More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0020 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0020  co-chaperonin GroES  100 
 
 
95 aa  185  2e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.436916  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0291  Chaperonin Cpn10  78.95 
 
 
96 aa  162  2e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0587447  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0706  co-chaperonin GroES  77.89 
 
 
96 aa  157  5e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2340  chaperonin Cpn10  75.79 
 
 
96 aa  156  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.4787  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0438  co-chaperonin GroES  75.79 
 
 
96 aa  156  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  7.05596e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2922  co-chaperonin GroES  76.84 
 
 
96 aa  155  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  1.27335e-12  n/a   
 
 
 
NC_009727  CBUD_0286  co-chaperonin GroES  72.63 
 
 
127 aa  146  8e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  3.13463e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1705  chaperonin, 10 kDa subunit  70.53 
 
 
96 aa  146  9e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0742  co-chaperonin GroES  71.58 
 
 
96 aa  146  9e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0723  co-chaperonin GroES  71.58 
 
 
96 aa  146  9e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1909  co-chaperonin GroES  72.63 
 
 
96 aa  146  1e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.815751  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5254  chaperonin Cpn10  70.53 
 
 
105 aa  145  2e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.321205  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0120  chaperonin Cpn10  70.53 
 
 
96 aa  144  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427234  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0543  co-chaperonin GroES  66.32 
 
 
96 aa  142  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00172283  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0699  co-chaperonin GroES  66.32 
 
 
96 aa  142  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  1.27096e-08  unclonable  2.92135e-11 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3082  chaperonin Cpn10  69.47 
 
 
105 aa  142  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3428  chaperonin Cpn10  69.47 
 
 
105 aa  142  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6726  chaperonin Cpn10  67.37 
 
 
105 aa  141  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2610  10 kDa chaperonin (Cpn10), groES  69.47 
 
 
105 aa  141  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  5.23216e-07  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4543  10 kDa chaperonin (Cpn10), groES  69.47 
 
 
105 aa  141  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000123576  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1581  chaperonin Cpn10  66.32 
 
 
105 aa  140  8e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6250  chaperonin Cpn10  66.32 
 
 
105 aa  140  8e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.646299 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1419  chaperonin Cpn10  69.47 
 
 
96 aa  139  1e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0269029  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2345  co-chaperonin GroES  68.42 
 
 
96 aa  139  2e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  2.86758e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6393  chaperonin Cpn10  68.42 
 
 
105 aa  138  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.673453  normal  0.108093 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0552  co-chaperonin GroES  65.26 
 
 
96 aa  137  4e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0540  co-chaperonin GroES  65.26 
 
 
96 aa  137  5e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0263712 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0146  10 kDa chaperonin GroS  69.15 
 
 
106 aa  136  9e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.735087  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3429  chaperonin, 10 kDa  63.16 
 
 
105 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000999948  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6097  chaperonin Cpn10  67.37 
 
 
105 aa  135  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3391  chaperonin, 10 kDa  63.16 
 
 
105 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.974932  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3425  chaperonin, 10 kDa  63.16 
 
 
105 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2625  chaperonin Cpn10  63.16 
 
 
96 aa  135  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2928  chaperonin Cpn10  65.26 
 
 
96 aa  135  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  2.96393e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0639  co-chaperonin GroES  63.16 
 
 
96 aa  135  3e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00560672  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0092  co-chaperonin GroES  69.47 
 
 
96 aa  134  3e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  2.41636e-06  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0365  co-chaperonin GroES  69.47 
 
 
96 aa  134  4e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  2.41312e-11  hitchhiker  0.00832872 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3714  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 
97 aa  132  1e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.31168 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2803  co-chaperonin GroES  64.21 
 
 
95 aa  133  1e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  1.32343e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2031  co-chaperonin GroES  64.21 
 
 
95 aa  132  2e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.133549  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3660  co-chaperonin GroES  61.7 
 
 
97 aa  132  2e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0336408  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3339  co-chaperonin GroES  61.05 
 
 
95 aa  132  2e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.148697  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1806  co-chaperonin GroES  64.21 
 
 
96 aa  132  2e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  2.65316e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0425  co-chaperonin GroES  68.09 
 
 
96 aa  132  2e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.16071e-20  hitchhiker  0.002869 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3593  co-chaperonin GroES  61.7 
 
 
97 aa  132  2e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3734  co-chaperonin GroES  61.7 
 
 
97 aa  132  2e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.619596  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2175  chaperonin Cpn10  63.16 
 
 
96 aa  132  2e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.95289 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2431  chaperonin, 10 kDa  60 
 
 
105 aa  131  4e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.564469  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0028  co-chaperonin GroES  61.05 
 
 
95 aa  130  4e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  6.32588e-17  normal  0.625386 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2616  chaperonin, 10 kDa  60 
 
 
105 aa  131  4e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.804052  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0344  chaperonin, 10 kDa  60 
 
 
105 aa  131  4e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.272822  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1205  chaperonin, 10 kDa  60 
 
 
105 aa  131  4e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0232  chaperonin Cpn10  62.11 
 
 
96 aa  130  6e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0619  chaperonin Cpn10  67.37 
 
 
96 aa  130  7e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0859  chaperonin Cpn10  63.54 
 
 
96 aa  130  9e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  2.06391e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4306  co-chaperonin GroES  58.95 
 
 
96 aa  128  2e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  2.35031e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0248  chaperonin Cpn10  61.05 
 
 
96 aa  129  2e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  1.71869e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0549  co-chaperonin GroES  61.05 
 
 
95 aa  127  3e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  1.9989e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2529  co-chaperonin GroES  65.96 
 
 
97 aa  128  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0262789 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0732  co-chaperonin GroES  64.89 
 
 
97 aa  127  4e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138377  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0911  co-chaperonin GroES  64.89 
 
 
97 aa  127  4e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.740154  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0678  co-chaperonin GroES  65.26 
 
 
96 aa  127  4e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.651132  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0700  co-chaperonin GroES  65.26 
 
 
96 aa  127  4e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.210155  normal  0.0126966 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13470  co-chaperonin GroES  65.62 
 
 
97 aa  127  4e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2741  co-chaperonin GroES  64.89 
 
 
97 aa  127  4e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.260788  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3118  co-chaperonin GroES  64.89 
 
 
97 aa  127  4e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.143414  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0749  co-chaperonin GroES  64.89 
 
 
97 aa  127  4e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0685029 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2002  co-chaperonin GroES  64.89 
 
 
97 aa  127  4e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1519  co-chaperonin GroES  64.21 
 
 
96 aa  127  4e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  1.3656e-11  normal  0.699142 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3687  co-chaperonin GroES  65.62 
 
 
97 aa  127  4e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.803225  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1457  co-chaperonin GroES  64.89 
 
 
97 aa  127  4e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1864  co-chaperonin GroES  64.89 
 
 
97 aa  127  4e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.563369  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3154  co-chaperonin GroES  64.89 
 
 
97 aa  127  4e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3176  co-chaperonin GroES  64.89 
 
 
97 aa  127  4e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.521457  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0967  co-chaperonin GroES  65.62 
 
 
97 aa  127  5e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387654  normal  0.774499 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0296  chaperonin Cpn10  61.7 
 
 
97 aa  127  6e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.018883  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3954  co-chaperonin GroES  65.96 
 
 
97 aa  127  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  6.45476e-05  normal  0.0983553 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2334  co-chaperonin GroES  65.96 
 
 
96 aa  127  7e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0638712  normal  0.0156201 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1360  co-chaperonin GroES  65.62 
 
 
97 aa  127  7e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0209303  normal  0.159546 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4364  co-chaperonin GroES  65.62 
 
 
97 aa  127  7e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.760414  normal  0.0428794 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0534  co-chaperonin GroES  64.21 
 
 
96 aa  127  7e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0641  co-chaperonin GroES  64.89 
 
 
96 aa  126  8e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3816  co-chaperonin GroES  63.16 
 
 
96 aa  126  9e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  1.25602e-08  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0863  co-chaperonin GroES  63.16 
 
 
96 aa  126  9e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  3.37259e-06  normal  0.081408 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0578  co-chaperonin GroES  64.89 
 
 
96 aa  126  1e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.196352  normal  0.456012 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0830  co-chaperonin GroES  63.83 
 
 
97 aa  125  1e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  3.37917e-05  decreased coverage  2.32712e-06 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0859  co-chaperonin GroES  63.83 
 
 
97 aa  125  1e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00336057  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0377  co-chaperonin GroES  63.83 
 
 
97 aa  125  1e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00305942  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0615  co-chaperonin GroES  64.89 
 
 
96 aa  126  1e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0242301 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0605  chaperonin Cpn10  59.57 
 
 
95 aa  126  1e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.131818 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4377  chaperonin, 10 kDa  64.58 
 
 
97 aa  126  1e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2657  co-chaperonin GroES  64.89 
 
 
96 aa  126  1e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4073  co-chaperonin GroES  64.58 
 
 
97 aa  126  1e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.105969  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0453  chaperonin Cpn10  58.51 
 
 
95 aa  125  2e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4957  co-chaperonin GroES  64.58 
 
 
97 aa  125  2e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.433731  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0587  chaperonin Cpn10  64.21 
 
 
98 aa  125  2e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0674011  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2771  10 Kd chaperone GroES  58.95 
 
 
95 aa  125  2e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  8.05146e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57020  co-chaperonin GroES  64.58 
 
 
97 aa  125  2e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5366  chaperonin Cpn10  57.89 
 
 
95 aa  124  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.583884  normal  0.676466 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1132  co-chaperonin GroES  64.21 
 
 
96 aa  124  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  1.35765e-07  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>