More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1278 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1278  aminotransferase class-III  100 
 
 
420 aa  851    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.429678 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0531  protein of unknown function DUF21  54.39 
 
 
421 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0811523  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1891  hypothetical protein  53.66 
 
 
425 aa  400  9.999999999999999e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.471251 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1977  hypothetical protein  55.11 
 
 
426 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3011  hypothetical protein  46.39 
 
 
429 aa  352  8.999999999999999e-96  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  43.14 
 
 
420 aa  304  2.0000000000000002e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3015  hypothetical protein  38.57 
 
 
429 aa  273  4.0000000000000004e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.204841  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1425  hypothetical protein  35.38 
 
 
424 aa  265  1e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196446  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1233  hypothetical protein  35.63 
 
 
424 aa  265  1e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1207  hypothetical protein  35.38 
 
 
424 aa  259  8e-68  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.213322  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2054  hypothetical protein  39.36 
 
 
422 aa  258  2e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000265297  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2212  CBS domain-containing protein  35.47 
 
 
417 aa  257  3e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000293587  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0832  hypothetical protein  36.08 
 
 
417 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000822238 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0885  protein of unknown function DUF21  36.28 
 
 
470 aa  252  7e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.182877  normal  0.402091 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0036  transporter, putative  39.25 
 
 
421 aa  248  1e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0036  putative transporter  39.25 
 
 
421 aa  247  2e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1548  protein of unknown function DUF21  35.73 
 
 
468 aa  245  9.999999999999999e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1183  protein of unknown function DUF21  36.15 
 
 
424 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000010351  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1630  hypothetical protein  35.28 
 
 
464 aa  243  7e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2230  protein of unknown function DUF21  35.51 
 
 
464 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.214459  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1827  hypothetical protein  37.56 
 
 
448 aa  241  2e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2318  protein of unknown function DUF21  35.28 
 
 
464 aa  240  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.142674  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1410  protein of unknown function DUF21  35.85 
 
 
456 aa  239  1e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4780  protein of unknown function DUF21  35.63 
 
 
443 aa  236  8e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.000717269  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1007  hypothetical protein  33.09 
 
 
422 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0616  protein of unknown function DUF21  35.52 
 
 
422 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000839014  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0049  protein of unknown function DUF21  35.95 
 
 
467 aa  232  8.000000000000001e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  33.98 
 
 
446 aa  230  4e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0252  protein of unknown function DUF21  34.52 
 
 
434 aa  230  4e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000514588  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1713  protein of unknown function DUF21  35.58 
 
 
477 aa  228  1e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1326  protein of unknown function DUF21  38.38 
 
 
425 aa  228  1e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00045717  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4395  hypothetical protein  37.59 
 
 
439 aa  228  2e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0154532  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2181  hypothetical protein  34.8 
 
 
454 aa  225  1e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1507  hypothetical protein  36.07 
 
 
430 aa  225  1e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1002  hypothetical protein  36.03 
 
 
443 aa  224  2e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1613  UPF0053 inner membrane protein  33.91 
 
 
433 aa  224  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405489  normal  0.446608 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2723  protein of unknown function DUF21  34.53 
 
 
438 aa  222  9e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1153  hypothetical protein  30.56 
 
 
447 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000974304  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_1568  predicted protein  34.4 
 
 
420 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00000880884  normal  0.122051 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1532  hypothetical protein  34.64 
 
 
442 aa  218  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.788333 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0407  protein of unknown function DUF21  38.52 
 
 
464 aa  217  4e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.426667  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0738  CBS domain-containing protein  35.58 
 
 
435 aa  215  9.999999999999999e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0394  protein of unknown function DUF21  34.24 
 
 
414 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0591737  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0450  hypothetical protein  34.28 
 
 
418 aa  213  3.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00320716  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1383  transport protein  32.39 
 
 
434 aa  213  5.999999999999999e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283032  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1427  hypothetical protein  33.25 
 
 
437 aa  213  7e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.108419 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0082  hypothetical protein  35.66 
 
 
455 aa  212  1e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000179952  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1269  CBS domain containing protein  36.58 
 
 
420 aa  212  1e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0015  CBS domain containing protein  36.29 
 
 
434 aa  212  1e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7571  CBS domain-containing protein  33.5 
 
 
434 aa  211  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.52117 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0082  hypothetical protein  35.32 
 
 
455 aa  210  4e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000182254  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0534  hypothetical protein  33.1 
 
 
436 aa  209  5e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.616871 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2483  hypothetical protein  33.83 
 
 
442 aa  209  8e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.767391  normal  0.0571877 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4588  hypothetical protein  34.51 
 
 
427 aa  209  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0268669  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1482  hypothetical protein  34.28 
 
 
442 aa  208  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.14439  normal  0.218713 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2159  protein of unknown function DUF21  32.78 
 
 
440 aa  207  2e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.182374  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3544  protein of unknown function DUF21  29.86 
 
 
446 aa  208  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2004  hypothetical protein  33.89 
 
 
431 aa  208  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01240  CBS domain-containing protein  33.1 
 
 
443 aa  208  2e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1660  CBS domain containing protein  34.15 
 
 
461 aa  207  3e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0558  CBS domain-containing protein  31.96 
 
 
427 aa  207  4e-52  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0718  hypothetical protein  33.07 
 
 
428 aa  206  4e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.229015  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2814  hypothetical protein  34.04 
 
 
442 aa  206  5e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13600  CBS domain-containing protein  34.43 
 
 
457 aa  206  7e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1716  hypothetical protein  33.25 
 
 
429 aa  206  9e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.230477  normal  0.276793 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0537  hypothetical protein  33.67 
 
 
447 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.947499  normal  0.569692 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3532  hypothetical protein  34.07 
 
 
455 aa  205  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2870  hypothetical protein  33.18 
 
 
433 aa  205  1e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.221651  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0978  protein involved in gliding motility GldE  32.74 
 
 
431 aa  205  2e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0292  hypothetical protein  33.59 
 
 
440 aa  203  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.682803 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1072  hypothetical protein  31.22 
 
 
442 aa  203  6e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1468  CBS domain containing protein  33.17 
 
 
447 aa  202  7e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0356908  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0846  CBS domain-containing protein  33.57 
 
 
439 aa  202  7e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1539  hypothetical protein  32.86 
 
 
431 aa  202  7e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.463732  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1143  hypothetical protein  30.32 
 
 
432 aa  202  8e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000186322  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0911  hypothetical protein  32.1 
 
 
435 aa  202  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0926  protein of unknown function DUF21  32.55 
 
 
441 aa  202  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1419  protein of unknown function DUF21  33.66 
 
 
423 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1777  protein of unknown function DUF21  31.83 
 
 
424 aa  202  9.999999999999999e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3512  protein of unknown function DUF21  32.35 
 
 
431 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal  0.374436 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2297  Hemolysin and related protein containing CBS domains-like protein  32.56 
 
 
434 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2563  hypothetical protein  31.9 
 
 
434 aa  201  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.645388 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2611  protein of unknown function DUF21  31.83 
 
 
445 aa  200  3e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0247  protein of unknown function DUF21  32.79 
 
 
446 aa  200  3.9999999999999996e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2000  hemolysin-like protein  33.09 
 
 
445 aa  200  3.9999999999999996e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0678745  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3454  hypothetical protein  30.86 
 
 
436 aa  199  7e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0757862  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3517  hypothetical protein  30.86 
 
 
436 aa  199  7e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.70435 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3465  hypothetical protein  30.86 
 
 
436 aa  199  7e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0200076 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2275  hypothetical protein  33.58 
 
 
429 aa  199  1.0000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.746126  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0853  CBS domain-containing protein  30.72 
 
 
444 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215802  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1158  CBS domain-containing protein  32.52 
 
 
452 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.992942  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3887  protein of unknown function DUF21  31.41 
 
 
436 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0724448  hitchhiker  0.00619914 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2841  hypothetical protein  32.38 
 
 
423 aa  196  6e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.063755  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2923  hypothetical protein  32.38 
 
 
423 aa  196  6e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.801289  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3594  protein of unknown function DUF21  30.94 
 
 
436 aa  196  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.798731 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0892  CBS domain-containing protein  29.26 
 
 
433 aa  196  7e-49  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0338077  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4410  protein of unknown function DUF21  29.53 
 
 
444 aa  196  8.000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.938013  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1251  CBS domain-containing protein  31.69 
 
 
435 aa  195  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0646  putative transport protein  29.93 
 
 
423 aa  195  1e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.781134  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3066  hypothetical protein  32.9 
 
 
429 aa  194  3e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.897226  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>