40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1552 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1552  hypothetical protein  100 
 
 		 716 aa  1469    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.937373  decreased coverage  0.0000146209 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  28.93 
 
 		 409 aa  54.7  0.000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  28.1 
 
 		 409 aa  51.2  0.00007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4000  lipoprotein NlpI  29.66 
 
 		 294 aa  50.1  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.825215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0494  lipoprotein NlpI  29.66 
 
 		 294 aa  50.4  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0212481  normal  0.630766 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3725  lipoprotein NlpI  29.66 
 
 		 294 aa  50.1  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.38632  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3591  lipoprotein NlpI  29.66 
 
 		 294 aa  50.1  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3537  lipoprotein NlpI  30.51 
 
 		 294 aa  50.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3600  lipoprotein NlpI  30.51 
 
 		 294 aa  49.7  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0352311 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3574  lipoprotein NlpI  30.51 
 
 		 294 aa  50.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3468  lipoprotein NlpI  30.51 
 
 		 294 aa  50.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3468  lipoprotein NlpI  30.51 
 
 		 294 aa  50.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3636  lipoprotein NlpI  30.51 
 
 		 294 aa  50.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0590  lipoprotein NlpI  30.77 
 
 		 294 aa  50.1  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573815  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0813  lipoprotein NlpI  30.77 
 
 		 294 aa  50.1  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0542  TPR repeat-containing protein  29.66 
 
 		 294 aa  48.9  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.622793  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3608  lipoprotein NlpI  29.66 
 
 		 294 aa  48.9  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3459  lipoprotein NlpI  29.66 
 
 		 294 aa  48.9  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.354036 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0535  lipoprotein NlpI  29.66 
 
 		 294 aa  48.9  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317241 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4482  lipoprotein NlpI  29.66 
 
 		 294 aa  48.9  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02981  hypothetical protein  29.66 
 
 		 294 aa  48.9  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3645  lipoprotein NlpI  29.66 
 
 		 294 aa  48.9  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03030  hypothetical protein  29.66 
 
 		 294 aa  48.9  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  27 
 
 		 265 aa  48.5  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3355  lipoprotein NlpI  29.66 
 
 		 294 aa  48.9  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  30.19 
 
 		 473 aa  47.8  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0912  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 		 748 aa  47  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.795031  hitchhiker  0.00626987 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3341  lipoprotein NlpI  30.77 
 
 		 294 aa  47.4  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3460  lipoprotein NlpI  30.7 
 
 		 294 aa  47  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.820056  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  28.18 
 
 		 409 aa  46.6  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  29.13 
 
 		 878 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.13 
 
 		 810 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4327  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  46.03 
 
 		 253 aa  45.8  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.813272  hitchhiker  0.000000000191123 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  25.2 
 
 		 833 aa  45.8  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1523  Tfp pilus assembly protein PilF-like protein  31.87 
 
 		 202 aa  45.4  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.546002  normal  0.0791762 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  29.79 
 
 		 1013 aa  45.4  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  33.33 
 
 		 560 aa  44.7  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0678  extracellular ligand-binding receptor  32.32 
 
 		 1073 aa  44.7  0.007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  25.1 
 
 		 562 aa  44.3  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  29 
 
 		 576 aa  44.3  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>