153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1648 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1648  hypothetical protein  100 
 
 
351 aa  717    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0329926 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6599  chorismate mutase  35.34 
 
 
375 aa  197  3e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0880  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  23.81 
 
 
373 aa  118  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.404976  normal  0.139237 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3079  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  23.81 
 
 
373 aa  115  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.394407  normal  0.0294046 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3219  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  24.02 
 
 
373 aa  109  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3356  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  24.02 
 
 
373 aa  109  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2882  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  23.18 
 
 
373 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0721758  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1588  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  23.68 
 
 
375 aa  108  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3483  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  23.46 
 
 
373 aa  108  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.250939 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3839  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  22.69 
 
 
373 aa  107  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00182808  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2863  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  23.18 
 
 
373 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0273979 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2996  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  22.91 
 
 
373 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02489  fused chorismate mutase T/prephenate dehydrogenase  22.69 
 
 
373 aa  106  5e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02453  hypothetical protein  22.69 
 
 
373 aa  106  5e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.58394  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2884  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  22.91 
 
 
373 aa  106  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.28721 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2987  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  22.69 
 
 
373 aa  106  5e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000572711  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2813  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  22.91 
 
 
373 aa  106  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2757  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  22.69 
 
 
373 aa  106  5e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176639  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2884  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  22.69 
 
 
373 aa  107  5e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0271953  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1083  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  22.69 
 
 
373 aa  106  5e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.676844  hitchhiker  0.000106918 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2752  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  22.69 
 
 
373 aa  106  5e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000708785  normal  0.0483395 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1074  chorismate mutase  22.69 
 
 
373 aa  105  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.134673  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01712  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  24.18 
 
 
384 aa  104  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.149825  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0654  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  23.76 
 
 
377 aa  103  4e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00993  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  23.4 
 
 
375 aa  102  7e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3147  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  22.69 
 
 
373 aa  102  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004405  chorismate mutase I/cyclohexadienyl dehydrogenase  22.75 
 
 
375 aa  101  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1132  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  22.69 
 
 
373 aa  101  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1054  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  23.96 
 
 
384 aa  100  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.189276  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0227  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  22.19 
 
 
375 aa  100  5e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0671  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  24.1 
 
 
374 aa  99.8  6e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.106766  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3012  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  23.06 
 
 
379 aa  98.2  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0411144  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2854  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  23.25 
 
 
373 aa  97.8  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.663764  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2915  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  24.02 
 
 
383 aa  97.1  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.449795  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1173  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  22.97 
 
 
383 aa  97.1  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00322769  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0287  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  21.81 
 
 
375 aa  95.9  8e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1292  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  22.69 
 
 
383 aa  95.9  9e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0548711  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2833  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  22.78 
 
 
379 aa  95.5  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00724041  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2915  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  22.78 
 
 
379 aa  95.5  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0333151  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1215  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  22.35 
 
 
383 aa  95.1  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000459834  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3098  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  22.41 
 
 
379 aa  95.5  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000040953  normal  0.11712 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1362  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  22.65 
 
 
379 aa  94.7  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1997  prephenate dehydrogenase  26.3 
 
 
437 aa  94.4  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1068  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  23.68 
 
 
384 aa  94.7  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0518794  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0998  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  23.25 
 
 
372 aa  94.7  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1259  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  22.35 
 
 
383 aa  94.7  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0378227  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0545  prephenate dehydrogenase  27.8 
 
 
283 aa  94  4e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0894  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  22.5 
 
 
379 aa  92  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121322  normal  0.591266 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0924  prephenate dehydrogenase  24.25 
 
 
505 aa  90.5  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1259  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  23.68 
 
 
379 aa  90.1  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00675448  hitchhiker  0.000301963 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0061  prephenate dehydrogenase  23.7 
 
 
443 aa  89  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.532803  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0760  prephenate dehydrogenase  23.7 
 
 
443 aa  89  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.504632  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1785  prephenate dehydrogenase  27.46 
 
 
250 aa  87.8  2e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1164  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  21.85 
 
 
379 aa  88.6  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00398091  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1158  prephenate dehydrogenase  23.25 
 
 
439 aa  87.4  3e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1024  prephenate dehydrogenase  24.36 
 
 
447 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3953  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  22.41 
 
 
381 aa  84  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0460  prephenate dehydrogenase  26.41 
 
 
287 aa  84  0.000000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000113439  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2608  Prephenate dehydrogenase  26.05 
 
 
283 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.749464 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0599  hypothetical protein  26.55 
 
 
288 aa  80.9  0.00000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0114109  normal  0.0489829 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0437  prephenate dehydrogenase  26.72 
 
 
288 aa  80.5  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000137716  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_403  prephenate dehydrogenase  26.84 
 
 
287 aa  80.1  0.00000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0827  prephenate dehydrogenase  22.96 
 
 
439 aa  80.1  0.00000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.666183  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0799  prephenate dehydrogenase  28.33 
 
 
250 aa  78.2  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.759284  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1502  prephenate dehydrogenase  24.24 
 
 
288 aa  77.8  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2269  Prephenate dehydrogenase  26.01 
 
 
371 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00760536 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1605  prephenate dehydrogenase  26.61 
 
 
374 aa  77.8  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.294712  normal  0.381468 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2749  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  22.69 
 
 
384 aa  77  0.0000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.186478  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1560  prephenate dehydrogenase  26.55 
 
 
276 aa  75.5  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23140  chorismate mutase, clade 2  24.45 
 
 
706 aa  74.7  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.839893  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0118  Prephenate dehydrogenase  26.25 
 
 
262 aa  75.1  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1300  prephenate dehydrogenase  27.08 
 
 
274 aa  72.8  0.000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.580426  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01188  prephenate dehydrogenase  28.51 
 
 
375 aa  72  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.282588  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1946  prephenate dehydrogenase  24.45 
 
 
279 aa  71.2  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.772286  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0808  chorismate mutase  24.44 
 
 
333 aa  70.5  0.00000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0594729  normal  0.450237 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2473  prephenate dehydrogenase  25.19 
 
 
258 aa  66.6  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.413514  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0890  prephenate dehydrogenase  24.22 
 
 
253 aa  67  0.0000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1033  prephenate dehydrogenase  24.42 
 
 
274 aa  65.5  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.393372  normal  0.590632 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1453  prephenate dehydrogenase  26.42 
 
 
373 aa  64.3  0.000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.542491  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1274  prephenate dehydrogenase  26.07 
 
 
245 aa  64.3  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.885753  normal  0.198911 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1747  Prephenate dehydrogenase  22.61 
 
 
263 aa  63.9  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2024  prephenate dehydrogenase  27.27 
 
 
250 aa  63.9  0.000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4586  Prephenate dehydrogenase  23.36 
 
 
294 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1510  prephenate dehydrogenase  26.42 
 
 
373 aa  63.9  0.000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1278  chorismate mutase  22.85 
 
 
346 aa  58.5  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2811  Prephenate dehydrogenase  22.47 
 
 
259 aa  57.8  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1877  chorismate mutase / prephenate dehydrogenase  23.4 
 
 
344 aa  57  0.0000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.786603 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0997  prephenate dehydrogenase  25.66 
 
 
237 aa  55.5  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.119392  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0972  prephenate dehydrogenase  26.5 
 
 
317 aa  54.3  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.161395  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3793  prephenate dehydrogenase  22.06 
 
 
282 aa  54.7  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3767  prephenate dehydrogenase  22.87 
 
 
242 aa  50.1  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000142598  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0943  prephenate dehydrogenase  21.7 
 
 
276 aa  49.7  0.00009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000180721  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6542  Prephenate dehydrogenase  26.74 
 
 
285 aa  48.5  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2807  Prephenate dehydrogenase  27.27 
 
 
289 aa  49.3  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1369  Prephenate dehydrogenase  24.46 
 
 
257 aa  48.9  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3943  prephenate dehydrogenase  25.71 
 
 
281 aa  49.3  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0230  Prephenate dehydrogenase  23.01 
 
 
275 aa  48.1  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2225  prephenate dehydrogenase  21.89 
 
 
276 aa  48.1  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000370984  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0546  class I/II aminotransferase  29.41 
 
 
456 aa  48.1  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0165  prephenate dehydrogenase  27.27 
 
 
275 aa  47.8  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000395758  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>