More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0022 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0022  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  100 
 
 
614 aa  1187  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2338  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  50.52 
 
 
609 aa  463  1e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.369158  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0372  Protein-disulfide reductase  41.61 
 
 
750 aa  425  1e-117  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.754802  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0285  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  37.56 
 
 
789 aa  417  1e-115  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.352123  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0669  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  38.5 
 
 
810 aa  419  1e-115  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4167  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  41.5 
 
 
586 aa  411  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0446  protein-disulfide reductase  38.64 
 
 
731 aa  409  1e-113  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1055  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  39.18 
 
 
626 aa  394  1e-108  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000114598  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0028  protein-disulfide reductase  38.7 
 
 
623 aa  389  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3506  protein-disulfide reductase  40.44 
 
 
642 aa  374  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3915  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  38.31 
 
 
613 aa  374  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0545  thiol:disulfide interchange protein DsbD  41.19 
 
 
616 aa  368  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.221768  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0701  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  41.19 
 
 
616 aa  368  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0529075  hitchhiker  1.40832e-07 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2559  thiol:disulfide interchange protein DsbD  40.48 
 
 
752 aa  368  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.745294  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0953  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.85 
 
 
608 aa  358  2e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447642  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2790  thiol:disulfide interchange protein DsbD  40.13 
 
 
589 aa  356  8e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1041  DsbD family thiol:disulfide interchange protein  41.49 
 
 
745 aa  354  3e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0741  hypothetical protein  34.7 
 
 
586 aa  352  9e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2683  protein-disulfide reductase  37.99 
 
 
654 aa  352  1e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0722  hypothetical protein  34.58 
 
 
586 aa  348  1e-94  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3288  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  38.18 
 
 
624 aa  347  3e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1778  protein-disulfide reductase  36.79 
 
 
629 aa  347  4e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4691  thiol:disulfide interchange protein precursor  37 
 
 
565 aa  346  8e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4377  thiol:disulfide interchange protein precursor  37 
 
 
565 aa  346  8e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0111987  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4665  thiol:disulfide interchange protein precursor  36.82 
 
 
565 aa  345  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.836853  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3666  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.39 
 
 
628 aa  345  2e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.162085  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4605  thiol:disulfide interchange protein precursor  37 
 
 
565 aa  344  2e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0011627  normal  0.838171 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03968  hypothetical protein  37 
 
 
565 aa  345  2e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04006  thiol:disulfide interchange protein precursor  37 
 
 
565 aa  345  2e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3415  disulfide reductase  39.37 
 
 
623 aa  345  2e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.189847 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3876  thiol:disulfide interchange protein precursor  37 
 
 
565 aa  343  4e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0520  protein-disulfide reductase  37.97 
 
 
610 aa  343  6e-93  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00644414  normal  0.263509 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3856  Protein-disulfide reductase  36.82 
 
 
565 aa  342  1e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4741  thiol:disulfide interchange protein precursor  37.21 
 
 
567 aa  342  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5652  thiol:disulfide interchange protein precursor  36.46 
 
 
565 aa  341  2e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000390549  normal  0.76636 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4593  thiol:disulfide interchange protein precursor  37.39 
 
 
567 aa  341  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.610696 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0323  thiol:disulfide interchange protein precursor  36.49 
 
 
563 aa  340  3e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  4.6864e-05 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4719  thiol:disulfide interchange protein precursor  37.21 
 
 
567 aa  341  3e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0129572  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4684  thiol:disulfide interchange protein precursor  37.39 
 
 
567 aa  340  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4601  thiol:disulfide interchange protein precursor  37.21 
 
 
567 aa  340  6e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0281  thiol:disulfide interchange protein  34.68 
 
 
630 aa  339  7e-92  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2010  protein-disulfide reductase  38.88 
 
 
649 aa  338  1e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231364 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1312  Protein-disulfide reductase  37.93 
 
 
625 aa  338  2e-91  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0091784  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4015  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.3 
 
 
611 aa  335  1e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  2.87322e-10 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1181  thiol:disulfide interchange protein DsbD  35.19 
 
 
628 aa  335  1e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.753424  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2592  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  37.28 
 
 
654 aa  334  3e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0696  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.39 
 
 
610 aa  330  4e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0546  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.17 
 
 
613 aa  330  5e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0488882  normal  0.137935 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2990  thiol:disulfide interchange transmembrane protein  38.87 
 
 
608 aa  330  7e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3576  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.94 
 
 
613 aa  328  1e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.784092 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3615  Protein-disulfide reductase  37.37 
 
 
626 aa  329  1e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573017  hitchhiker  1.93428e-08 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1355  Thioredoxin domain protein  34.46 
 
 
577 aa  328  1e-88  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0538  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.18 
 
 
607 aa  328  1e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.126162  decreased coverage  0.00471183 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6280  protein-disulfide reductase  36.63 
 
 
623 aa  328  2e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.432431 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3406  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.22 
 
 
613 aa  328  2e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0237355 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3247  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.94 
 
 
604 aa  325  1e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3266  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.91 
 
 
602 aa  325  2e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03921  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.29 
 
 
631 aa  323  5e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4158  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.73 
 
 
609 aa  323  6e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.18513 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3726  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.95 
 
 
619 aa  323  8e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.53604  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0659  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.79 
 
 
619 aa  322  9e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0416  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.41 
 
 
624 aa  322  1e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136243  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0663  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.63 
 
 
619 aa  321  2e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0636  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.63 
 
 
619 aa  321  2e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2810  protein-disulfide reductase  37.71 
 
 
618 aa  322  2e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.126387  normal  0.451155 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3268  Protein-disulfide reductase  38.32 
 
 
605 aa  320  5e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0181869 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0906  thiol:disulfide interchange protein DsbD  33.92 
 
 
563 aa  318  1e-85  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.664459  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2730  protein-disulfide reductase  38.1 
 
 
615 aa  318  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0377  protein-disulfide reductase  38.1 
 
 
615 aa  318  2e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2811  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.62 
 
 
624 aa  317  4e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1683  thiol:disulfide interchange protein DsbD  36.23 
 
 
624 aa  317  4e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.424941  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1568  protein-disulfide reductase  36.03 
 
 
622 aa  317  5e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.314287  normal  0.0195641 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3476  protein-disulfide reductase  38.57 
 
 
617 aa  316  7e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.842688 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0503  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.93 
 
 
583 aa  316  8e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0561  thiol:disulfide interchange protein precursor  37.83 
 
 
590 aa  315  1e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002212  cytochrome c-type biogenesis protein DsbD protein-disulfide reductase  32.05 
 
 
603 aa  315  1e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0296  protein-disulfide reductase  38.45 
 
 
611 aa  315  2e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.58017  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0084  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.45 
 
 
592 aa  313  7e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0403  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.66 
 
 
561 aa  313  7e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.471471  hitchhiker  0.00764608 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1357  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  37.84 
 
 
612 aa  313  8e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.669889  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0583  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.19 
 
 
610 aa  313  8e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3247  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.73 
 
 
616 aa  312  1e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0836496  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0305  protein-disulfide reductase  38.63 
 
 
611 aa  311  3e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.069977 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3535  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.8 
 
 
572 aa  310  3e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0343  protein-disulfide reductase  36.99 
 
 
631 aa  309  9e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0138358 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4604  thiol:disulfide interchange protein precursor  39.79 
 
 
593 aa  308  1e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.138187 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0356  protein-disulfide reductase  37.81 
 
 
615 aa  308  2e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.456746 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0600  thiol:disulfide interchange protein precursor  38.54 
 
 
590 aa  308  2e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0278  protein-disulfide reductase  38.06 
 
 
614 aa  307  3e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.108061 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2921  Protein-disulfide reductase  37.81 
 
 
604 aa  306  7e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000351714 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0145  cytochrome C biogenesis protein transmembrane region  33.1 
 
 
570 aa  306  7e-82  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0606  thiol:disulfide interchange protein precursor  38.54 
 
 
590 aa  306  8e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0653759 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2274  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.22 
 
 
600 aa  305  1e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2329  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.22 
 
 
606 aa  304  3e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0733929  normal  0.104839 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0722  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.48 
 
 
583 aa  302  1e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3828  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.79 
 
 
595 aa  301  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.368823  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0728  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.79 
 
 
595 aa  301  2e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2773  Protein-disulfide reductase  34.23 
 
 
632 aa  301  2e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00156  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.33 
 
 
592 aa  301  2e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3681  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.79 
 
 
595 aa  301  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.576987  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>