21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1514 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1514  signal recognition particle, subunit SRP19 (srp19)  100 
 
 		 90 aa  185  2e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.917345  normal  0.846669 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0471  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  47.19 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0373645  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2309  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  46.25 
 
 		 91 aa  78.6  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0613645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2483  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  45.98 
 
 		 93 aa  71.6  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0334  Ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  44.83 
 
 		 90 aa  71.6  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.725093 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0274  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  40.24 
 
 		 113 aa  60.5  0.000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0359  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  39.76 
 
 		 101 aa  59.3  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.473363  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1413  Ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  32.53 
 
 		 87 aa  55.1  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0717  Ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  34.83 
 
 		 92 aa  54.3  0.0000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2505  Ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  37.93 
 
 		 92 aa  51.6  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0811704  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60739  signal recognition particle subunit  43.28 
 
 		 276 aa  51.6  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.022276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1829  Ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  36.92 
 
 		 93 aa  49.7  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02240  signal recognition particle protein, putative  42.65 
 
 		 355 aa  48.9  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2790  Ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  35.96 
 
 		 92 aa  48.9  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1273  signal recognition particle protein Srp19  29.27 
 
 		 103 aa  48.9  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.831098  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00643  signal recognition particle 19 kDa protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G16820)  42.42 
 
 		 257 aa  49.7  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3604  Ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  37.04 
 
 		 93 aa  48.5  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.653493  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1560  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  26.25 
 
 		 89 aa  43.9  0.0008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.972556  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0519  signal recognition particle, subunit SRP19  25.93 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0004  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  24.71 
 
 		 90 aa  41.6  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000181188  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0477  signal recognition particle, subunit SRP19 (srp19)  24.71 
 
 		 89 aa  41.2  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>