289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1183 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1183  hypothetical protein  100 
 
 
352 aa  729    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.401368  normal  0.0474441 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0302  DNA-cytosine methyltransferase  42.66 
 
 
375 aa  265  1e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1628  C-5 cytosine-specific DNA methylase  43.06 
 
 
359 aa  263  3e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  41.71 
 
 
342 aa  263  3e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0528  DNA-cytosine methyltransferase  41.86 
 
 
354 aa  260  2e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0606  DNA-cytosine methyltransferase  42.94 
 
 
355 aa  259  6e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0080  DNA-cytosine methyltransferase  43.84 
 
 
371 aa  258  1e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.35686  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4678  DNA-cytosine methyltransferase  42.57 
 
 
345 aa  257  2e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.201023  normal  0.324334 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3845  DNA-cytosine methyltransferase  44.73 
 
 
371 aa  257  2e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4973  DNA-cytosine methyltransferase  40.69 
 
 
373 aa  256  6e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2196  DNA-cytosine methyltransferase  41.71 
 
 
366 aa  256  6e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.227819  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3681  modification methylase HgiDII  40.58 
 
 
344 aa  249  7e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1175  DNA-cytosine methyltransferase  40.57 
 
 
349 aa  242  6e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164827  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2193  DNA-cytosine methyltransferase  39.34 
 
 
358 aa  242  7.999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.877984  normal  0.072963 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1377  DNA-cytosine methyltransferase  38.84 
 
 
362 aa  223  3e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_257  DNA-cytosine methyltransferase  40.99 
 
 
365 aa  218  1e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0680  C-5 cytosine-specific DNA methylase  40 
 
 
350 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000225645 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2314  DNA-cytosine methyltransferase  39.11 
 
 
340 aa  209  5e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4309  DNA-cytosine methyltransferase  36.72 
 
 
374 aa  209  8e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0990622  normal  0.0453977 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  34.33 
 
 
373 aa  179  8e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1159  putative 5-methylcytosine methyltransferase  33.33 
 
 
381 aa  157  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.105767  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  32.23 
 
 
395 aa  155  9e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0503  putative C-5 cytosine-specific DNA methylase  31.96 
 
 
387 aa  154  2.9999999999999998e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181875  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  33.24 
 
 
398 aa  153  5e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  0.00000436024 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0372  DNA-cytosine methyltransferase  31.94 
 
 
385 aa  152  7e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.497071  normal  0.790678 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  29.64 
 
 
357 aa  149  9e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4269  DNA-cytosine methyltransferase  34.49 
 
 
359 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1675  DNA-cytosine methyltransferase  31.87 
 
 
319 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  30.89 
 
 
362 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  29.59 
 
 
389 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  30.43 
 
 
361 aa  138  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  30.87 
 
 
370 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  29.24 
 
 
489 aa  136  5e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  28.53 
 
 
652 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0160  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  31.2 
 
 
404 aa  133  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.319111  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  29.56 
 
 
361 aa  132  6e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2797  DNA-cytosine methyltransferase  29.43 
 
 
399 aa  132  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  29.44 
 
 
438 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  30.98 
 
 
468 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  29.16 
 
 
406 aa  130  3e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  30.51 
 
 
423 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0676  DNA-cytosine methyltransferase  31.22 
 
 
434 aa  129  7.000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  30.86 
 
 
423 aa  129  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0576  DNA-cytosine methyltransferase  31.29 
 
 
313 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  31.53 
 
 
310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0931  DNA-cytosine methyltransferase  28.5 
 
 
474 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1839  DNA-cytosine methyltransferase  30.65 
 
 
318 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.414211  normal  0.341933 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0232  C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.04 
 
 
415 aa  127  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.547554  decreased coverage  0.000406028 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26030  DNA-methyltransferase Dcm  30.87 
 
 
431 aa  125  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3948  DNA-cytosine methyltransferase  28.86 
 
 
657 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0700  DNA-cytosine methyltransferase  30.46 
 
 
320 aa  124  3e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4036  DNA-cytosine methyltransferase  29.3 
 
 
365 aa  123  5e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2280  DNA-cytosine methyltransferase  27.46 
 
 
313 aa  123  5e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.977909 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1473  DNA-cytosine methyltransferase  28.69 
 
 
360 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1243  DNA-cytosine methyltransferase  29.97 
 
 
325 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  27.88 
 
 
671 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  28.07 
 
 
465 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  27.32 
 
 
415 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0891  C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.61 
 
 
397 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  28.31 
 
 
418 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  28.31 
 
 
418 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0824  DNA-cytosine methyltransferase  31.33 
 
 
349 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  30.25 
 
 
313 aa  113  6e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.16 
 
 
405 aa  112  9e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336169  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4938  DNA-cytosine methyltransferase  28.18 
 
 
355 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  28.05 
 
 
313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0416  DNA-cytosine methyltransferase  27.17 
 
 
320 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2163  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  26.2 
 
 
375 aa  109  9.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41914  normal  0.896778 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1270  DNA-cytosine methyltransferase  30.56 
 
 
406 aa  108  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5064  DNA-cytosine methyltransferase  27.29 
 
 
424 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1383  DNA-cytosine methyltransferase  27.54 
 
 
309 aa  108  2e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1413  DNA-cytosine methyltransferase  25.6 
 
 
420 aa  108  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.582499  normal  0.117973 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06638  C5 cytosine methyltransferase DmtAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q876R1]  28.45 
 
 
615 aa  107  4e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0121285  normal  0.227283 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  28.61 
 
 
335 aa  107  4e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2535  DNA-cytosine methyltransferase  29.62 
 
 
400 aa  106  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0644  DNA-cytosine methyltransferase  29.09 
 
 
390 aa  106  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000274432  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2462  DNA-cytosine methyltransferase  27.17 
 
 
412 aa  106  7e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017331  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0766  DNA-cytosine methyltransferase  25.75 
 
 
488 aa  105  8e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3438  DNA modification cytosine-specific methyltransferase protein  28.74 
 
 
364 aa  105  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  29.64 
 
 
328 aa  105  1e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4319  DNA-cytosine methyltransferase family protein  29.15 
 
 
312 aa  105  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00165512 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  28.15 
 
 
308 aa  104  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1529  DNA-cytosine methyltransferase  25.12 
 
 
402 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000344499  unclonable  0.000000000227525 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  26.09 
 
 
421 aa  103  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4984  DNA-cytosine methyltransferase  27.95 
 
 
361 aa  103  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1132  DNA-cytosine methyltransferase  26.63 
 
 
395 aa  103  6e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.53813  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0819  modification methylase HaeIII (cytosine-specificmethyltransferase HaeIII; M.HaeIII)  29.76 
 
 
388 aa  102  8e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.230352  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  26.8 
 
 
431 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  28.74 
 
 
335 aa  101  2e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1322  DNA-cytosine methyltransferase  29.7 
 
 
429 aa  101  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  hitchhiker  0.000198005 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3920  DNA-cytosine methyltransferase  26.84 
 
 
358 aa  100  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0526  DNA-cytosine methyltransferase  28.33 
 
 
377 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243641  normal  0.870196 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04441  DNA-cytosine methyltransferase  26.18 
 
 
689 aa  98.2  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.355889  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  28.01 
 
 
334 aa  97.8  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  27.75 
 
 
434 aa  97.1  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2562  DNA-cytosine methyltransferase  28.5 
 
 
423 aa  96.7  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3758  cytosine-specific DNA methylase  27.18 
 
 
443 aa  95.1  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00145147  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0450  DNA-cytosine methyltransferase  34.18 
 
 
452 aa  95.9  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.618512 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0378  DNA-cytosine methyltransferase  26.87 
 
 
686 aa  94.7  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.853393  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  29.19 
 
 
323 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>