7e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3078  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.28 
 
 
319 aa  245  8e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3052  NADH dehydrogenase  44.03 
 
 
319 aa  244  2e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0275567 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2419  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.03 
 
 
319 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3033  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.03 
 
 
319 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2944  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  44.97 
 
 
319 aa  240  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal  0.557805 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2361  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  42.77 
 
 
345 aa  239  3e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.252137 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3737  NADH dehydrogenase  42.55 
 
 
317 aa  237  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.288709  normal  0.886457 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0199  hypothetical protein  42.55 
 
 
317 aa  236  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2899  NADH dehydrogenase  42.72 
 
 
318 aa  230  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328837  normal  0.117785 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2450  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.98 
 
 
312 aa  230  3e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.95 
 
 
318 aa  229  4e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.826321  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3910  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.37 
 
 
318 aa  226  6e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.835741  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2260  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.95 
 
 
321 aa  224  2e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  2.70425e-05 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0177  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.12 
 
 
340 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.440205 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0234  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putative  42.72 
 
 
319 aa  220  3e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2107  putative NADH-ubiquinone oxidoreductase  44.27 
 
 
319 aa  219  6e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3363  putative NADH-ubiquinone oxidoreductase  44.27 
 
 
319 aa  219  6e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2985  putative NADH-ubiquinone oxidoreductase  44.27 
 
 
319 aa  219  6e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0270  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  44.27 
 
 
319 aa  219  6e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0455  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  44.27 
 
 
319 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0220  NAD-dependent epimerase/dehydratase:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  39.83 
 
 
340 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0593  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.61 
 
 
316 aa  216  4e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.490453  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0258  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  45.1 
 
 
320 aa  215  8e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.3276  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3315  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putative  44.3 
 
 
312 aa  213  3e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3296  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  44.1 
 
 
316 aa  213  5e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.587332  normal  0.308743 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1998  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.41 
 
 
302 aa  208  1e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2690  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.87 
 
 
319 aa  202  4e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0110  NADH dehydrogenase  39.21 
 
 
321 aa  190  3e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120981 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.35 
 
 
381 aa  180  3e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0842718  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0755  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  36.56 
 
 
389 aa  171  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0016  3-beta-hydroxy-delta(5)-steroid dehydrogenase  35.38 
 
 
340 aa  169  8e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1318  NADH dehydrogenase  36.09 
 
 
389 aa  167  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.131603 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1713  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.09 
 
 
229 aa  166  3e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1007  NADH dehydrogenase  36.25 
 
 
389 aa  166  6e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0197  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.16 
 
 
321 aa  164  2e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0246  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  35.91 
 
 
327 aa  162  9e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.53 
 
 
321 aa  161  1e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  normal  0.481083 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1049  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  35.54 
 
 
412 aa  159  5e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3590  ubiquinone dependent NADH dehydrogenase  35.56 
 
 
327 aa  155  6e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.885976  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2820  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  34.15 
 
 
329 aa  156  6e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0203208  normal  0.613644 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1691  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  36.19 
 
 
328 aa  155  7e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0053937  hitchhiker  6.12217e-07 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1340  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.08 
 
 
328 aa  154  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112176  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2776  NADH dehydrogenase  35.33 
 
 
328 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.424947  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1041  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putative  31.75 
 
 
328 aa  153  4e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0980  putative NADH-ubiquinone oxidoreductase  31.75 
 
 
328 aa  153  4e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.687755  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0332  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  33.87 
 
 
307 aa  152  8e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.171865  normal  0.33471 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.45 
 
 
294 aa  152  9e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.26 
 
 
309 aa  152  9e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0783672  hitchhiker  3.70596e-05 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0437  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.65 
 
 
349 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2136  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  35.14 
 
 
312 aa  150  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.14 
 
 
309 aa  149  7e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.760567  normal  0.885082 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0046  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  34.07 
 
 
321 aa  149  9e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.04 
 
 
308 aa  147  2e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1308  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  32.04 
 
 
336 aa  146  4e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1129  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putative  28.66 
 
 
316 aa  146  5e-34  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2812  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.95 
 
 
328 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.626398  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2240  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  35.06 
 
 
381 aa  144  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167528  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1151  NADH-ubiquinone oxidoreductase  34.95 
 
 
328 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.46 
 
 
295 aa  144  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.23 
 
 
295 aa  143  4e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4953  NADH dehydrogenase  34.8 
 
 
318 aa  142  6e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.575257  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0173  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.96 
 
 
321 aa  141  2e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3602  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.75 
 
 
323 aa  140  2e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.692612  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.9 
 
 
298 aa  140  4e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0184  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.35 
 
 
296 aa  139  5e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4586  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.49 
 
 
326 aa  139  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.126896 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.58 
 
 
294 aa  138  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0152  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  32.84 
 
 
335 aa  137  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.274944 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4323  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.18 
 
 
326 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0063  putative NADH-ubiquinone oxidoreductase,-like protein  28.1 
 
 
320 aa  137  2e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.34 
 
 
299 aa  137  3e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.932671  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0492  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.53 
 
 
330 aa  136  4e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0166  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.6 
 
 
353 aa  136  4e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3081  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.29 
 
 
310 aa  136  5e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.62 
 
 
291 aa  135  8e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0660  dehydrogenase  32.39 
 
 
321 aa  135  9e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.173269 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.78 
 
 
306 aa  135  1e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217032  normal  0.873139 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1668  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  34.74 
 
 
316 aa  135  1e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0183  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.72 
 
 
322 aa  133  3e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.922509  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0107  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.46 
 
 
308 aa  132  6e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0380  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.5 
 
 
294 aa  132  9e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.270994  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0224  hypothetical protein  33.44 
 
 
322 aa  132  1e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.362913  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3538  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  30.77 
 
 
326 aa  131  2e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0385  NADH dehydrogenase subunit, putative  32.81 
 
 
294 aa  128  1e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.34 
 
 
298 aa  127  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.86 
 
 
309 aa  126  5e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>