94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1359 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1359  hypothetical protein  100 
 
 
278 aa  569  1e-161  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000216686  decreased coverage  0.00000000415932 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  26.12 
 
 
1094 aa  60.1  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  25.83 
 
 
366 aa  59.3  0.00000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  24.73 
 
 
543 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  25.1 
 
 
576 aa  58.2  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  27.09 
 
 
1121 aa  57.4  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  23.51 
 
 
1276 aa  55.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  23.46 
 
 
927 aa  55.5  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  34.03 
 
 
591 aa  54.3  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000157665  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  26.57 
 
 
4079 aa  54.7  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  32.28 
 
 
602 aa  53.9  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  25.1 
 
 
4489 aa  53.5  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0564  TPR repeat-containing protein  38.24 
 
 
202 aa  53.1  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.151741 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  23.51 
 
 
279 aa  53.1  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  30.66 
 
 
573 aa  52.4  0.000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  26.51 
 
 
562 aa  52  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  28.23 
 
 
745 aa  51.2  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.47 
 
 
1056 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1474  TPR repeat-containing protein  29.91 
 
 
162 aa  50.4  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0444734  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1823  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
213 aa  50.1  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  24.63 
 
 
955 aa  50.1  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0354  TPR repeat-containing protein  25.76 
 
 
684 aa  50.1  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.431996  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  25.2 
 
 
1069 aa  50.1  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  21.58 
 
 
730 aa  49.3  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  26.71 
 
 
344 aa  48.1  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1476  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 
226 aa  48.5  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.818932  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  27.87 
 
 
329 aa  48.1  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  27.44 
 
 
715 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2545  tetratricopeptide domain-containing protein  39.39 
 
 
672 aa  48.5  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.216986  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  22.13 
 
 
1138 aa  48.9  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  23.08 
 
 
436 aa  48.5  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  25.51 
 
 
740 aa  48.5  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  38.24 
 
 
560 aa  48.9  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2461  hypothetical protein  27.73 
 
 
398 aa  47.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125521  normal  0.0258605 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3047  tetratricopeptide TPR_2  28.17 
 
 
508 aa  47.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0595686  hitchhiker  0.00892549 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3132  tetratricopeptide TPR_2  41.94 
 
 
134 aa  47.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.112593  hitchhiker  0.000898611 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1606  tetratricopeptide TPR_2  28.71 
 
 
240 aa  48.1  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.799027 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.21 
 
 
836 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0487  TPR repeat-containing protein  28.35 
 
 
566 aa  47.4  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  30.97 
 
 
608 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  28.91 
 
 
1056 aa  47  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0813  TPR repeat-containing protein  28.89 
 
 
286 aa  46.6  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.038465  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.44 
 
 
784 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  27.7 
 
 
713 aa  46.6  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.05 
 
 
818 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2255  hypothetical protein  38.46 
 
 
191 aa  46.2  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.319682  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  37.1 
 
 
213 aa  46.2  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1451  TPR repeat-containing protein  42.31 
 
 
244 aa  46.2  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.346129  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1653  TPR repeat-containing protein  36.05 
 
 
466 aa  45.8  0.0007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0739  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
75 aa  45.8  0.0007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.725007 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  26.67 
 
 
1007 aa  45.8  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.52 
 
 
1022 aa  45.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  27.5 
 
 
636 aa  45.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2075  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 
292 aa  45.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1922  tetratricopeptide TPR_2  33.33 
 
 
142 aa  45.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.31 
 
 
784 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4437  glycosyl transferase family protein  29.23 
 
 
1061 aa  45.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  26.81 
 
 
397 aa  45.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  41.38 
 
 
417 aa  44.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3949  TPR repeat-containing protein  37.04 
 
 
361 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0990  TPR repeat-containing protein  32.5 
 
 
146 aa  44.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.140527 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.09 
 
 
988 aa  44.3  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  24.6 
 
 
314 aa  44.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0851  hypothetical protein  26.77 
 
 
544 aa  43.9  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  24.23 
 
 
573 aa  43.5  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0990  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.18 
 
 
410 aa  43.9  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.113297  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1816  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.31 
 
 
174 aa  43.9  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.706847  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  25.81 
 
 
448 aa  43.9  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1770  TPR repeat-containing protein  23.81 
 
 
173 aa  43.9  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.437465  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.92 
 
 
1056 aa  43.5  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  36.54 
 
 
352 aa  43.5  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  35.85 
 
 
512 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  23.6 
 
 
465 aa  43.1  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0523  TPR repeat-containing protein  37.74 
 
 
302 aa  43.1  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.15246  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  25.21 
 
 
1192 aa  43.1  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.72 
 
 
466 aa  43.1  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0225  TPR repeat-containing protein  21.99 
 
 
414 aa  43.1  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  26.03 
 
 
732 aa  43.1  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1399  TPR repeat-containing protein  24.53 
 
 
450 aa  42.7  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0955  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.25 
 
 
220 aa  42.7  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  23.57 
 
 
1979 aa  42.7  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  24.9 
 
 
1276 aa  42.4  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1919  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.96 
 
 
286 aa  42.7  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  33.87 
 
 
612 aa  42.4  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2318  TPR repeat-containing protein  23.76 
 
 
245 aa  42.7  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  24.29 
 
 
409 aa  42.7  0.007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  36 
 
 
3560 aa  42.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 
3035 aa  42.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2695  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 
292 aa  42.4  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.640048 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2011  AAA-4 family protein  30.77 
 
 
342 aa  42.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1062  TPR repeat-containing protein  35.85 
 
 
290 aa  42.4  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  25.81 
 
 
1297 aa  42.4  0.009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  25.41 
 
 
662 aa  42.4  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1983  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 
142 aa  42  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.325796 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>