More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1617 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1617  hypothetical protein  100 
 
 		 202 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0267  radical SAM domain-containing protein  54.95 
 
 		 202 aa  228  3e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.953431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2209  radical SAM domain-containing protein  54.46 
 
 		 202 aa  226  1e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2832  radical SAM family protein  49.75 
 
 		 234 aa  209  3e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.641503  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0283  Radical SAM domain protein  48.51 
 
 		 202 aa  187  1e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.173391  normal  0.103255 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1450  Radical SAM domain protein  43.84 
 
 		 209 aa  181  5.0000000000000004e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0779  Radical SAM domain protein  45.41 
 
 		 223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141038  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2336  radical SAM family protein  42.65 
 
 		 212 aa  167  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650219  normal  0.0607632 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2203  radical activating enzyme  46.57 
 
 		 216 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000727675 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2711  radical SAM family protein  44.61 
 
 		 234 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4643  radical SAM family Fe-S protein  41.36 
 
 		 226 aa  159  4e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.726839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01567  radical activating enzyme  43.14 
 
 		 213 aa  158  5e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3107  radical SAM family protein  43.69 
 
 		 210 aa  158  6e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3632  Radical SAM domain protein  41.46 
 
 		 211 aa  155  4e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.597891 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2658  Radical SAM domain protein  42.86 
 
 		 210 aa  154  6e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0802797  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3116  Radical SAM domain protein  42.65 
 
 		 233 aa  154  7e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.353505  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2562  Radical SAM domain protein  41.87 
 
 		 210 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00464069  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1298  radical SAM family protein  41.87 
 
 		 210 aa  153  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2467  radical SAM domain-containing protein  41.87 
 
 		 210 aa  152  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0569  Radical SAM domain protein  41.95 
 
 		 232 aa  151  7e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.241409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2226  putative radical activating enzyme  42.16 
 
 		 227 aa  151  7e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0952  radical SAM domain-containing protein  42.16 
 
 		 217 aa  149  3e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0717091  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1232  radical activating enzyme family protein  43.14 
 
 		 215 aa  149  4e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.248382  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0896  radical SAM domain-containing protein  40.45 
 
 		 245 aa  148  7e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116029 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4533  radical activating enzyme  41.46 
 
 		 215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1071  radical activating enzyme  41.67 
 
 		 217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0749004  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4050  radical SAM family protein  42.16 
 
 		 212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1225  radical SAM domain protein  40.98 
 
 		 215 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.879338 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4193  radical SAM domain-containing protein  41.35 
 
 		 215 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1254  radical SAM domain-containing protein  40.98 
 
 		 215 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.04187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3990  radical SAM domain-containing protein  42.58 
 
 		 215 aa  145  5e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0736  radical activating enzyme  39.27 
 
 		 244 aa  144  7.0000000000000006e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.114676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4399  radical SAM family protein  40.49 
 
 		 215 aa  144  9e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2526  putative radical activating enzyme  41.87 
 
 		 216 aa  144  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0497  radical SAM domain-containing protein  42.16 
 
 		 212 aa  142  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51680  radical activating enzyme  40.49 
 
 		 264 aa  142  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000920323  hitchhiker  0.00150868 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1985  radical SAM domain-containing protein  41.26 
 
 		 215 aa  141  5e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3969  radical SAM domain protein  40.38 
 
 		 215 aa  141  8e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0978763  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1280  radical SAM domain-containing protein  40.98 
 
 		 226 aa  140  9e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.281332  normal  0.805859 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0724  radical SAM family protein  38.36 
 
 		 244 aa  140  9e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0196  Radical SAM domain protein  39.32 
 
 		 225 aa  139  3e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00186135  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0178  radical SAM domain-containing protein  39.71 
 
 		 213 aa  139  3.9999999999999997e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.866793  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2016  queuosine biosynthesis protein  39.71 
 
 		 213 aa  139  3.9999999999999997e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.708443  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1418  radical SAM family protein  39.9 
 
 		 215 aa  137  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0538  Radical SAM domain protein  40.2 
 
 		 227 aa  137  1e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128544  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2024  hypothetical protein  39.22 
 
 		 217 aa  137  2e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0070  Radical SAM domain protein  39.71 
 
 		 214 aa  136  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.457092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0069  radical SAM domain protein  39.71 
 
 		 214 aa  136  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2019  hypothetical protein  39.71 
 
 		 217 aa  134  7.000000000000001e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1950  Radical SAM domain protein  38.01 
 
 		 253 aa  134  9e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0148  radical SAM domain-containing protein  40.1 
 
 		 213 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36610  Radical SAM protein  39.04 
 
 		 193 aa  126  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506067  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0505  radical activating enzyme, putative  37.44 
 
 		 226 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.759738  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1766  Radical SAM domain protein  36.36 
 
 		 220 aa  117  7.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.988544  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1702  Radical SAM domain protein  35.41 
 
 		 222 aa  112  3e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.86531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1879  Radical SAM domain protein  34.76 
 
 		 223 aa  107  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00268762 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1687  Radical SAM domain protein  50 
 
 		 208 aa  105  5e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4124  radical SAM domain-containing protein  33.86 
 
 		 230 aa  104  9e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2111  Radical SAM domain protein  34.78 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1943  Radical SAM domain protein  45.63 
 
 		 260 aa  98.6  6e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1979  radical SAM domain-containing protein  33.02 
 
 		 223 aa  97.8  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0430  radical activating enzyme, putative  32.7 
 
 		 223 aa  97.1  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0808  radical SAM domain-containing protein  32 
 
 		 223 aa  94  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1319  Radical SAM domain protein  32.21 
 
 		 210 aa  93.6  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2280  Radical SAM domain protein  32.23 
 
 		 223 aa  93.2  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.28532  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3058  Radical SAM domain protein  38.69 
 
 		 258 aa  93.2  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1091  radical SAM domain-containing protein  35.24 
 
 		 216 aa  91.7  7e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.598204 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0569  Radical SAM domain protein  35.03 
 
 		 220 aa  91.7  7e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1974  radical SAM domain-containing protein  44.55 
 
 		 210 aa  89.7  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0977  radical SAM domain-containing protein  31.86 
 
 		 223 aa  90.1  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3313  radical SAM domain-containing protein  31.86 
 
 		 223 aa  90.1  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.566212  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0707  Radical SAM domain protein  37.36 
 
 		 227 aa  90.5  2e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.654115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3444  radical SAM domain-containing protein  31.86 
 
 		 223 aa  90.1  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0822  hypothetical protein  30.4 
 
 		 223 aa  89  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0591  Radical SAM domain protein  42.61 
 
 		 258 aa  89  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0642  radical SAM domain-containing protein  40.13 
 
 		 216 aa  89  4e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2045  radical SAM family protein  29.69 
 
 		 235 aa  89  4e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0659  Radical SAM domain protein  29.25 
 
 		 212 aa  88.2  9e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.815067  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02622  hypothetical protein  30.84 
 
 		 223 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000486823  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0912  conserved hypothetical protein  30.84 
 
 		 223 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000203902  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2918  hypothetical protein  30.84 
 
 		 223 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  3.7449199999999994e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4033  hypothetical protein  30.84 
 
 		 223 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000488158  normal  0.75822 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2910  hypothetical protein  30.84 
 
 		 223 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000863859  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02584  hypothetical protein  30.84 
 
 		 223 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000638386  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3080  hypothetical protein  30.84 
 
 		 223 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000477114  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1392  Radical SAM domain protein  33.18 
 
 		 274 aa  87.4  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1974  radical activating enzyme, putative  33.87 
 
 		 251 aa  86.7  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3099  hypothetical protein  30.84 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000109551  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2837  radical SAM domain-containing protein  45.37 
 
 		 243 aa  87  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0935  hypothetical protein  30.84 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000274693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1899  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  33.87 
 
 		 247 aa  86.3  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3084  radical SAM domain protein  29.65 
 
 		 223 aa  85.5  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000000255818  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2236  organic radical activating protein  28.99 
 
 		 205 aa  85.9  4e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3265  radical SAM domain-containing protein  29.65 
 
 		 223 aa  85.5  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000025013  normal  0.189038 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3167  hypothetical protein  29.65 
 
 		 223 aa  85.5  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000157264  normal  0.548962 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3148  radical SAM domain-containing protein  29.65 
 
 		 223 aa  85.5  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000734892  normal  0.311004 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1959  radical SAM family protein  31.56 
 
 		 235 aa  85.5  5e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1008  radical SAM domain-containing protein  30.41 
 
 		 246 aa  85.1  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3229  radical SAM domain-containing protein  30.22 
 
 		 223 aa  85.1  7e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000624181  normal  0.126781 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3109  radical SAM domain protein  29.65 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000108893  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>