278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0017 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0017  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
209 aa  429  1e-119  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.015175  normal  0.941948 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3380  hypothetical protein  69.67 
 
 
212 aa  299  2e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1115  radical SAM domain-containing protein  72.25 
 
 
209 aa  298  3e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0718  radical SAM domain-containing protein  67.94 
 
 
209 aa  298  4e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.525319  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1449  hypothetical protein  67.77 
 
 
212 aa  297  8e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3149  hypothetical protein  67.46 
 
 
210 aa  294  7e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.105264  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1394  hypothetical protein  64.93 
 
 
212 aa  293  1e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.44027  normal  0.102541 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1329  hypothetical protein  64.93 
 
 
212 aa  292  2e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.243068 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2645  hypothetical protein  65.07 
 
 
210 aa  289  2e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1082  hypothetical protein  66.67 
 
 
210 aa  288  4e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0796738  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0044  radical SAM domain-containing protein  62.38 
 
 
210 aa  286  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4406  hypothetical protein  62.38 
 
 
210 aa  286  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.798286 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0318  Radical SAM domain protein  61.43 
 
 
210 aa  285  4e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1848  hypothetical protein  64.29 
 
 
211 aa  284  6e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361359  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3134  organic radical activating enzyme-like protein  62.38 
 
 
210 aa  283  9e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.260686 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6747  radical SAM domain-containing protein  70.62 
 
 
210 aa  283  9e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.922703  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3118  organic radical activating enzymes-like protein  62.38 
 
 
210 aa  283  9e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174394  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2504  organic radical activating enzymes-like  62.38 
 
 
210 aa  283  9e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.160261  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0138  hypothetical protein  62.38 
 
 
210 aa  283  1e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.620978  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3173  organic radical activating enzyme-like protein  62.38 
 
 
210 aa  283  1e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.655462  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3056  organic radical activating enzyme-like protein  62.38 
 
 
210 aa  283  1e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.133958  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0153  hypothetical protein  62.38 
 
 
210 aa  282  2e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2364  hypothetical protein  62.38 
 
 
210 aa  282  2e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2794  hypothetical protein  62.38 
 
 
210 aa  282  2e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2285  hypothetical protein  62.38 
 
 
210 aa  282  2e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1571  hypothetical protein  62.86 
 
 
211 aa  283  2e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.794785 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0162  organic radical activating protein  62.38 
 
 
210 aa  282  2e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.495618  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0357  GntS  62.38 
 
 
210 aa  282  2e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386025  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3115  organic radical activating enzyme-like protein  61.9 
 
 
210 aa  281  3e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.369286  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6469  organic radical activating-like protein  61.9 
 
 
210 aa  282  3e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0172  hypothetical protein  62.38 
 
 
210 aa  281  5e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.196863  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3395  hypothetical protein  68.72 
 
 
211 aa  281  7e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.709482  normal  0.257118 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2177  radical SAM domain-containing protein  66.83 
 
 
211 aa  280  9e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.401056 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1221  hypothetical protein  68.87 
 
 
212 aa  280  1e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.175586  normal  0.688566 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3243  hypothetical protein  64.59 
 
 
210 aa  280  1e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.474711  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1382  hypothetical protein  68.87 
 
 
212 aa  280  1e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.980113  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2614  organic radical activating-like protein  63.03 
 
 
211 aa  279  2e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2757  organic radical activating-like protein  66.35 
 
 
211 aa  279  3e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1198  hypothetical protein  62.68 
 
 
210 aa  277  7e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.792067  normal  0.949639 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0526  hypothetical protein  65.24 
 
 
211 aa  277  1e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.313091  normal  0.440749 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2619  hypothetical protein  65.07 
 
 
210 aa  277  1e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.350576  normal  0.864443 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4381  hypothetical protein  59.32 
 
 
237 aa  275  4e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1382  hypothetical protein  64.11 
 
 
210 aa  275  4e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.41745  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0107  organic radical activating enzyme  62.04 
 
 
218 aa  274  6e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1354  hypothetical protein  62.2 
 
 
210 aa  274  6e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.129459 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3190  hypothetical protein  66.35 
 
 
211 aa  273  1e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.241224  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1494  hypothetical protein  63.33 
 
 
211 aa  272  3e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2298  hypothetical protein  66.03 
 
 
210 aa  269  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.959397  normal  0.58951 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0794  hypothetical protein  56.22 
 
 
218 aa  269  2e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1161  Radical SAM domain protein  69.52 
 
 
210 aa  268  3e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.228018  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3844  hypothetical protein  63.51 
 
 
212 aa  268  6e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.621065  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2382  hypothetical protein  64.29 
 
 
210 aa  266  2e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.133119  hitchhiker  0.000954776 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4095  hypothetical protein  61.14 
 
 
212 aa  264  8e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1410  radical SAM domain protein  67.46 
 
 
211 aa  264  9e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.562176 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1300  hypothetical protein  61.72 
 
 
210 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.946675 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1045  hypothetical protein  60.95 
 
 
211 aa  261  4e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0321486  normal  0.408994 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1837  hypothetical protein  60.66 
 
 
212 aa  259  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0997579  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2039  hypothetical protein  62.44 
 
 
215 aa  259  2e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0922  hypothetical protein  65.55 
 
 
210 aa  259  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1418  radical SAM domain-containing protein  57.67 
 
 
217 aa  254  7e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1403  organic radical activating-like protein  59.22 
 
 
210 aa  254  7e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.962415  normal  0.246336 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2104  hypothetical protein  55.14 
 
 
216 aa  246  1e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00607165 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6594  radical SAM domain-containing protein  68.57 
 
 
210 aa  246  1e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.721327  normal  0.108065 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1081  hypothetical protein  63.51 
 
 
222 aa  232  4e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.587808 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0597  hypothetical protein  57.6 
 
 
216 aa  227  9e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1124  radical SAM domain protein  56.5 
 
 
224 aa  222  4e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0539  Radical SAM domain protein  56.85 
 
 
198 aa  219  2e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.559214  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0318  queuosine biosynthesis protein QueE  45.83 
 
 
233 aa  150  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.321571  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1057  hypothetical protein  37.33 
 
 
197 aa  115  4e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0622294 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2111  Radical SAM domain protein  38.57 
 
 
211 aa  113  2e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1782  organic radical activating enzyme  36.45 
 
 
216 aa  101  9e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330721  normal  0.904053 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1878  Radical SAM domain protein  31.73 
 
 
192 aa  100  1e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.315788  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0635  radical SAM domain-containing protein  33.18 
 
 
195 aa  98.6  6e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6932  hypothetical protein  35.81 
 
 
209 aa  98.2  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.465455 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2067  Radical SAM domain protein  32.08 
 
 
207 aa  97.1  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0974345  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0088  hypothetical protein  31.9 
 
 
193 aa  95.9  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0487  radical SAM domain-containing protein  32.39 
 
 
210 aa  93.2  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1715  organic radical activating enzyme  31.13 
 
 
205 aa  92  5e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0221743  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1319  Radical SAM domain protein  29.44 
 
 
210 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0822  hypothetical protein  31.82 
 
 
223 aa  87.8  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1100  radical SAM domain-containing protein  32.07 
 
 
246 aa  87.4  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.256897  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0659  Radical SAM domain protein  33.97 
 
 
210 aa  87  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.917391  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2236  organic radical activating protein  32.71 
 
 
205 aa  85.9  4e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06800  hypothetical protein  30.95 
 
 
210 aa  85.1  7e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0516243  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2501  radical activating enzyme  31.65 
 
 
222 aa  83.6  2e-15  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0634  radical SAM domain-containing protein  33.03 
 
 
204 aa  84  2e-15  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1145  radical activating enzyme  29.15 
 
 
205 aa  83.2  2e-15  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.723359 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2058  radical activating enzyme  31.22 
 
 
222 aa  83.2  3e-15  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00725057  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1855  radical activating enzyme  31.49 
 
 
222 aa  82.4  4e-15  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.328449  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3531  hypothetical protein  31.78 
 
 
223 aa  82  6e-15  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.786232  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1332  hypothetical protein  31.63 
 
 
206 aa  82  6e-15  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1917  radical activating enzyme  31.22 
 
 
222 aa  82  6e-15  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0152798  normal 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4540  hypothetical protein  31.44 
 
 
222 aa  81.6  7e-15  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2254  radical activating enzyme  31.44 
 
 
222 aa  81.6  7e-15  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.499803  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0267  radical SAM domain-containing protein  31.84 
 
 
202 aa  81.6  7e-15  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.953431  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2268  radical activating enzyme  31.44 
 
 
222 aa  81.6  7e-15  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00320351  normal  0.189151 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1116  hypothetical protein  28.7 
 
 
205 aa  81.6  8e-15  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3374  hypothetical protein  31.36 
 
 
223 aa  80.9  1e-14  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2163  radical activating enzyme  30.8 
 
 
222 aa  80.9  1e-14  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00224373  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0856  hypothetical protein  33.33 
 
 
224 aa  80.9  1e-14  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>