149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1422 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  100 
 
 
490 aa  964    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1608  polysaccharide biosynthesis protein  44.86 
 
 
492 aa  424  1e-117  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1593  polysaccharide biosynthesis protein  41.48 
 
 
504 aa  375  1e-102  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0011  polysaccharide biosynthesis protein  37.34 
 
 
481 aa  283  5.000000000000001e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.099852 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2971  polysaccharide biosynthesis protein  30.5 
 
 
475 aa  164  3e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.224966  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2947  polysaccharide biosynthesis protein  27.71 
 
 
484 aa  133  7.999999999999999e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2137  polysaccharide biosynthesis protein  25.85 
 
 
470 aa  131  3e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2756  polysaccharide biosynthesis protein  27.65 
 
 
476 aa  126  1e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.1976  normal  0.927782 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0922  polysaccharide biosynthesis protein  27.25 
 
 
479 aa  110  5e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  24.77 
 
 
490 aa  95.1  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2972  polysaccharide biosynthesis protein  22.74 
 
 
480 aa  91.3  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0537  polysaccharide biosynthesis protein  25.47 
 
 
485 aa  90.9  5e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0929  polysaccharide biosynthesis protein  24.19 
 
 
489 aa  88.2  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  36.14 
 
 
499 aa  88.2  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2139  polysaccharide biosynthesis protein  23.7 
 
 
482 aa  82.8  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00876576  normal  0.418146 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  28.57 
 
 
488 aa  82  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  28.65 
 
 
483 aa  80.1  0.00000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1407  PST family polysaccharide transporter  24.63 
 
 
481 aa  77.4  0.0000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  28.95 
 
 
461 aa  73.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1120  polysaccharide biosynthesis protein  22.68 
 
 
478 aa  72.4  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77221  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3796  polysaccharide biosynthesis protein  25.06 
 
 
478 aa  71.6  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4091  polysaccharide biosynthesis protein  25.12 
 
 
430 aa  69.3  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  21.54 
 
 
471 aa  68.6  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1836  polysaccharide biosynthesis protein  26.56 
 
 
446 aa  67  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  23.35 
 
 
477 aa  66.6  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0361  polysaccharide biosynthesis protein  23.01 
 
 
482 aa  66.2  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0040  polysaccharide biosynthesis protein  26.72 
 
 
435 aa  65.5  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000125854  normal  0.0319641 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0391  polysaccharide biosynthesis protein  23.98 
 
 
476 aa  64.7  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0253  polysaccharide biosynthesis protein  29.21 
 
 
435 aa  63.9  0.000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000123579  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0508  polysaccharide biosynthesis protein  27.17 
 
 
505 aa  63.5  0.000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0416  polysaccharide biosynthesis protein  27.02 
 
 
506 aa  63.5  0.000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.484223  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21180  polysaccharide biosynthesis protein  23.81 
 
 
539 aa  62.8  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.275763  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1271  polysaccharide biosynthesis protein  23.59 
 
 
429 aa  62  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.958308  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0234  lipopolysaccharide O-side chain biosynthesis protein (O-antigen transpoter)  24.66 
 
 
476 aa  62  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00421263  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0414  polysaccharide biosynthesis protein  23.19 
 
 
500 aa  61.6  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37906  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3272  polysaccharide biosynthesis protein  28.92 
 
 
546 aa  61.2  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.509561  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  23.08 
 
 
423 aa  61.2  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0621  polysaccharide biosynthesis protein  31.98 
 
 
475 aa  61.2  0.00000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.914686  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0457  polysaccharide biosynthesis protein  21.63 
 
 
488 aa  61.2  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1796  polysaccharide biosynthesis protein  27.75 
 
 
453 aa  61.2  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1767  polysaccharide biosynthesis protein  22 
 
 
447 aa  61.2  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0935149 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0118  polysaccharide biosynthesis protein  22.22 
 
 
476 aa  59.3  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0224366  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0123  polysaccharide biosynthesis protein  22.22 
 
 
476 aa  59.3  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.281108  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0890  polysaccharide biosynthesis protein  27.08 
 
 
407 aa  59.7  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362175  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  23.56 
 
 
489 aa  59.3  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1353  polysaccharide biosynthesis protein  20.6 
 
 
486 aa  58.2  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0483  polysaccharide biosynthesis protein  22.42 
 
 
477 aa  57.4  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  25.63 
 
 
440 aa  57  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  24.87 
 
 
444 aa  57  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  25.29 
 
 
444 aa  57  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3073  polysaccharide biosynthesis protein  21.54 
 
 
491 aa  56.6  0.0000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4228  polysaccharide biosynthesis protein  22.62 
 
 
486 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_004310  BR0143  virulence factor MviN  29.8 
 
 
529 aa  55.5  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3018  polysaccharide biosynthesis protein  29.02 
 
 
468 aa  55.8  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1142  PST family polysaccharide transporter  23.16 
 
 
475 aa  55.8  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000134656  hitchhiker  0.0000175319 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0177  polysaccharide biosynthesis protein  23.88 
 
 
446 aa  55.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89066  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0588  polysaccharide biosynthesis protein  25.71 
 
 
410 aa  55.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0284636  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  23.55 
 
 
512 aa  55.5  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  24.58 
 
 
517 aa  55.1  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1525  polysaccharide biosynthesis protein  21.07 
 
 
475 aa  54.7  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1128  polysaccharide biosynthesis protein  22.98 
 
 
547 aa  55.1  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1211  polysaccharide biosynthesis protein  28.14 
 
 
489 aa  55.1  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2862  polysaccharide biosynthesis protein  21.83 
 
 
500 aa  55.1  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2073  polysaccharide biosynthesis protein  26.32 
 
 
492 aa  54.7  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1044  polysaccharide biosynthesis protein  23.37 
 
 
440 aa  53.9  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.041441  hitchhiker  0.00655602 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0220  PST family polysaccharide transporter  25.56 
 
 
472 aa  53.9  0.000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1591  polysaccharide biosynthesis protein  22.96 
 
 
479 aa  53.9  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.267568  normal  0.0585541 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2892  polysaccharide biosynthesis protein  25.39 
 
 
429 aa  53.9  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2950  glycosyl transferase group 1  26.19 
 
 
899 aa  53.9  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2664  hypothetical protein  26.92 
 
 
485 aa  53.5  0.000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2438  polysaccharide biosynthesis protein  26.16 
 
 
495 aa  53.5  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0796  polysaccharide biosynthesis protein  19.1 
 
 
482 aa  53.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.733222  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0665  polysaccharide biosynthesis protein  21.61 
 
 
426 aa  52.8  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2602  polysaccharide biosynthesis protein  28.57 
 
 
448 aa  52.4  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0727  polysaccharide biosynthesis protein  27.27 
 
 
478 aa  52  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.207142  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2504  polysaccharide biosynthesis protein  25.33 
 
 
486 aa  52.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3832  polysaccharide biosynthesis protein  26.03 
 
 
471 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.431872  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3541  polysaccharide biosynthesis protein  26.29 
 
 
474 aa  52.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2304  polysaccharide biosynthesis protein  23.28 
 
 
494 aa  51.6  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.298994  normal  0.0362143 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1371  polysaccharide biosynthesis protein  23.39 
 
 
472 aa  51.2  0.00004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2748  polysaccharide biosynthesis protein  27.52 
 
 
526 aa  51.2  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.327125  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1236  polysaccharide biosynthesis protein  24.42 
 
 
482 aa  51.2  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.286439 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5012  putative polysaccharide biosynthesis protein  23.49 
 
 
499 aa  51.2  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2481  polysaccharide biosynthesis protein  21.33 
 
 
477 aa  50.8  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206749  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0081  stage V sporulation protein B  25.88 
 
 
517 aa  50.8  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0777  polysaccharide biosynthesis protein  21.43 
 
 
441 aa  51.2  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6968  PST family polysaccharide export protein  25.13 
 
 
458 aa  50.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.756164  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0744  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 
436 aa  50.8  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.923042  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0341  polysaccharide biosynthesis protein  23.88 
 
 
500 aa  50.4  0.00007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.467363  decreased coverage  0.0000100108 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1920  polysaccharide biosynthesis protein  20.15 
 
 
484 aa  50.4  0.00008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0707623  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1240  polysaccharide biosynthesis protein  24.3 
 
 
493 aa  50.1  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.554345  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  22.22 
 
 
449 aa  50.1  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5931  succinoglycan biosynthesis transport protein  23.62 
 
 
492 aa  50.1  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0590  polysaccharide biosynthesis protein, putative  20.97 
 
 
483 aa  49.3  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000415804  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1057  PST family polysaccharide transporter  25.23 
 
 
471 aa  49.3  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140128  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1846  polysaccharide biosynthesis protein  25.43 
 
 
433 aa  49.7  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1412  polysaccharide biosynthesis protein  27.73 
 
 
474 aa  48.1  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4360  polysaccharide biosynthesis protein  21.2 
 
 
429 aa  48.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.86188 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0464  polysaccharide transporter protein, putative  21.33 
 
 
486 aa  48.5  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000125112  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2636  integral membrane protein MviN  28.47 
 
 
512 aa  47.8  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>