More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0016 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA2541  nitrogen regulation protein NR(I)  66.6 
 
 
470 aa  642  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1215  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  73.35 
 
 
471 aa  657  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4923  nitrogen metabolism transcriptional regulator NtrC  70.51 
 
 
478 aa  676  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.924842  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0352  nitrogen regulation protein NR(I)  70.09 
 
 
478 aa  674  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0766  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  66.17 
 
 
477 aa  639  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0481028  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4822  helix-turn-helix, Fis-type:nitrogen regulation protein NR(I)  70.09 
 
 
478 aa  674  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0734  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  67.52 
 
 
477 aa  652  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.942918  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5859  two-component response regulator NtrC  71.58 
 
 
476 aa  687  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.421071  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0016  nitrogen metabolism transcriptional regulator NtrC  100 
 
 
468 aa  941  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0855054  normal  0.786337 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0339  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  70.51 
 
 
478 aa  676  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3262  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis Family  72.81 
 
 
471 aa  685  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5048  nitrogen metabolism transcriptional regulator NtrC  70.51 
 
 
478 aa  675  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67680  two-component response regulator NtrC  71.15 
 
 
476 aa  682  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000437551  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4144  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  71.15 
 
 
477 aa  677  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0415  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  70.94 
 
 
478 aa  679  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.855382 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5101  nitrogen metabolism transcriptional regulator NtrC  70.51 
 
 
478 aa  675  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45900  nitrogen regulation protein, sigma 54-dependent response regulator NtrC (NR(I))  70.09 
 
 
478 aa  678  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0499  response regulator receiver domain-containing protein  67.38 
 
 
473 aa  648  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.021061  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0246  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  68.75 
 
 
469 aa  632  1e-180  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.487777  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03702  hypothetical protein  67.03 
 
 
469 aa  627  1e-179  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03753  fused DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with GlnL: response regulator/sigma54 interaction protein  67.03 
 
 
469 aa  627  1e-179  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4237  nitrogen regulation protein NR(I)  66.81 
 
 
469 aa  628  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4394  nitrogen regulation protein NR(I)  66.81 
 
 
469 aa  629  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4216  nitrogen regulation protein NR(I)  66.81 
 
 
469 aa  628  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.295301  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4883  nitrogen regulation protein NR(I)  67.38 
 
 
470 aa  628  1e-179  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.177074  hitchhiker  3.22182e-05 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4333  nitrogen regulation protein NR(I)  66.81 
 
 
469 aa  628  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.140715  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4287  nitrogen regulation protein NR(I)  66.81 
 
 
469 aa  628  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0756679  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4098  nitrogen regulation protein NR(I)  67.45 
 
 
470 aa  630  1e-179  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.797915 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4390  nitrogen regulation protein NR(I)  67.03 
 
 
469 aa  627  1e-178  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.127215  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4095  nitrogen regulation protein NR(I)  66.81 
 
 
469 aa  625  1e-178  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4344  nitrogen regulation protein NR(I)  67.03 
 
 
469 aa  627  1e-178  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4253  nitrogen regulation protein NR(I)  67.03 
 
 
472 aa  627  1e-178  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.177692  normal  0.167125 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4118  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis Family  67.03 
 
 
469 aa  627  1e-178  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4148  nitrogen regulation protein NR(I)  67.03 
 
 
469 aa  627  1e-178  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.221467 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5314  nitrogen regulation protein NR(I)  67.03 
 
 
472 aa  627  1e-178  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.111299  normal  0.738695 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4222  nitrogen regulation protein NR(I)  66.74 
 
 
470 aa  625  1e-178  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.327829  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4159  nitrogen regulation protein NR(I)  66.74 
 
 
470 aa  624  1e-177  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.086406  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0371  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  64 
 
 
470 aa  623  1e-177  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.160254  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3561  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  63.66 
 
 
469 aa  623  1e-177  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0257  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  63.87 
 
 
471 aa  624  1e-177  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000519324 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4472  nitrogen regulation protein NR(I)  63.91 
 
 
471 aa  624  1e-177  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3764  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  63.91 
 
 
471 aa  624  1e-177  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0258  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  64.54 
 
 
469 aa  624  1e-177  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.1328  hitchhiker  1.93209e-06 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3962  nitrogen regulation protein NR(I)  66.74 
 
 
470 aa  624  1e-177  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389706  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0258  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  64 
 
 
470 aa  622  1e-177  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0320  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  63.79 
 
 
470 aa  623  1e-177  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3427  response regulator receiver protein  65.32 
 
 
470 aa  621  1e-176  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.234711 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0025  nitrogen regulation protein NR(I)  66.52 
 
 
470 aa  620  1e-176  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.151443  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4191  nitrogen regulation protein NR(I)  66.52 
 
 
470 aa  620  1e-176  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.500264  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0266  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  63.79 
 
 
470 aa  620  1e-176  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2321  nitrogen regulation protein NR(I)  66.23 
 
 
468 aa  618  1e-176  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0266  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  63.79 
 
 
470 aa  620  1e-176  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.649687  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4505  nitrogen regulation protein NR(I)  66.31 
 
 
470 aa  621  1e-176  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.565329  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0261  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis Family  63.79 
 
 
470 aa  620  1e-176  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.024996 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00584  response regulator  65.67 
 
 
467 aa  615  1e-175  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1028  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  65.66 
 
 
468 aa  617  1e-175  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.070914  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0282  nitrogen metabolism transcriptional regulator NtrC  63.87 
 
 
471 aa  617  1e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.675957  hitchhiker  4.21571e-07 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4651  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  63.21 
 
 
469 aa  615  1e-175  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.446316 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001908  nitrogen regulation protein NR(I)  65.67 
 
 
467 aa  617  1e-175  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01588  two-component system, response regulator  65.23 
 
 
464 aa  617  1e-175  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.396226  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0027  nitrogen regulation protein NR(I)  66.31 
 
 
470 aa  616  1e-175  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.307133  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3458  nitrogen regulation protein NR(I)  63.03 
 
 
466 aa  610  1e-173  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00165612  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0397  nitrogen regulation protein NR(I)  62.91 
 
 
466 aa  605  1e-172  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.482559  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2500  two component Fis family transcriptional regulator  63.6 
 
 
476 aa  598  1e-170  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0050  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis Family  64.83 
 
 
478 aa  596  1e-169  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3930  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  64.76 
 
 
469 aa  594  1e-168  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000245107  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2450  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  63.85 
 
 
462 aa  590  1e-167  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000104491  normal  0.63173 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2519  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis Family  64.44 
 
 
468 aa  590  1e-167  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2901  nitrogen regulation protein NR(I)  64.44 
 
 
468 aa  590  1e-167  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3758  helix-turn-helix, Fis-type:nitrogen regulation protein NR(I)  62.69 
 
 
476 aa  582  1e-165  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3488  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  60.26 
 
 
466 aa  580  1e-164  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.934178  normal  0.0666939 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3651  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis Family  64.01 
 
 
474 aa  574  1e-162  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.071917  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0256  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis Family  60.55 
 
 
490 aa  558  1e-158  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1261  nitrogen assimilation regulatory response regulator transcription regulator protein  58.08 
 
 
502 aa  553  1e-156  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.634694  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1479  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  57.68 
 
 
504 aa  554  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492509  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1124  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  57.88 
 
 
504 aa  550  1e-155  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.359877  normal  0.272009 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2184  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  57.28 
 
 
508 aa  549  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.654908  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1182  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis Family  57.09 
 
 
502 aa  546  1e-154  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.135546  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3584  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  58.01 
 
 
494 aa  545  1e-154  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.914816 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1089  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis Family  57.09 
 
 
502 aa  546  1e-154  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2057  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  56.89 
 
 
508 aa  546  1e-154  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1524  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  57.17 
 
 
505 aa  548  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.437869  normal  0.0359262 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1740  nitrogen regulation protein NR(I)  56.89 
 
 
511 aa  543  1e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.58726  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2250  nitrogen regulation protein NR(I)  56.89 
 
 
511 aa  543  1e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3069  nitrogen regulation protein NR(I)  56.89 
 
 
511 aa  543  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2632  nitrogen regulation protein NR(I)  56.69 
 
 
511 aa  542  1e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.472177  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5930  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  56.94 
 
 
504 aa  542  1e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.343161  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2688  nitrogen regulation protein NR(I)  56.89 
 
 
511 aa  543  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231553  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1522  nitrogen regulation protein NR(I)  56.89 
 
 
511 aa  543  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2165  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  56.94 
 
 
504 aa  541  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.175856  normal  0.928709 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2766  nitrogen regulation protein NR(I)  56.89 
 
 
511 aa  543  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2147  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  56.94 
 
 
504 aa  542  1e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.447968  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5456  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  57.06 
 
 
506 aa  543  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1253  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  56.04 
 
 
484 aa  539  1e-152  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.000517304  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2613  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis Family  56.57 
 
 
505 aa  540  1e-152  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.262075  normal  0.337691 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1192  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  56.63 
 
 
511 aa  536  1e-151  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.616523  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2054  helix-turn-helix, Fis-type:nitrogen regulation protein NR(I)  56.81 
 
 
524 aa  537  1e-151  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.652577  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2059  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  55.66 
 
 
528 aa  533  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0914415  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1112  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis Family  56.44 
 
 
511 aa  533  1e-150  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2777  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  55.53 
 
 
516 aa  533  1e-150  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0285959 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>