More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1246 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1246  30S ribosomal protein S4P  100 
 
 		 181 aa  367  1e-101  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0000703727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2224  30S ribosomal protein S4P  60.8 
 
 		 185 aa  216  1e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1801  30S ribosomal protein S4P  59.66 
 
 		 182 aa  215  2.9999999999999998e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.147092  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2387  30S ribosomal protein S4P  57.78 
 
 		 181 aa  212  1.9999999999999998e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.331094  normal  0.66938 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2901  30S ribosomal protein S4P  57.95 
 
 		 181 aa  207  5e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.104435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0077  30S ribosomal protein S4P  50 
 
 		 216 aa  166  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1619  30S ribosomal protein S4P  52.02 
 
 		 183 aa  166  1e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0037  30S ribosomal protein S4P  46.82 
 
 		 184 aa  164  6.9999999999999995e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1100  30S ribosomal protein S4P  47.7 
 
 		 177 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2523  30S ribosomal protein S4P  46.15 
 
 		 169 aa  156  2e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0154222  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1397  ribosomal protein S4  47.75 
 
 		 187 aa  153  1e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.861603  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0421  ribosomal protein S4  45.29 
 
 		 173 aa  153  1e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0273  30S ribosomal protein S4P  44.25 
 
 		 178 aa  150  1e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1353  30S ribosomal protein S4P  44.25 
 
 		 178 aa  149  2e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.49235  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0565  30S ribosomal protein S4P  44.25 
 
 		 178 aa  149  2e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2553  ribosomal protein S4  46.47 
 
 		 173 aa  148  4e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0631  30S ribosomal protein S4P  44.83 
 
 		 178 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0258  30S ribosomal protein S4P  48.02 
 
 		 172 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1054  ribosomal protein S4  47.88 
 
 		 181 aa  140  7e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00520973  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1817  30S ribosomal protein S4P  43.2 
 
 		 175 aa  136  2e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2590  30S ribosomal protein S4P  43.79 
 
 		 173 aa  136  2e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.325159  normal  0.37704 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04803  hypothetical protein similar to 40S ribosomal protein S9 (Broad)  42.77 
 
 		 193 aa  124  6e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1103  30S ribosomal protein S4P  45.56 
 
 		 181 aa  124  1e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.798829  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02160  hypothetical protein  44.85 
 
 		 193 aa  120  9.999999999999999e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_6847  predicted protein  43.03 
 
 		 167 aa  117  9e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.118356  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77059  predicted protein  40.85 
 
 		 189 aa  112  2.0000000000000002e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.425894  normal  0.528605 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0324  30S ribosomal protein S4P  37.95 
 
 		 201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_94716  Ribosomal protein S9, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  38.99 
 
 		 194 aa  108  3e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.321448 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1893  30S ribosomal protein S4P  45.39 
 
 		 159 aa  103  2e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0909  30S ribosomal protein S4P  43.14 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1422  30S ribosomal protein S4P  44.08 
 
 		 159 aa  102  3e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.186865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2147  30S ribosomal protein S4P  40 
 
 		 180 aa  99.4  2e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000057291  hitchhiker  0.000326283 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0971  30S ribosomal protein S4P  40.79 
 
 		 159 aa  97.1  1e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.160491 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1254  SSU ribosomal protein S4P  55.77 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.119667  normal  0.172003 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1226  30S ribosomal protein S4  54.72 
 
 		 224 aa  68.6  0.00000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04260  30S ribosomal protein S4  52.46 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.342435  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3383  ribosomal protein S4  67.39 
 
 		 201 aa  68.2  0.00000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2931  SSU ribosomal protein S4P  45.59 
 
 		 208 aa  67.4  0.00000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0070755  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0292  30S ribosomal protein S4  47.54 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188387  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01440  ribosomal protein S4  50.82 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000107934  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1841  30S ribosomal protein S4  50.94 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.470668  normal  0.674871 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19720  SSU ribosomal protein S4P  40.7 
 
 		 198 aa  65.9  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000575799  normal  0.771365 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0500  30S ribosomal protein S4  55.1 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000917743  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6584  30S ribosomal protein S4  60.87 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.234143  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4971  30S ribosomal protein S4  52.46 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.557252 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1141  30S ribosomal protein S4  38.46 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.273227 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4000  ribosomal protein S4  50.94 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00226649  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0315  30S ribosomal protein S4  50.85 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000187386  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1112  30S ribosomal protein S4  38.46 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1129  30S ribosomal protein S4  38.46 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1435  30S ribosomal protein S4  52.46 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1134  ribosomal protein S4  49.18 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00609491  normal  0.0863667 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1825  30S ribosomal protein S4  49.15 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1548  ribosomal protein S4  54.35 
 
 		 197 aa  64.7  0.0000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2397  30S ribosomal protein S4  47.46 
 
 		 203 aa  64.7  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0284002  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2137  30S ribosomal protein S4  48.28 
 
 		 203 aa  64.7  0.0000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000101892  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1973  30S ribosomal protein S4  48.21 
 
 		 203 aa  64.7  0.0000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000312348  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0786  ribosomal protein S4  51.02 
 
 		 208 aa  64.3  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0220407  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0237  30S ribosomal protein S4  45 
 
 		 208 aa  64.3  0.0000000009  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0862147  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0715  30S ribosomal protein S4  52.83 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20600  30S ribosomal protein S4  50.82 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.725693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0416  30S ribosomal protein S4  54.35 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.338288  normal  0.0195935 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2668  30S ribosomal protein S4  49.02 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.544911  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2354  30S ribosomal protein S4  49.02 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1159  ribosomal protein S4  49.06 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000286157  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0313  30S ribosomal protein S4  45.28 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.977941  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3876  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0501  30S ribosomal protein S4  43.08 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000100385  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2724  30S ribosomal protein S4  60 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000198678  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1171  30S ribosomal protein S4  62.22 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4291  ribosomal protein S4  56.52 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01440  SSU ribosomal protein S4P  44.78 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.164406  normal  0.69794 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0894  30S ribosomal protein S4  48.21 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000013906  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2305  ribosomal protein S4  49.15 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00950883  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3670  ribosomal protein S4  60 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0333  30S ribosomal protein S4  60.87 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0897396  decreased coverage  0.000428085 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0058  30S ribosomal protein S4  52 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0478  30S ribosomal protein S4  41.54 
 
 		 197 aa  62  0.000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000852694  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0206  30S ribosomal protein S4  49.06 
 
 		 208 aa  62  0.000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0094  30S ribosomal protein S4  48.15 
 
 		 208 aa  62  0.000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0810213  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2249  30S ribosomal protein S4  55.56 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0123403  normal  0.0465366 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1943  ribosomal protein S4  46.3 
 
 		 208 aa  62  0.000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1752  30S ribosomal protein S4  56.52 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000068654  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0763  RNA-binding S4 domain-containing protein  48.98 
 
 		 211 aa  62  0.000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1842  SSU ribosomal protein S4P  59.09 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1009  30S ribosomal protein S4  57.78 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.262144  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_443  ribosomal protein S4  43.33 
 
 		 207 aa  61.2  0.000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000105703  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13495  30S ribosomal protein S4  58.7 
 
 		 201 aa  61.2  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000412742  normal  0.375665 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2203  30S ribosomal protein S4  46.43 
 
 		 203 aa  60.8  0.000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000224183  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2998  ribosomal protein S4  48.98 
 
 		 206 aa  60.8  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785982 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4939  ribosomal protein S4  47.17 
 
 		 211 aa  60.8  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00864494  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1766  30S ribosomal protein S4  55.56 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.534162  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1319  30S ribosomal protein S4  53.33 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000360982  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1367  30S ribosomal protein S4  53.33 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000845169  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1718  ribosomal protein S4  45.9 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000245759  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0264  30S ribosomal protein S4  55.81 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4485  30S ribosomal protein S4  57.78 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.644744  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2805  ribosomal protein S4  43.28 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000815748  decreased coverage  0.00000000563481 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1581  30S ribosomal protein S4  53.33 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2261  ribosomal protein S4  46.88 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000352752  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>