More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0028 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0028  hypothetical protein  100 
 
 
269 aa  495  1e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04440  putative permease  49.43 
 
 
267 aa  227  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0433  hypothetical protein  49.81 
 
 
260 aa  225  7e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0394251  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5375  hypothetical protein  49.81 
 
 
260 aa  224  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0023  hypothetical protein  49.81 
 
 
294 aa  222  5e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  48.47 
 
 
260 aa  216  3e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5050  hypothetical protein  47.71 
 
 
260 aa  213  2e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0848  transmembrane protein  46.55 
 
 
274 aa  213  2e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.57519 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48190  hypothetical protein  52.87 
 
 
260 aa  213  2e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627972  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5143  hypothetical protein  47.71 
 
 
260 aa  213  2e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  47.71 
 
 
260 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0904  hypothetical protein  46.3 
 
 
298 aa  211  1e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.468335  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2279  hypothetical protein  45.99 
 
 
273 aa  209  5e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.705159  normal  0.384237 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0466  hypothetical protein  48.65 
 
 
270 aa  207  2e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1556  protein of unknown function DUF81  48.09 
 
 
263 aa  206  4e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4215  hypothetical protein  51.45 
 
 
260 aa  204  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0347  hypothetical protein  46.56 
 
 
268 aa  201  7e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2434  hypothetical protein  46.34 
 
 
265 aa  201  1e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1139  hypothetical protein  43.89 
 
 
268 aa  197  1e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  44.27 
 
 
263 aa  197  1e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.544082 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0158  protein of unknown function DUF81  46.39 
 
 
265 aa  192  3e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.220431 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0552  protein of unknown function DUF81  47.31 
 
 
265 aa  188  1e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2511  hypothetical protein  48.22 
 
 
274 aa  187  2e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.213064  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0764  hypothetical protein  41.6 
 
 
264 aa  186  4e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0909  protein of unknown function DUF81  41.6 
 
 
268 aa  186  5e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2237  hypothetical protein  45.11 
 
 
263 aa  185  8e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2672  hypothetical protein  43.89 
 
 
270 aa  184  1e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.562699  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2424  protein of unknown function DUF81  50 
 
 
261 aa  183  2e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0751  hypothetical protein  44.06 
 
 
265 aa  182  6e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1203  protein of unknown function DUF81  43.23 
 
 
265 aa  180  2e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.129839 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3512  hypothetical protein  46.18 
 
 
263 aa  180  3e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  6.88287e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1097  hypothetical protein  49.05 
 
 
263 aa  177  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000323114 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4025  hypothetical protein  41.22 
 
 
266 aa  178  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1384  hypothetical protein  45.11 
 
 
264 aa  177  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0472922  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0529  hypothetical protein  42.68 
 
 
266 aa  176  3e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.276386  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2312  hypothetical protein  42.7 
 
 
265 aa  176  5e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0059  protein of unknown function DUF81  45.38 
 
 
268 aa  169  3e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4151  hypothetical protein  47.51 
 
 
260 aa  169  4e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.127406  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3502  protein of unknown function DUF81  40.84 
 
 
268 aa  169  5e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.923118  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2201  hypothetical protein  41.38 
 
 
262 aa  168  8e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  4.68231e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0872  protein of unknown function DUF81  39.77 
 
 
267 aa  167  2e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.243092  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1245  hypothetical protein  46.51 
 
 
266 aa  166  3e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0041  protein of unknown function DUF81  44.98 
 
 
268 aa  164  1e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4451  protein of unknown function DUF81  45.34 
 
 
268 aa  163  4e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3998  hypothetical protein  37.97 
 
 
268 aa  162  4e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.192524  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3677  hypothetical protein  34.6 
 
 
267 aa  162  7e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2424  protein of unknown function DUF81  46.62 
 
 
263 aa  162  7e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2333  hypothetical protein  48.79 
 
 
288 aa  160  1e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.248827  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1872  protein of unknown function DUF81  41.85 
 
 
265 aa  160  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.829326  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4169  hypothetical protein  44.35 
 
 
268 aa  160  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2780  hypothetical protein  40.54 
 
 
264 aa  159  4e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.525966  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1825  protein of unknown function DUF81  45.86 
 
 
263 aa  159  5e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.942531  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0390  protein of unknown function DUF81  39.84 
 
 
268 aa  157  2e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.601931  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4013  hypothetical protein  46.33 
 
 
269 aa  155  5e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2312  putative integral membrane protein  44.2 
 
 
282 aa  152  4e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164654  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0205  hypothetical protein  38.79 
 
 
264 aa  151  8e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1229  hypothetical protein  40.94 
 
 
264 aa  149  5e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.341585  hitchhiker  0.00289815 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03708  hypothetical protein  36.82 
 
 
268 aa  149  7e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0955  hypothetical protein  38.69 
 
 
272 aa  149  7e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.2411 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2789  hypothetical protein  41.1 
 
 
266 aa  148  9e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0463907 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0613  hypothetical protein  38.91 
 
 
265 aa  147  2e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2371  hypothetical protein  39.83 
 
 
271 aa  146  4e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.643122  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2943  hypothetical protein  38.06 
 
 
266 aa  144  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0381677  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2863  hypothetical protein  38.06 
 
 
266 aa  143  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0601492  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2945  hypothetical protein  38.06 
 
 
266 aa  143  3e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.75892 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3844  hypothetical protein  39.92 
 
 
266 aa  142  4e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3041  hypothetical protein  37.65 
 
 
266 aa  141  1e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.297419  normal  0.785978 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004429  hypothetical protein  40 
 
 
263 aa  141  1e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.108567  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0650  hypothetical protein  39.74 
 
 
270 aa  140  2e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001494  hypothetical protein  29.66 
 
 
268 aa  140  2e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.696729  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2544  protein of unknown function DUF81  38.14 
 
 
273 aa  140  2e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.367735  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0865  hypothetical protein  38.82 
 
 
255 aa  139  4e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.130395 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0441  protein of unknown function DUF81  33.96 
 
 
266 aa  139  5e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0571  integral membrane protein  39.45 
 
 
267 aa  139  5e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00851307  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00969  hypothetical protein  38.43 
 
 
263 aa  139  5e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3623  hypothetical protein  38.58 
 
 
264 aa  139  6e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.900128  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1186  hypothetical protein  36.84 
 
 
266 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0170417  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1230  hypothetical protein  36.84 
 
 
266 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.615784  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2673  hypothetical protein  43 
 
 
268 aa  137  3e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4771  hypothetical protein  38.79 
 
 
241 aa  135  6e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.838718  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1801  hypothetical membrane spanning protein  35.23 
 
 
274 aa  135  9e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3127  protein of unknown function DUF81  37.25 
 
 
266 aa  134  1e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.156153  normal  0.596117 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1134  hypothetical protein  38.36 
 
 
267 aa  133  2e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.010051  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1263  hypothetical protein  36.03 
 
 
266 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.555704  normal  0.128151 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1621  permease  38.22 
 
 
264 aa  133  3e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4342  hypothetical protein  40.08 
 
 
274 aa  132  4e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1153  hypothetical protein  33.05 
 
 
269 aa  132  5e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1040  hypothetical protein  37.88 
 
 
264 aa  132  6e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0054225  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1225  protein of unknown function DUF81  34.06 
 
 
272 aa  131  1e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2787  hypothetical protein  40.77 
 
 
272 aa  130  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.770752  normal  0.86011 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1023  hypothetical protein  35.62 
 
 
266 aa  129  4e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1412  hypothetical protein  36.13 
 
 
268 aa  129  5e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02496  hypothetical protein  34.85 
 
 
272 aa  128  1e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.112519  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0611  hypothetical protein  32.99 
 
 
294 aa  126  4e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1144  hypothetical protein  36.84 
 
 
266 aa  126  4e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.262413  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3172  hypothetical protein  38.37 
 
 
277 aa  126  4e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.934574  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0578  hypothetical protein  38.55 
 
 
272 aa  125  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4234  protein of unknown function DUF81  32.45 
 
 
270 aa  125  5e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3910  hypothetical protein  37.96 
 
 
277 aa  125  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.562696  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1927  hypothetical protein  38.17 
 
 
272 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>