216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0006 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_3132  glycoside hydrolase 15-related  58.45 
 
 
598 aa  721  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3154  glycoside hydrolase 15-related  55.41 
 
 
593 aa  639  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0415  glycoside hydrolase 15-like protein  53.22 
 
 
624 aa  640  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0006  glycoside hydrolase 15-related  100 
 
 
595 aa  1225  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.780753 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1816  glycoside hydrolase 15-related  59.29 
 
 
596 aa  731  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1121  glycoside hydrolase 15-related  75.89 
 
 
595 aa  917  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0235  glycoside hydrolase 15-related  55.65 
 
 
599 aa  682  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.794837  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04868  glycosyl hydrolase, family 15  54.56 
 
 
592 aa  637  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0356  glycoside hydrolase 15-related  53.39 
 
 
620 aa  634  1e-180  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0307  glycoside hydrolase 15-related  52.17 
 
 
603 aa  634  1e-180  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0518  glycoside hydrolase 15-related  52.96 
 
 
606 aa  631  1e-180  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1528  glycoside hydrolase 15-related  52.61 
 
 
593 aa  629  1e-179  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3791  hypothetical protein  52.97 
 
 
598 aa  625  1e-178  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000380463 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0502  glycoside hydrolase 15-related  52.62 
 
 
606 aa  627  1e-178  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.830994  normal  0.0194391 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0525  glycoside hydrolase 15-related  51.86 
 
 
606 aa  627  1e-178  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.262384 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4211  glycoside hydrolase 15-related protein  51.36 
 
 
657 aa  625  1e-178  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.775495  normal  0.475845 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3916  glycoside hydrolase 15-related  51.59 
 
 
618 aa  614  1e-174  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.267662 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0986  glycoside hydrolase 15-related  50.93 
 
 
640 aa  615  1e-174  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3609  glycoside hydrolase 15-related  52.48 
 
 
598 aa  603  1e-171  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.359556 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1778  glycoside hydrolase 15-related  50.77 
 
 
598 aa  600  1e-170  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.743693  normal  0.0628922 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1018  glycoside hydrolase 15-related  50.17 
 
 
589 aa  599  1e-170  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0623694  normal  0.517609 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3025  glycoside hydrolase 15-related  51.76 
 
 
597 aa  597  1e-169  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3614  glycoside hydrolase 15-related  51.83 
 
 
597 aa  595  1e-169  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.633662  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1504  glycoside hydrolase 15-related  50.26 
 
 
594 aa  583  1e-165  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4023  glycoside hydrolase 15-related  40.65 
 
 
593 aa  436  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000792533  normal  0.121588 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2230  glycoside hydrolase 15-related  39.93 
 
 
594 aa  436  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.904069 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0399  glucoamylase-related protein, trehalase  39.97 
 
 
593 aa  428  1e-118  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.216447  normal  0.225256 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1617  glycoside hydrolase  34.98 
 
 
612 aa  321  2e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1405  glycoside hydrolase 15-related  35.83 
 
 
623 aa  317  4e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.059685 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1340  glycoside hydrolase 15-related  35.95 
 
 
623 aa  315  1e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2362  glycoside hydrolase 15-related  36.07 
 
 
611 aa  314  2e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897643  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2242  glycoside hydrolase 15-related  36.07 
 
 
609 aa  313  4e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.55211 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0740  glycoside hydrolase 15-related  37.65 
 
 
594 aa  312  9e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000780754 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2133  glycoside hydrolase 15-related protein  35.69 
 
 
602 aa  310  5e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136877  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2497  glycoside hydrolase 15-related  36.38 
 
 
596 aa  310  7e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0866572  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0954  glycoside hydrolase 15-related  35.91 
 
 
609 aa  310  7e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4035  glycoside hydrolase 15-related  35.82 
 
 
611 aa  309  8e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02887  glycosyl hydrolase, family 15  35.34 
 
 
599 aa  308  1e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2323  glycoside hydrolase 15-related  35.38 
 
 
609 aa  308  3e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2346  glycoside hydrolase 15-related  35.38 
 
 
609 aa  308  3e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171606  normal  0.0180735 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1458  hypothetical protein  34.81 
 
 
619 aa  307  4e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.412179 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3972  glycoside hydrolase 15-related  36.71 
 
 
594 aa  305  1e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.855212  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1711  glycoside hydrolase 15-related  35.22 
 
 
609 aa  305  2e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.45918  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0183  glycoside hydrolase 15-related protein  35.12 
 
 
605 aa  305  2e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5665  glycoside hydrolase 15-like protein  35.23 
 
 
609 aa  302  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1406  glycoside hydrolase 15-related protein  34.17 
 
 
601 aa  301  2e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.334429 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1238  glycoside hydrolase 15-like protein  36.45 
 
 
616 aa  300  4e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428683  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5958  glycoside hydrolase 15-related protein  35.62 
 
 
586 aa  300  5e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.0449084 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4175  glycoside hydrolase 15-related  34.29 
 
 
593 aa  299  7e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0491982  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3307  hypothetical protein  35.77 
 
 
626 aa  298  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1345  hypothetical protein  33.33 
 
 
598 aa  298  2e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0900  glycoside hydrolase 15-related  34.98 
 
 
613 aa  298  3e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3597  glycosyl hydrolase  34.27 
 
 
613 aa  297  4e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0143916  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2873  glycoside hydrolase 15-related  34.55 
 
 
608 aa  296  8e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.637072  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1239  glycoside hydrolase 15-related  35.22 
 
 
626 aa  295  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1028  glycosy hydrolase family protein  35.01 
 
 
610 aa  294  3e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111338  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2505  glycoside hydrolase 15-related  35.31 
 
 
602 aa  294  3e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368575  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1181  glycosy hydrolase family protein  35.01 
 
 
610 aa  294  3e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0838  glycosy hydrolase family protein  35.01 
 
 
610 aa  294  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0311  glycosy hydrolase family protein  35.01 
 
 
610 aa  294  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1927  glycosy hydrolase family protein  35.01 
 
 
610 aa  294  3e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.16927  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1340  glycoside hydrolase family protein  35.01 
 
 
610 aa  294  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1189  glycosy hydrolase family protein  35.01 
 
 
610 aa  294  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9496  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2637  glycoside hydrolase 15-related  34.27 
 
 
612 aa  293  5e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.872982  normal  0.317086 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0982  glycoside hydrolase 15-related protein  33.05 
 
 
611 aa  293  8e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3314  glycoside hydrolase 15-related  35.18 
 
 
617 aa  292  1e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0974  glycosy hydrolase family protein  34.67 
 
 
665 aa  292  1e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2418  glycoside hydrolase 15-related  35.15 
 
 
602 aa  292  1e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3442  glycoside hydrolase 15-related protein  34.45 
 
 
597 aa  291  2e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2309  glycoside hydrolase 15-related  34.21 
 
 
617 aa  291  2e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.557542 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2309  glycoside hydrolase 15-like protein  33.06 
 
 
627 aa  291  2e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1442  glycoside hydrolase 15-related  35.07 
 
 
600 aa  291  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.833593  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1889  glycoside hydrolase 15-related  34.8 
 
 
628 aa  291  2e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.510271 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0096  glycoside hydrolase 15-related  34.29 
 
 
600 aa  291  2e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.258248  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2221  glycoside hydrolase 15-related  34.79 
 
 
629 aa  291  2e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.47464  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4178  glycoside hydrolase 15-related  35.19 
 
 
602 aa  290  4e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3220  glycoside hydrolase 15-related  33.94 
 
 
602 aa  290  4e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4500  glycoside hydrolase 15-related  33.93 
 
 
619 aa  288  2e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3739  glycoside hydrolase 15-related  33.39 
 
 
613 aa  288  3e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.788382  normal  0.163243 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4963  glycoside hydrolase 15-related  33.93 
 
 
619 aa  287  4e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0703179  normal  0.140371 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1262  glycoside hydrolase 15-related  33.72 
 
 
599 aa  286  6e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.212074  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6382  glycoside hydrolase 15-related  33.5 
 
 
596 aa  286  1e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1955  glycoside hydrolase 15-related protein  34.88 
 
 
598 aa  285  1e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.172599 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2741  glycoside hydrolase 15-related protein  31.83 
 
 
625 aa  285  2e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3391  glycoside hydrolase 15-related  34.8 
 
 
617 aa  285  2e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1886  glycoside hydrolase 15-like protein  32.72 
 
 
601 aa  284  4e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.177282  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2986  glycoside hydrolase family protein  34.78 
 
 
605 aa  284  4e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.609071 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1271  glycoside hydrolase 15-related protein  33.44 
 
 
594 aa  282  1e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3193  glycoside hydrolase 15-related  34.42 
 
 
621 aa  282  1e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0304  glycoside hydrolase 15-related protein  34.53 
 
 
636 aa  282  1e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3331  glycoside hydrolase 15-related  35.99 
 
 
601 aa  282  1e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.487654 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5016  glycoside hydrolase 15-related  33.11 
 
 
620 aa  281  2e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346719  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4692  glycoside hydrolase 15-related  32.69 
 
 
627 aa  280  5e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.761206  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3480  glycoside hydrolase 15-related  31.83 
 
 
601 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2304  glycoside hydrolase 15-related  33.66 
 
 
629 aa  278  3e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.275031 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3119  glycosyl hydrolase, family 15  34.11 
 
 
605 aa  277  3e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0769806  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0874  glycoside hydrolase 15-related protein  34.15 
 
 
645 aa  276  6e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.219987  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2475  glycoside hydrolase 15-related  32.06 
 
 
621 aa  276  9e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1143  glycoside hydrolase 15-related  33.72 
 
 
627 aa  275  1e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0212491 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3385  glycoside hydrolase 15-related  33.6 
 
 
614 aa  276  1e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.371631 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>