More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1489 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1489  hypothetical protein  100 
 
 
218 aa  442  1e-123  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00984888  normal  0.0109156 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0505  TrkA domain-containing protein  64.81 
 
 
229 aa  265  4e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1944  TrkA domain-containing protein  66.18 
 
 
222 aa  259  3e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.772638 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1216  TrkA-N domain protein  39.9 
 
 
229 aa  148  5e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2079  TrkA-N domain protein  39.42 
 
 
225 aa  149  5e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1213  TrkA-N domain protein  37.62 
 
 
228 aa  146  3e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0911  TrkA domain-containing protein  32.35 
 
 
221 aa  115  6e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.347676  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1809  TrkA domain-containing protein  30.92 
 
 
221 aa  113  2e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1071  TrkA domain-containing protein  30.92 
 
 
221 aa  111  7e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.551527  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0846  TrkA domain-containing protein  29.95 
 
 
221 aa  108  6e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal  0.188053 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4120  TrkA-N domain protein  38.89 
 
 
132 aa  108  7e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0914  potassium transporter peripheral membrane component  32.54 
 
 
450 aa  103  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  28.91 
 
 
218 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3757  TrkA-N domain protein  31.96 
 
 
217 aa  94.7  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  9.92935e-05  normal  0.446525 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1348  hypothetical protein  31.31 
 
 
220 aa  94.4  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0533287  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1877  potassium transporter peripheral membrane component  30.1 
 
 
445 aa  94  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.113601 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1924  TrkA-N domain protein  33.03 
 
 
231 aa  92.8  3e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0699  TrkA-N domain protein  29.19 
 
 
444 aa  92.4  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0242  TrkA-N domain protein  27.98 
 
 
221 aa  92  6e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2907  potassium transporter peripheral membrane component  31.68 
 
 
450 aa  90.5  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.37268e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0025  TrkA domain-containing protein  28.9 
 
 
221 aa  89.7  3e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0542  TrkA-N domain protein  27.78 
 
 
215 aa  89.7  3e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.840001  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_25  cation transport protein, Trk system  28.9 
 
 
221 aa  88.6  6e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00178783  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2082  TrkA-N domain protein  27.5 
 
 
218 aa  88.6  6e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.124657  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2030  potassium transporter peripheral membrane component  27.05 
 
 
465 aa  88.6  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0693486  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1590  potassium transporter peripheral membrane component  29.78 
 
 
449 aa  88.2  9e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00906485  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2085  TrkA-N domain protein  28.64 
 
 
444 aa  87.4  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0266  potassium transporter peripheral membrane component  29.33 
 
 
445 aa  87.8  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1686  TrkA domain-containing protein  27.44 
 
 
219 aa  87  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0415019  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0312  potassium transporter peripheral membrane component  28.77 
 
 
449 aa  87  2e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0720169  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3335  sodium/hydrogen exchanger  30.2 
 
 
620 aa  87  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.263671  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11630  TrkA-C domain protein  29.06 
 
 
207 aa  86.7  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1469  TrkA-N domain protein  28.29 
 
 
454 aa  86.3  3e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1363  sodium/hydrogen exchanger  32.37 
 
 
610 aa  84.7  9e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00040523  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1265  hypothetical protein  28.32 
 
 
237 aa  84.7  1e-15  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1310  potassium transporter peripheral membrane component  28.57 
 
 
444 aa  84  1e-15  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  28.44 
 
 
221 aa  84.7  1e-15  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3126  potassium transporter peripheral membrane component  27.98 
 
 
458 aa  84.3  1e-15  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2912  TrkA-N domain protein  31.84 
 
 
223 aa  83.6  2e-15  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.106659 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0905  TrkA-N domain protein  27.8 
 
 
225 aa  83.6  2e-15  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0769  TrkA-N domain protein  29.41 
 
 
445 aa  83.6  2e-15  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.601936 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1728  TrkA domain-containing protein  27.88 
 
 
218 aa  83.2  3e-15  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  1.94267e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1261  TrkA domain-containing protein  27.78 
 
 
219 aa  83.2  3e-15  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2407  TrkA domain-containing protein  31.13 
 
 
220 aa  82.8  4e-15  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163912  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2479  TrkA-N domain protein  30.84 
 
 
445 aa  82.8  4e-15  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1272  potassium transporter peripheral membrane component  25.71 
 
 
443 aa  81.6  8e-15  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0221885  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2406  TrkA domain-containing protein  29.52 
 
 
214 aa  81.6  9e-15  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.716891  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3072  TrkA domain-containing protein  30 
 
 
214 aa  81.6  9e-15  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1685  TrkA domain-containing protein  33.91 
 
 
153 aa  81.3  1e-14  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.124287  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2661  TrkA domain-containing protein  28.18 
 
 
220 aa  80.9  1e-14  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.202256  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1262  TrkA domain-containing protein  34.78 
 
 
141 aa  80.9  1e-14  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3062  TrkA domain-containing protein  28.18 
 
 
227 aa  81.3  1e-14  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.793731  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3430  potassium transporter peripheral membrane component  25.62 
 
 
448 aa  80.5  2e-14  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0375932  normal  0.146617 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0254  TrkA-N domain protein  26.39 
 
 
221 aa  80.1  2e-14  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.153232 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1712  TrkA-N domain protein  28.44 
 
 
219 aa  80.9  2e-14  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.887824  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1929  putative potassium uptake protein  28.24 
 
 
229 aa  80.5  2e-14  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.123463  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3071  TrkA domain-containing protein  31.13 
 
 
220 aa  80.5  2e-14  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1655  TrkA domain-containing protein  27.4 
 
 
218 aa  79.3  4e-14  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  8.67889e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1399  TrkA domain-containing protein  30.95 
 
 
233 aa  79.3  4e-14  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4514  potassium transporter peripheral membrane component  27.18 
 
 
458 aa  79.3  5e-14  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00906883  hitchhiker  8.65676e-06 
 
 
-
 
NC_002950  PG2218  potassium transporter peripheral membrane component  26.89 
 
 
446 aa  79  5e-14  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000230921 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5192  TrkA domain-containing protein  33.01 
 
 
259 aa  78.6  7e-14  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0506525  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3063  TrkA domain-containing protein  27.7 
 
 
214 aa  78.6  7e-14  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1520  TrkA-N domain protein  27.49 
 
 
218 aa  78.6  7e-14  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.498959  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4396  potassium transporter peripheral membrane component  25.56 
 
 
458 aa  78.6  8e-14  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0641614  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1928  putative potassium transporter  25.35 
 
 
224 aa  77.4  1e-13  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.292607  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2286  TrkA-N domain-containing protein  28.64 
 
 
219 aa  77.8  1e-13  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.241613 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3722  TrkA-N domain protein  41.23 
 
 
617 aa  77  2e-13  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207998  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2911  potassium transporter peripheral membrane component  27.54 
 
 
449 aa  77.4  2e-13  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000908908  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1454  TrkA-N domain protein  28.11 
 
 
443 aa  76.3  3e-13  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3183  potassium transporter peripheral membrane component  28.17 
 
 
465 aa  76.3  3e-13  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00657284  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1400  TrkA-N domain-containing protein  26.13 
 
 
227 aa  76.3  4e-13  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0020  potassium transporter peripheral membrane component  30.23 
 
 
457 aa  76.3  4e-13  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1067  hypothetical protein  25.68 
 
 
225 aa  75.9  5e-13  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521072 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0187  potassium transporter peripheral membrane component  26.07 
 
 
465 aa  75.9  5e-13  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4544  potassium transporter peripheral membrane component  25.42 
 
 
492 aa  75.5  5e-13  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2267  TrkA-N domain protein  29.77 
 
 
459 aa  75.9  5e-13  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.634076  hitchhiker  0.00765776 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1322  TrkA-like  30.81 
 
 
231 aa  75.5  6e-13  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.465813 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_29  cation transport protein, Trk system  25 
 
 
454 aa  75.5  6e-13  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4528  TrkA-N domain-containing protein  31.6 
 
 
222 aa  75.5  6e-13  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.468661  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_002936  DET0030  potassium transporter peripheral membrane component  25.88 
 
 
454 aa  75.5  6e-13  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3265  hypothetical protein  31.7 
 
 
612 aa  75.1  7e-13  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.769883  normal  0.438481 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1062  TrkA-N domain-containing protein  30.6 
 
 
445 aa  75.1  8e-13  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.121384  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0243  TrkA-N domain protein  35.4 
 
 
206 aa  75.1  8e-13  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2849  potassium transporter peripheral membrane component  30.26 
 
 
457 aa  74.7  1e-12  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.336578  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1450  TrkA domain-containing protein  28.84 
 
 
229 aa  74.3  1e-12  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0807714  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2285  TrkA-N domain-containing protein  26.43 
 
 
221 aa  74.3  1e-12  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.311674 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1485  TrkA domain-containing protein  28.84 
 
 
229 aa  74.3  1e-12  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0637531  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00290  K+ transport system, NAD-binding component  37.07 
 
 
226 aa  74.7  1e-12  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0612  potassium transporter peripheral membrane component  26.96 
 
 
458 aa  73.9  2e-12  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0369792  normal  0.0559785 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0313  potassium transporter peripheral membrane component  26.96 
 
 
458 aa  73.9  2e-12  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.888467  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0436  potassium transporter peripheral membrane component  25.98 
 
 
458 aa  73.6  2e-12  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3673  TrkA-N domain protein  26.11 
 
 
444 aa  73.6  2e-12  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.728396  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3885  potassium transporter peripheral membrane component  26.96 
 
 
458 aa  73.9  2e-12  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0054195  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0638  TrkA-N  29.47 
 
 
225 aa  73.6  2e-12  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5999  potassium transporter peripheral membrane component  25.96 
 
 
485 aa  73.6  2e-12  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0135992 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1876  TrkA-N domain protein  28.57 
 
 
220 aa  73.6  2e-12  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.416785  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1041  TrkA domain-containing protein  28.79 
 
 
452 aa  73.2  3e-12  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1681  potassium transporter peripheral membrane component  28.57 
 
 
458 aa  73.2  3e-12  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3424  potassium transporter peripheral membrane component  24.26 
 
 
448 aa  72.8  4e-12  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.361163 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>