More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1493 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1493  hypothetical protein  100 
 
 
238 aa  491  9.999999999999999e-139  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.055606 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0724  glycosyl transferase family protein  68.62 
 
 
239 aa  326  2.0000000000000001e-88  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0205855  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0520  glycosyl transferase family 2  61.18 
 
 
238 aa  309  2e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0693  glycosyl transferase family protein  59.92 
 
 
238 aa  298  4e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0904184  normal  0.159851 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1598  glycosyl transferase family protein  59.13 
 
 
237 aa  289  3e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0505  dolichol-P-glucose synthetase  51.54 
 
 
574 aa  229  3e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1188  glycosyl transferase family 2  44.73 
 
 
606 aa  207  1e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.017563  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3029  glycosyl transferase family 2  44.77 
 
 
613 aa  205  4e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.586376  normal  0.0326144 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4696  GtrA family protein  37.39 
 
 
435 aa  161  7e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0902  GtrA family protein  36.96 
 
 
428 aa  150  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258028  normal  0.0796887 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6395  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  38.14 
 
 
402 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0941641 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0828  glycosyl transferase family 2  38.94 
 
 
422 aa  142  3e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0194792  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1939  glycosyl transferase family 2  37.44 
 
 
415 aa  142  5e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1721  glycosyl transferase family 2  37.5 
 
 
424 aa  142  6e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2133  glycosyl transferase family protein  38.94 
 
 
410 aa  141  8e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00135556  hitchhiker  0.0086677 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3989  glycosyl transferase family protein  36.56 
 
 
238 aa  141  8e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.246532  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0318  glycosyl transferase family protein  37.5 
 
 
460 aa  141  8e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.163788  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2280  glycosyl transferase family protein  38.46 
 
 
409 aa  140  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.851942  decreased coverage  0.00376489 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1923  glycosyl transferase family 2  37.17 
 
 
266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6500  glycosyl transferase family protein  37.75 
 
 
496 aa  139  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.346473  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4506  glycosyl transferase family 2  38.46 
 
 
378 aa  136  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5252  glycosyl transferase family 2  35.78 
 
 
416 aa  137  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4090  glycosyl transferase family 2  37.26 
 
 
441 aa  133  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157958  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3923  glycosyl transferase family protein  38.42 
 
 
421 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.496701  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3997  glycosyl transferase family protein  38.42 
 
 
421 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254168  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4426  glycosyl transferase family protein  36.54 
 
 
437 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.739527  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3938  glycosyl transferase family protein  38.42 
 
 
421 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.24037 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2268  glycosyl transferase family protein  34.51 
 
 
411 aa  133  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.371965  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0651  glycosyl transferase family protein  35.02 
 
 
333 aa  130  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0439  GtrA family protein  36.02 
 
 
425 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2627  glycosyl transferase family 2  33.63 
 
 
412 aa  129  6e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.97683 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0104  glycosyl transferase family 2  32.49 
 
 
255 aa  128  6e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3686  glycosyl transferase family 2  37.26 
 
 
326 aa  123  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.82646  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0242  hypothetical protein  30.04 
 
 
253 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000022045  hitchhiker  0.00000000126838 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0505  glycosyl transferase family protein  30.29 
 
 
262 aa  121  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2693  glycosyl transferase family protein  33.48 
 
 
273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.756814  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0076  glycosyl transferase family 2  31.17 
 
 
271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.737127 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1758  glycosyltransferase  29.78 
 
 
259 aa  115  7.999999999999999e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2367  family 2 glycosyl transferase  33.33 
 
 
389 aa  114  8.999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00481537 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57548  UDP-glucose:dolichyl-phosphate glucosyltransferase  30.38 
 
 
325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.547807  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1164  glycosyl transferase family protein  30.97 
 
 
320 aa  109  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.164128  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2184  glycosyl transferase family protein  32.16 
 
 
273 aa  108  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0963  glycosyl transferase family protein  30.6 
 
 
238 aa  106  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1414  glycosyl transferase family protein  31.54 
 
 
276 aa  105  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402537 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1049  glycosyl transferase family 2  30.96 
 
 
256 aa  105  7e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3213  glycosyl transferase family 2  30.9 
 
 
256 aa  105  9e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.595641 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2237  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 
267 aa  103  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2199  glycosyl transferase family 2  29.49 
 
 
289 aa  103  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0107343 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0761  glycosyl transferase family protein  30.51 
 
 
272 aa  102  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1701  glycosyl transferase family protein  31.12 
 
 
276 aa  101  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0805319 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5302  glycosyl transferase family protein  28.32 
 
 
380 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157801  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2145  glycosyl transferase family protein  28.94 
 
 
236 aa  97.8  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3994  glycosyl transferase family 2  29.95 
 
 
267 aa  96.7  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.117924  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1807  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.36 
 
 
248 aa  94.7  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2595  glycosyl transferase family protein  28.16 
 
 
256 aa  94.7  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00230887  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1456  glycosyl transferase family protein  28.5 
 
 
241 aa  94  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000411499  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1878  glycosyl transferase family 2  25.93 
 
 
597 aa  93.2  4e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1123  glycosyl transferase family protein  30.58 
 
 
251 aa  92.4  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1442  glycosyl transferase family protein  28.36 
 
 
312 aa  92.4  5e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0073  glycosyl transferase family 2  27.07 
 
 
232 aa  92  7e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3172  family 2 glycosyl transferase  27.5 
 
 
412 aa  91.3  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0506  glycosyl transferase  28.99 
 
 
332 aa  91.3  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641026  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1908  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  26.41 
 
 
780 aa  90.9  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3761  glycosyl transferase family protein  30.1 
 
 
251 aa  90.9  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000031938  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0429  glycosyl transferase  30.05 
 
 
328 aa  90.1  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.541189  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3137  glycosyl transferase family 2  28.87 
 
 
261 aa  90.5  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5816  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.13 
 
 
247 aa  90.5  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.395639  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1870  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
237 aa  90.9  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0229  glycosyl transferase family 2  29.58 
 
 
243 aa  89  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2530  glycosyl transferase family protein  26.16 
 
 
231 aa  88.2  9e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1767  glycosyl transferase family 2  29.22 
 
 
331 aa  87.8  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.969271  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8623  dolichol-p-glucose synthetase  27.23 
 
 
406 aa  88.2  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17261  glycosyl transferase family protein  28.29 
 
 
320 aa  87.8  1e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.503177  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3118  glycosyl transferase family protein  25.98 
 
 
235 aa  87.4  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000616031  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  26.7 
 
 
298 aa  87  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1980  glycosyl transferase family protein  30.05 
 
 
323 aa  87.4  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3870  glycosyl transferase family protein  27.12 
 
 
257 aa  87  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0976  glycosyl transferase family 2  28.22 
 
 
430 aa  86.7  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0359  glycosyl transferase family protein  31.03 
 
 
568 aa  86.7  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143693  normal  0.385412 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2716  glycosyl transferase family 2  30.41 
 
 
319 aa  86.7  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1880  glycosyl transferase family 2  28.5 
 
 
325 aa  86.3  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00309208 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23431  glycosyl transferase family protein  28.16 
 
 
342 aa  86.3  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07715  dolichyl-phosphate beta-glucosyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08210)  28.33 
 
 
405 aa  85.9  5e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1769  glycosyl transferase family protein  26.83 
 
 
586 aa  85.9  5e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162316  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2281  glycosyl transferase family 2  27.1 
 
 
337 aa  85.9  5e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0390263  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14090  glycosyl transferase  30.19 
 
 
264 aa  85.9  5e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0593643  normal  0.606755 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1087  glycosyltransferase  28.92 
 
 
320 aa  85.5  7e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1930  glycosyl transferase family 2  26.7 
 
 
246 aa  85.1  9e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000462816 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17141  glycosyl transferase family protein  27.18 
 
 
320 aa  85.1  9e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.517229  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2892  glycosyl transferase family protein  28.08 
 
 
329 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0153758 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19621  glycosyl transferase family protein  28.43 
 
 
320 aa  83.2  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.217021  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3976  glycosyl transferase family protein  29.77 
 
 
514 aa  82.8  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3834  glycosyl transferase family protein  29.35 
 
 
314 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1614  glycosyl transferase family protein  26.83 
 
 
324 aa  82.8  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19705  dolichyl-phosphate mannosyltransferase  24.51 
 
 
236 aa  82.4  0.000000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.872705  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16431  glycosyl transferase family protein  27.45 
 
 
321 aa  82.8  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.713365  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0111  glycosyl transferase family protein  26.32 
 
 
318 aa  82  0.000000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.375009  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2932  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  26.92 
 
 
264 aa  81.6  0.000000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000763611  hitchhiker  0.000488065 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2187  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  26.7 
 
 
246 aa  81.6  0.000000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117888  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2117  glycosyl transferase family protein  25.22 
 
 
304 aa  81.3  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  0.308153 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>