47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1348 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1348  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  335  9.999999999999999e-92  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.39888  hitchhiker  0.0000845991 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1685  PUA domain-containing protein  62.25 
 
 		 166 aa  183  9e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.566422  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2533  PUA domain containing protein  59.46 
 
 		 159 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1829  PUA domain-containing protein  57.33 
 
 		 184 aa  167  4e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2206  PUA domain-containing protein  51.37 
 
 		 156 aa  161  3e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.141986  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0869  hypothetical protein  52.74 
 
 		 160 aa  152  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0694  PUA domain-containing protein  53.52 
 
 		 155 aa  149  2e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0631367  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2275  hypothetical protein  50.67 
 
 		 152 aa  146  9e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0570  archaeosine tRNA-ribosyltransferase  40.74 
 
 		 606 aa  118  4.9999999999999996e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0224275  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0798  PUA domain containing protein  42.38 
 
 		 164 aa  114  6.9999999999999995e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0663  PUA domain containing protein  45.16 
 
 		 176 aa  111  4.0000000000000004e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.830809  normal  0.0773964 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0226  PUA domain containing protein  43.15 
 
 		 153 aa  107  6e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.102678  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3182  PUA domain containing protein  42.48 
 
 		 161 aa  104  5e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.636517  normal  0.0526175 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2748  PUA domain containing protein  35.43 
 
 		 189 aa  93.6  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.590159  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0878  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  34.23 
 
 		 652 aa  90.1  1e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1632  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  36.49 
 
 		 649 aa  89.7  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0282  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  34.46 
 
 		 649 aa  85.5  3e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1482  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  33.56 
 
 		 649 aa  85.5  3e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2274  PUA domain-containing protein  37.58 
 
 		 172 aa  85.1  4e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.112054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0996  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  33.78 
 
 		 649 aa  80.9  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0035  PUA domain-containing protein  34.53 
 
 		 152 aa  65.1  0.0000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00396797 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2144  PUA domain-containing protein  30.88 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1077  PUA domain-containing protein  32.17 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0038  PUA domain-containing protein  29.93 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1603  PUA domain-containing protein  32.85 
 
 		 157 aa  57  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1772  tRNA-guanine transglycosylases, various specificities  28.86 
 
 		 615 aa  55.5  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0559  hypothetical protein  39.19 
 
 		 634 aa  54.7  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1661  PUA domain-containing protein  35.62 
 
 		 566 aa  53.5  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0706  PUA domain-containing protein  28.97 
 
 		 161 aa  50.1  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.924109  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0182  putative RNA-binding protein  30.25 
 
 		 161 aa  50.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1929  hypothetical protein  36.23 
 
 		 633 aa  48.5  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.986915  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0956  archaeosine tRNA-ribosyltransferase  29.37 
 
 		 626 aa  47  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2177  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  33.33 
 
 		 582 aa  45.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.881691  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0410  hypothetical protein  32.5 
 
 		 472 aa  45.4  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0165126  hitchhiker  0.000394368 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0894  putative RNA-binding protein  29.37 
 
 		 159 aa  44.7  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1052  putative RNA-binding protein  29.37 
 
 		 159 aa  44.7  0.0006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1622  putative RNA-binding protein  28.57 
 
 		 159 aa  44.7  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2157  PUA domain containing protein  30.52 
 
 		 600 aa  44.7  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.516872 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0607  PUA domain-containing protein  41.18 
 
 		 60 aa  44.3  0.0008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.398767  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0231  putative RNA-binding protein  37.84 
 
 		 165 aa  43.9  0.0009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.422543  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0233  putative RNA-binding protein  35.63 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.161468  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0714  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  33.56 
 
 		 585 aa  43.9  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1119  hypothetical protein  42.25 
 
 		 546 aa  43.9  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1070  putative RNA-binding protein  37.14 
 
 		 159 aa  43.1  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0751  putative RNA-binding protein  35.29 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0461148  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2683  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  32.88 
 
 		 608 aa  42.4  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0105473  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1314  PUA domain-containing protein  37.7 
 
 		 546 aa  41.6  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.188899 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>