48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1588 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1588  hypothetical protein  100 
 
 		 270 aa  535  1e-151  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000117869  hitchhiker  0.00161321 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1587  hypothetical protein  53.16 
 
 		 277 aa  272  5.000000000000001e-72  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000110361  hitchhiker  0.00369303 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1589  hypothetical protein  37.86 
 
 		 264 aa  150  3e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000654588  hitchhiker  0.00067208 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0665  hypothetical protein  32.64 
 
 		 245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.646627  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1820  protein of unknown function DUF1624  35.89 
 
 		 261 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0347  hypothetical protein  32.95 
 
 		 245 aa  109  5e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000605459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1147  hypothetical protein  31.69 
 
 		 254 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1683  hypothetical protein  30.92 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1385  hypothetical protein  31.69 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1538  hypothetical protein  29.6 
 
 		 249 aa  98.2  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00890695  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1291  hypothetical protein  31.4 
 
 		 245 aa  96.7  4e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.687522 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0043  hypothetical protein  33.59 
 
 		 263 aa  92.8  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0143  hypothetical protein  28.17 
 
 		 253 aa  90.9  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2070  protein of unknown function DUF1624  28.86 
 
 		 235 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.250094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0429  hypothetical protein  29.58 
 
 		 229 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000311918  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0098  hypothetical protein  28.28 
 
 		 244 aa  76.6  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0097  hypothetical protein  28.98 
 
 		 254 aa  73.6  0.000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1793  hypothetical protein  25.2 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00327  hypothetical protein  28.11 
 
 		 232 aa  65.9  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0080  protein of unknown function DUF1624  27.27 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000683778  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4134  hypothetical protein  26.1 
 
 		 244 aa  62  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2615  hypothetical protein  26.09 
 
 		 322 aa  57  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.130361  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1829  hypothetical protein  25.38 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.390473 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2013  hypothetical protein  24.26 
 
 		 326 aa  55.5  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.777902  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1035  hypothetical protein  24.8 
 
 		 365 aa  55.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.138536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2737  hypothetical protein  29.27 
 
 		 339 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.891818 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1883  protein of unknown function DUF1624  42.31 
 
 		 334 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3006  hypothetical protein  30 
 
 		 328 aa  52  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.166518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1452  protein of unknown function DUF1624  24.66 
 
 		 411 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0984  hypothetical protein  27.42 
 
 		 401 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3195  protein of unknown function DUF1624  30.82 
 
 		 328 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.856715 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2413  hypothetical protein  24.12 
 
 		 258 aa  50.1  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.248574  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1178  hypothetical protein  24.13 
 
 		 328 aa  49.3  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0102548  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3231  protein of unknown function DUF1624  29.44 
 
 		 328 aa  48.9  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.356551 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1864  protein of unknown function DUF1624  25.29 
 
 		 329 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.161953  normal  0.0500445 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1157  hypothetical protein  27.85 
 
 		 388 aa  48.5  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1045  hypothetical protein  27.62 
 
 		 401 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0062609 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2032  protein of unknown function DUF1624  24.21 
 
 		 256 aa  48.5  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0980  hypothetical protein  27.02 
 
 		 401 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.260122 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1261  hypothetical protein  25.51 
 
 		 335 aa  47.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1762  hypothetical protein  24.9 
 
 		 243 aa  47  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.175449 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1871  hypothetical protein  23.95 
 
 		 263 aa  45.4  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0219449 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1450  hypothetical protein  25.48 
 
 		 411 aa  45.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.763514  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1672  hypothetical protein  23.81 
 
 		 256 aa  44.7  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4326  hypothetical protein  27.23 
 
 		 368 aa  44.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2952  hypothetical protein  21.92 
 
 		 264 aa  42.7  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2880  hypothetical protein  30.86 
 
 		 418 aa  42.4  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3464  hypothetical protein  26.52 
 
 		 424 aa  42  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0282982 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>