26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1660 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1660  hypothetical protein  100 
 
 
201 aa  419  1e-116  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000145701  hitchhiker  0.0000000000565897 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2355  hypothetical protein  58.6 
 
 
188 aa  227  1e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0178  hypothetical protein  58.82 
 
 
200 aa  225  3e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0520859  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0023  hypothetical protein  54.05 
 
 
197 aa  205  3e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0930619 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2541  hypothetical protein  50.51 
 
 
191 aa  195  3e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.441359 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1361  hypothetical protein  48.63 
 
 
188 aa  175  4e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0012643  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0137  hypothetical protein  42.62 
 
 
228 aa  155  3e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0458  conserved hypothetical protein-like protein  47.65 
 
 
213 aa  149  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2221  hypothetical protein  40.91 
 
 
208 aa  149  3e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2027  hypothetical protein  40.86 
 
 
189 aa  148  5e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.968984  normal  0.751952 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1028  hypothetical protein  41.49 
 
 
203 aa  148  5e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0861228 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1630  hypothetical protein  37.31 
 
 
204 aa  144  7.0000000000000006e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.856032  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1444  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  39.32 
 
 
332 aa  144  9e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1432  hypothetical protein  38.15 
 
 
289 aa  114  8.999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0804678 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1373  hypothetical protein  37.82 
 
 
287 aa  111  6e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1487  hypothetical protein  36.45 
 
 
282 aa  111  9e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.204521  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0624  hypothetical protein  41.22 
 
 
550 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.802185  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3083  hypothetical protein  40.82 
 
 
615 aa  108  6e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5195  conserved hypothetical protein-like protein  39.46 
 
 
617 aa  105  5e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2419  hypothetical protein  39.87 
 
 
520 aa  103  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.226401 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1249  hypothetical protein  35.63 
 
 
252 aa  102  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0545  hypothetical protein  36.49 
 
 
556 aa  94  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0168127  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1677  hypothetical protein  29.59 
 
 
257 aa  71.2  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2102  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  32.19 
 
 
237 aa  65.9  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0513  hypothetical protein  31.65 
 
 
232 aa  64.3  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.651674  normal  0.711601 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0596  hypothetical protein  25.44 
 
 
257 aa  56.2  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0844954  normal  0.105487 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>