More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0004 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0004  DNA gyrase, B subunit  64.26 
 
 
805 aa  1039  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.801274  hitchhiker  0.00617019 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0004  DNA gyrase subunit B  47.51 
 
 
768 aa  724  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0782517  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4150  DNA gyrase subunit B  65.71 
 
 
804 aa  1088  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0128391  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0003  DNA gyrase subunit B  48.4 
 
 
769 aa  746  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0004  DNA gyrase, B subunit  49.87 
 
 
795 aa  731  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.904157 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0004  DNA gyrase, B subunit  51.06 
 
 
795 aa  737  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0139  DNA gyrase subunit B  54.21 
 
 
807 aa  836  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837084  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0004  DNA gyrase, B subunit  64.26 
 
 
805 aa  1039  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.986187  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5854  DNA gyrase, B subunit  56.28 
 
 
808 aa  854  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0004  DNA gyrase, B subunit  65.02 
 
 
807 aa  1057  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0620606  hitchhiker  2.88479e-10 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3220  DNA gyrase subunit B  55.19 
 
 
811 aa  858  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0005  DNA gyrase, B subunit  56.84 
 
 
884 aa  946  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000126845  hitchhiker  3.17646e-08 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0004  DNA gyrase, B subunit  71.12 
 
 
807 aa  1124  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2054  DNA gyrase subunit B  48.32 
 
 
770 aa  728  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0007  DNA gyrase, B subunit  55.39 
 
 
814 aa  850  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  1.27648e-15 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3355  DNA gyrase subunit B  55.83 
 
 
805 aa  842  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.784759 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0095  DNA gyrase, B subunit  46.62 
 
 
814 aa  714  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0142901  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0004  DNA gyrase, B subunit  64.18 
 
 
813 aa  1044  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.821769  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0035  DNA gyrase subunit B  66.08 
 
 
804 aa  1089  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.373833  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0009  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  64.18 
 
 
813 aa  1033  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.983538  hitchhiker  7.05515e-09 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1850  DNA gyrase subunit B  48.2 
 
 
769 aa  731  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4209  DNA gyrase subunit B  66.46 
 
 
804 aa  1099  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00242077  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3912  DNA gyrase subunit B  66.46 
 
 
804 aa  1099  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.139583  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00445  DNA gyrase subunit B  65.84 
 
 
805 aa  1081  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0005  DNA gyrase, B subunit  50.43 
 
 
801 aa  752  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0005  DNA gyrase subunit B  64.75 
 
 
810 aa  1030  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.124529  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1873  DNA gyrase, B subunit  54.69 
 
 
813 aa  825  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0004  DNA gyrase subunit B  64.89 
 
 
806 aa  1058  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.045671  normal  0.178752 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2802  DNA gyrase subunit B  56.02 
 
 
826 aa  862  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0885593 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0121  DNA gyrase subunit B  53.6 
 
 
810 aa  825  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.853058  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00040  DNA gyrase subunit B  66.05 
 
 
806 aa  1062  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0003  DNA gyrase subunit B  59.13 
 
 
822 aa  967  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0101  DNA gyrase subunit B  59.13 
 
 
822 aa  967  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0087  DNA gyrase subunit B  59.13 
 
 
822 aa  967  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0004  DNA gyrase, B subunit  64.55 
 
 
805 aa  1038  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0015  DNA gyrase subunit B  54.89 
 
 
811 aa  821  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0003  DNA gyrase, B subunit  55.23 
 
 
874 aa  863  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.202809  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4272  DNA gyrase subunit B  55.28 
 
 
811 aa  852  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.540261 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2235  DNA gyrase subunit B  59.13 
 
 
822 aa  967  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0003  DNA gyrase subunit B  57.99 
 
 
851 aa  915  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0003  DNA gyrase subunit B  58.39 
 
 
842 aa  928  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267231  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0004  DNA gyrase subunit B  66.63 
 
 
803 aa  1083  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.428577  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0004  DNA gyrase, B subunit  64.43 
 
 
805 aa  1047  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.279894  hitchhiker  7.31139e-05 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0006  DNA gyrase, B subunit  57.31 
 
 
638 aa  638  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.014329  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0013  DNA gyrase subunit B  55.86 
 
 
811 aa  876  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0003  DNA gyrase, B subunit  55.41 
 
 
868 aa  879  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0008  DNA gyrase subunit B  54.96 
 
 
812 aa  827  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2886  DNA gyrase, B subunit  54.13 
 
 
812 aa  838  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0004  DNA gyrase, B subunit  55.38 
 
 
794 aa  843  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2504  DNA gyrase subunit B  66.5 
 
 
805 aa  1088  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.892795  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0003  DNA gyrase subunit B  48.77 
 
 
772 aa  747  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0004  DNA gyrase subunit B  66.54 
 
 
806 aa  1074  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0004  DNA gyrase, B subunit  64.26 
 
 
805 aa  1040  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.195183  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0004  DNA gyrase subunit B  65.84 
 
 
804 aa  1079  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.083955  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0006  DNA gyrase subunit B  55 
 
 
811 aa  825  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  3.11968e-05 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0003  DNA gyrase, B subunit  56.79 
 
 
832 aa  901  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03526  hypothetical protein  66.46 
 
 
804 aa  1099  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0004  DNA gyrase, B subunit  53.5 
 
 
818 aa  802  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.215685  normal  0.853499 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0004  DNA gyrase subunit B  54.04 
 
 
813 aa  818  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0003  DNA gyrase subunit B  58.55 
 
 
833 aa  923  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0004  DNA gyrase, B subunit  64.26 
 
 
805 aa  1039  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.405147  hitchhiker  3.01601e-09 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0004  DNA gyrase, B subunit  55.38 
 
 
802 aa  841  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1905  DNA gyrase, B subunit  55.39 
 
 
821 aa  861  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.222448 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0964  DNA gyrase, B subunit  48.46 
 
 
812 aa  711  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.780109  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2509  DNA gyrase, B subunit  54.29 
 
 
815 aa  821  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.684538 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  57.27 
 
 
640 aa  659  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03480  DNA gyrase subunit B  60.25 
 
 
814 aa  951  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0003  DNA gyrase subunit B  58.39 
 
 
842 aa  928  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0003  DNA gyrase subunit B  59.22 
 
 
823 aa  963  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0806649  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4226  DNA gyrase subunit B  66.46 
 
 
804 aa  1097  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.765134  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0015  DNA gyrase, B subunit  56.36 
 
 
644 aa  639  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  unclonable  1.55334e-06 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0004  DNA gyrase subunit B  59.16 
 
 
819 aa  930  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0307059 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5127  DNA gyrase subunit B  66.46 
 
 
805 aa  1099  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50645  normal  0.271851 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0012  DNA gyrase subunit B  65.13 
 
 
805 aa  1060  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.100397  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0004  DNA gyrase, B subunit  61.67 
 
 
801 aa  966  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0231697  decreased coverage  0.000608059 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4227  DNA gyrase subunit B  66.33 
 
 
804 aa  1098  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4063  DNA gyrase subunit B  66.33 
 
 
804 aa  1098  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.795543  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0004  DNA gyrase, B subunit  55.61 
 
 
796 aa  854  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0004  DNA gyrase, B subunit  51.06 
 
 
795 aa  738  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00006  DNA gyrase subunit B  66 
 
 
806 aa  1076  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00261354  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1622  DNA gyrase, B subunit  47.51 
 
 
786 aa  721  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4047  DNA gyrase subunit B  66.33 
 
 
804 aa  1098  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4169  DNA gyrase subunit B  66.33 
 
 
804 aa  1098  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.994459  normal  0.269221 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4120  DNA gyrase subunit B  66.33 
 
 
804 aa  1098  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1285  DNA gyrase, B subunit  45.47 
 
 
852 aa  679  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0005  DNA gyrase, B subunit  48.98 
 
 
825 aa  731  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  1.46448e-06 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0003  DNA gyrase subunit B  59.49 
 
 
823 aa  964  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.211892  hitchhiker  0.00365115 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0004  DNA gyrase subunit B  66.46 
 
 
804 aa  1099  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.873229  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0004  DNA gyrase subunit B  65.71 
 
 
804 aa  1088  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0003  DNA gyrase, B subunit  61.67 
 
 
800 aa  966  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0157  DNA gyrase subunit B  52.98 
 
 
830 aa  787  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.374605  normal  0.0722836 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0006  DNA gyrase subunit B  64.89 
 
 
806 aa  1060  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  55.97 
 
 
633 aa  654  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  6.95632e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2083  DNA gyrase, B subunit  50.31 
 
 
798 aa  741  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2577  DNA gyrase, B subunit  54.29 
 
 
815 aa  820  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0788764  normal  0.769823 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4174  DNA gyrase subunit B  65.71 
 
 
804 aa  1088  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.274174  normal  0.0336166 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0005  DNA gyrase, B subunit  64.75 
 
 
808 aa  1030  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  6.24797e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0003  DNA gyrase subunit B  58.85 
 
 
824 aa  966  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326353  hitchhiker  0.000981669 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0003  DNA gyrase, B subunit  56.01 
 
 
859 aa  881  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.202279  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2800  DNA gyrase, B subunit  54.29 
 
 
815 aa  820  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.376674  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>