58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1704 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1704  nucleolar GTP-binding 1  100 
 
 		 154 aa  299  9e-81  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1615  hypothetical protein  42.25 
 
 		 151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0971  protein of unknown function DUF107  44.83 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.160889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0501  hypothetical protein  48.18 
 
 		 152 aa  108  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0505  protein of unknown function DUF107  37.86 
 
 		 147 aa  95.1  3e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1335  hypothetical protein  33.12 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0361  hypothetical protein  32.85 
 
 		 141 aa  53.5  0.0000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.213386 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1881  hypothetical protein  29.03 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0471447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0062  hypothetical protein  26.97 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0560345  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1013  protein of unknown function DUF107  30.34 
 
 		 455 aa  52.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0062  hypothetical protein  26.32 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.351134  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4268  hypothetical protein  27.21 
 
 		 153 aa  49.7  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2913  hypothetical protein  36.46 
 
 		 423 aa  49.7  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0289  hypothetical protein  28.97 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.285754  normal  0.174624 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1889  hypothetical protein  32.19 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0558  hypothetical protein  29.66 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2105  hypothetical protein  32.19 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01316  hypothetical protein  25.62 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2074  hypothetical protein  32.88 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1927  hypothetical protein  32.88 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3263  hypothetical protein  33.33 
 
 		 143 aa  47.4  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.154765  normal  0.527503 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3306  protein of unknown function DUF107  27.59 
 
 		 153 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.471898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2063  hypothetical protein  31.51 
 
 		 142 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00757659  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0842  protein of unknown function DUF107  29.45 
 
 		 197 aa  46.6  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0864  protein of unknown function DUF107  31.5 
 
 		 447 aa  47  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0908581  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3608  protein of unknown function DUF107  27.59 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3244  hypothetical protein  31.51 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00265616  normal  0.45038 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2705  hypothetical protein  26.77 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1923  hypothetical protein  31.72 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.126265  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0749  protein of unknown function DUF107  27.01 
 
 		 464 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.482474 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0819  protein of unknown function DUF107  26.28 
 
 		 462 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.273876  normal  0.314261 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1879  hypothetical protein  31.51 
 
 		 142 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1505  hypothetical protein  29.71 
 
 		 147 aa  44.7  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.121654  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1115  hypothetical protein  32.29 
 
 		 126 aa  44.7  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4889  hypothetical protein  27.66 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0908212  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2145  hypothetical protein  31.51 
 
 		 142 aa  44.3  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2173  hypothetical protein  31.51 
 
 		 142 aa  44.3  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14650  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  29.23 
 
 		 144 aa  43.9  0.0009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000389934  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1329  hypothetical protein  26.67 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.259806  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2226  putative integral membrane protein  38.33 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1333  hypothetical protein  32.29 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4711  hypothetical protein  26.39 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.396133 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0496  hypothetical protein  27.12 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.41983  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2309  hypothetical protein  27.45 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2052  protein of unknown function DUF107  32 
 
 		 157 aa  43.1  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0403  hypothetical protein  30.41 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1144  hypothetical protein  29.63 
 
 		 126 aa  42  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4625  hypothetical protein  27.86 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.165584 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0471  nodulation efficiency protein NfeD  28.66 
 
 		 481 aa  41.6  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2311  protein of unknown function DUF107  36.11 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00380708  hitchhiker  0.000930423 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3440  protein of unknown function DUF107  31.37 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.782019  normal  0.877312 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1187  protein of unknown function DUF107  28.67 
 
 		 151 aa  40.8  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1642  membrane-bound serine protease (ClpP class)  30.15 
 
 		 455 aa  40.8  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.068778  normal  0.0912481 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1951  hypothetical protein  31.03 
 
 		 154 aa  40.8  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.370736  normal  0.0226545 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0941  protein of unknown function DUF107  26.72 
 
 		 425 aa  40.4  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_751  hypothetical protein  31.43 
 
 		 96 aa  40.4  0.01  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0185287  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2736  hypothetical protein  22 
 
 		 153 aa  40  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355478  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4833  SURF1 domain-containing protein  25.69 
 
 		 143 aa  40.4  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474537  normal  0.511856 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>