67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1228 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1228  hypothetical protein  100 
 
 
183 aa  374  1e-103  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1635  metal dependent phosphohydrolase  37.77 
 
 
181 aa  116  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2011  metal dependent phosphohydrolase  35.33 
 
 
183 aa  115  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000379503  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1352  metal dependent phosphohydrolase  38.04 
 
 
183 aa  112  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00103581  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1325  metal dependent phosphohydrolase  35.14 
 
 
180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0272  metal dependent phosphohydrolase  34.78 
 
 
183 aa  108  6e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00103666  normal  0.918075 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0279  HDIG domain-containing protein  33.15 
 
 
183 aa  107  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000148406  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15740  metal dependent phosphohydrolase  32.61 
 
 
183 aa  104  6e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000329898  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1974  metal dependent phosphohydrolase  34.81 
 
 
184 aa  103  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.475926  normal  0.164885 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0761  metal dependent phosphohydrolase  35.64 
 
 
185 aa  103  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.933081 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3535  metal dependent phosphohydrolase  36.94 
 
 
199 aa  102  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0145  metal dependent phosphohydrolase  33.7 
 
 
183 aa  102  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617038  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0723  metal dependent phosphohydrolase  32.09 
 
 
180 aa  101  5e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1569  metal dependent phophohydrolase  34.41 
 
 
184 aa  100  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0027  metal dependent phophohydrolase  32.42 
 
 
184 aa  100  1e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1169  metal dependent phosphohydrolase  34.57 
 
 
187 aa  99.4  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.411442 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0523  metal dependent phosphohydrolase  33.7 
 
 
183 aa  98.6  4e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.149111  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1221  metal dependent phosphohydrolase  31.89 
 
 
182 aa  97.8  8e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01460  predicted HD superfamily hydrolase  34.97 
 
 
200 aa  97.8  8e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0275977  normal  0.728206 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1234  metal dependent phosphohydrolase  32.04 
 
 
175 aa  96.7  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0328  metal dependent phosphohydrolase  31.82 
 
 
217 aa  95.9  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000109078  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0547  HDIG domain-containing protein  32.61 
 
 
183 aa  95.5  3e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_488  HD superfamily hydrolase  33.15 
 
 
183 aa  94.4  9e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0853951  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2109  metal dependent phosphohydrolase  32.96 
 
 
185 aa  93.2  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00149234  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1488  metal dependent phosphohydrolase  32.07 
 
 
183 aa  92.4  4e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1591  hypothetical protein  34.21 
 
 
187 aa  90.9  8e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0703  metal dependent phophohydrolase  35.71 
 
 
191 aa  89.7  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000160771 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1422  metal dependent phosphohydrolase  33.15 
 
 
185 aa  87.4  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.452089  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0692  metal dependent phophohydrolase  34.42 
 
 
191 aa  87.4  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000253532  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2783  HDIG domain-containing protein  33.75 
 
 
191 aa  86.3  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0010  metal dependent phosphohydrolase  37.58 
 
 
190 aa  85.9  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0374  metal dependent phosphohydrolase  34.74 
 
 
184 aa  85.1  6e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0422  metal dependent phosphohydrolase  32.78 
 
 
188 aa  84  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3779  metal dependent phosphohydrolase  31.91 
 
 
218 aa  84  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3835  metal dependent phophohydrolase  31.91 
 
 
216 aa  83.2  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3919  metal dependent phophohydrolase  31.38 
 
 
214 aa  81.3  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.300311  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3184  metal dependent phophohydrolase  32.35 
 
 
186 aa  79.7  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2951  metal dependent phosphohydrolase  32.05 
 
 
189 aa  77  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2682  metal dependent phosphohydrolase  33.54 
 
 
190 aa  76.3  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0703847  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3414  metal dependent phosphohydrolase  31.25 
 
 
212 aa  75.5  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.014123 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2258  metal dependent phosphohydrolase  30.57 
 
 
186 aa  72.4  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.331666  hitchhiker  0.000431176 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1412  metal dependent phosphohydrolase  29.19 
 
 
191 aa  72.8  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0296584 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3897  metal dependent phophohydrolase  30.63 
 
 
224 aa  72.4  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0567621 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2830  metal dependent phosphohydrolase  29.38 
 
 
193 aa  71.6  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4580  metal dependent phosphohydrolase  33.12 
 
 
200 aa  71.2  0.000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000627017  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13230  lysyl-tRNA synthetase (class II)  33.51 
 
 
771 aa  69.3  0.00000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0295969  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1079  metal dependent phosphohydrolase  30.69 
 
 
196 aa  67  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4403  metal dependent phophohydrolase  30.64 
 
 
213 aa  67  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.127842  normal  0.124781 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2145  metal dependent phosphohydrolase  29.75 
 
 
187 aa  66.6  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3456  metal dependent phophohydrolase  30.06 
 
 
213 aa  66.2  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.986512  normal  0.0301443 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2818  HDIG domain-containing protein  30.06 
 
 
201 aa  65.1  0.0000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0140878 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0373  metal dependent phophohydrolase  34.19 
 
 
187 aa  63.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.196484  normal  0.0301256 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2252  metal dependent phosphohydrolase  31.91 
 
 
182 aa  63.9  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0289443  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0463  metal dependent phosphohydrolase  32.2 
 
 
187 aa  60.8  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3125  metal dependent phosphohydrolase  30.13 
 
 
181 aa  59.7  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0572222 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1546  metal dependent phophohydrolase  32.5 
 
 
187 aa  59.3  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1236  metal dependent phophohydrolase  31.48 
 
 
181 aa  56.2  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5425  metal dependent phophohydrolase  29.26 
 
 
189 aa  47.8  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0190213 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0615  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  36 
 
 
558 aa  46.6  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.22485  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1043  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  29.59 
 
 
488 aa  45.4  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.620631  normal  0.862003 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0798  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  31.31 
 
 
487 aa  44.7  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.164487  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3992  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  35 
 
 
610 aa  43.5  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.748921  normal  0.498171 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3656  metal dependent phophohydrolase  28.37 
 
 
347 aa  42  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.347697  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3949  metal dependent phosphohydrolase  28.37 
 
 
347 aa  42.4  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0476143  normal  0.326491 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0585  phosphodiesterase  31 
 
 
519 aa  42  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0284  metal dependent phosphohydrolase  31.96 
 
 
536 aa  41.6  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.876396  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1693  phosphodiesterase  30 
 
 
519 aa  41.2  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00893236  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>