19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0027 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0027  YfaZ family protein  100 
 
 
191 aa  382  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2334  YfaZ family protein  37.7 
 
 
190 aa  130  9e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.6281  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2505  YfaZ family protein  32.2 
 
 
189 aa  88.6  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.634002  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0132  YfaZ  28.57 
 
 
197 aa  68.9  4e-11  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00180457  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1568  hypothetical protein  25.52 
 
 
179 aa  63.2  2e-09  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2770  YfaZ family protein  23.96 
 
 
179 aa  62  5e-09  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000254967  normal  0.114256 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2872  YfaZ family protein  23.44 
 
 
179 aa  60.5  2e-08  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00022374  hitchhiker  0.00192784 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2702  YfaZ family protein  24.48 
 
 
179 aa  60.5  2e-08  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000258539  hitchhiker  7.94475e-05 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1303  YfaZ family protein  24.48 
 
 
179 aa  60.1  2e-08  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2740  YfaZ family protein  23.84 
 
 
177 aa  55.5  4e-07  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  3.42783e-05  hitchhiker  6.15291e-05 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3446  YfaZ family protein  23.12 
 
 
179 aa  55.5  5e-07  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.055004 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1371  YfaZ family protein  23.96 
 
 
179 aa  55.1  5e-07  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.376788  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1387  YfaZ family protein  23.96 
 
 
179 aa  55.1  5e-07  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1410  YfaZ family protein  23.96 
 
 
179 aa  54.7  9e-07  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.71685  normal  0.181504 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2972  YfaZ family protein  23.96 
 
 
179 aa  54.7  9e-07  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.285706  normal  0.104145 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2962  YfaZ family protein  24.48 
 
 
179 aa  53.9  1e-06  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3297  YfaZ family protein  22.53 
 
 
179 aa  53.5  2e-06  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.842985  decreased coverage  2.30689e-08 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2689  YfaZ family protein  25.73 
 
 
186 aa  53.1  2e-06  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.673529  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0581  hypothetical protein  22.44 
 
 
190 aa  45.4  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  1.84382e-08  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>