More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1139 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2410  DNA topoisomerase I  46.34 
 
 		 771 aa  636    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.11035 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1011  DNA topoisomerase  54.46 
 
 		 931 aa  1031    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0783808  normal  0.0479859 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0770  DNA topoisomerase  56.26 
 
 		 931 aa  1035    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0112956  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0095  DNA topoisomerase I  46.95 
 
 		 743 aa  639    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000317173  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1139  hypothetical protein  100 
 
 		 935 aa  1916    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1299  DNA topoisomerase type IA central domain protein  54.22 
 
 		 938 aa  1002    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.596273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0595  DNA topoisomerase I  45.79 
 
 		 744 aa  640    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0859  DNA topoisomerase  54.39 
 
 		 942 aa  1011    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.293507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3010  DNA topoisomerase I  45.16 
 
 		 863 aa  564  1.0000000000000001e-159  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2731  DNA topoisomerase I  44.4 
 
 		 844 aa  559  1e-158  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.186723  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2461  DNA topoisomerase  43.88 
 
 		 843 aa  539  1e-151  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0259  DNA topoisomerase type IA central domain protein  43.68 
 
 		 864 aa  535  1e-150  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1458  DNA topoisomerase I  44.49 
 
 		 827 aa  531  1e-149  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1964  DNA topoisomerase I  41.19 
 
 		 702 aa  487  1e-136  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1139  DNA topoisomerase type IA central domain protein  40.06 
 
 		 849 aa  463  1e-129  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.395203 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0335  DNA topoisomerase I  40.94 
 
 		 747 aa  464  1e-129  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09220  topoisomerase IA  38.87 
 
 		 834 aa  451  1e-125  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.143894  normal  0.0154062 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23450  topoisomerase IA  37.32 
 
 		 837 aa  446  1.0000000000000001e-124  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000217154  decreased coverage  0.0000000285044 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1093  DNA topoisomerase type IA central domain protein  37.61 
 
 		 837 aa  437  1e-121  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0705  DNA topoisomerase  29.4 
 
 		 780 aa  306  8.000000000000001e-82  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2128  DNA topoisomerase, type I  30.26 
 
 		 855 aa  302  2e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.572238 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0158  DNA topoisomerase I  32.04 
 
 		 817 aa  293  7e-78  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.087887  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0026  DNA topoisomerase I  31.94 
 
 		 853 aa  283  1e-74  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1699  DNA topoisomerase I  31.33 
 
 		 814 aa  281  5e-74  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0203  DNA topoisomerase I  31.53 
 
 		 814 aa  280  7e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.698596 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0781  DNA topoisomerase I  32.75 
 
 		 812 aa  276  2.0000000000000002e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.935548  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0392  DNA topoisomerase  32.5 
 
 		 604 aa  274  6e-72  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.225119  normal  0.175863 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1359  DNA topoisomerase  31.54 
 
 		 602 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.013738 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1735  DNA topoisomerase type IA central domain-containing protein  32.94 
 
 		 604 aa  270  8.999999999999999e-71  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.718005  hitchhiker  0.000823973 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0109  DNA topoisomerase type IA central domain-containing protein  31.2 
 
 		 610 aa  268  2.9999999999999995e-70  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000681889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0885  DNA topoisomerase  32.89 
 
 		 631 aa  263  1e-68  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0843416  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1115  DNA topoisomerase  32.27 
 
 		 596 aa  263  2e-68  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32265  predicted protein  29.94 
 
 		 863 aa  244  5e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.142978  normal  0.982566 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0010  DNA topoisomerase I  30.12 
 
 		 857 aa  222  3e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8810  DNA topoisomerase  27.69 
 
 		 868 aa  219  2e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.917921  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34564  DNA topoisomerase  27.67 
 
 		 616 aa  218  5e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.496706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4389  DNA topoisomerase I  28.92 
 
 		 793 aa  213  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00166014  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04555  DNA topoisomerase III (Eurofung)  29.34 
 
 		 629 aa  212  3e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.755081  normal  0.215917 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1289  DNA topoisomerase I  28.75 
 
 		 684 aa  210  9e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.781177  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1889  DNA topoisomerase I  27.3 
 
 		 668 aa  209  1e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.806156  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1211  DNA topoisomerase I  32.52 
 
 		 849 aa  206  2e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1700  DNA topoisomerase I  30.97 
 
 		 693 aa  204  5e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00616947  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2839  DNA topoisomerase I  28.77 
 
 		 768 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01574  DNA topoisomerase I  31.16 
 
 		 876 aa  201  5e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1551  DNA topoisomerase I  30.46 
 
 		 689 aa  200  7.999999999999999e-50  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2139  DNA topoisomerase I  29.68 
 
 		 869 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.124713 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1679  DNA topoisomerase I  29.68 
 
 		 869 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229175 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3603  DNA topoisomerase I  29.68 
 
 		 869 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0171104  normal  0.313127 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1346  DNA topoisomerase I  28.6 
 
 		 708 aa  199  2.0000000000000003e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000122971  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14470  DNA topoisomerase I  30.52 
 
 		 868 aa  199  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2181  DNA topoisomerase I  29.94 
 
 		 693 aa  199  2.0000000000000003e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0024842  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3266  DNA topoisomerase I  30.41 
 
 		 758 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000837338  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1347  DNA topoisomerase I  27.53 
 
 		 780 aa  198  3e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000873362  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0171  DNA topoisomerase I  28.71 
 
 		 743 aa  198  4.0000000000000005e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25110  DNA topoisomerase I  29.98 
 
 		 868 aa  198  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00400  DNA topoisomerase type I, putative  27.77 
 
 		 828 aa  197  5.000000000000001e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.772015  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1560  DNA topoisomerase I  31.13 
 
 		 877 aa  197  5.000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003948  DNA topoisomerase I  30.99 
 
 		 876 aa  197  6e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0644345  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2148  DNA topoisomerase I  29.78 
 
 		 868 aa  197  6e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1615  DNA topoisomerase I  29.13 
 
 		 836 aa  197  6e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.830191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1583  DNA topoisomerase I  29.38 
 
 		 868 aa  197  7e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.590699 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1322  DNA topoisomerase I  31.16 
 
 		 872 aa  197  8.000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.425671  normal  0.143441 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2277  DNA topoisomerase I  29.85 
 
 		 854 aa  197  9e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0137658 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1655  DNA topoisomerase I  29.54 
 
 		 869 aa  197  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.967668  normal  0.788315 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1332  DNA topoisomerase I  29.82 
 
 		 876 aa  197  1e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000656424  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2549  DNA topoisomerase I  28.92 
 
 		 757 aa  196  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0550694  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3876  DNA topoisomerase I  29.77 
 
 		 876 aa  196  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.198302  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1026  DNA topoisomerase I  30.94 
 
 		 697 aa  196  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00786254  unclonable  0.0000000108626 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1146  DNA topoisomerase I  29.44 
 
 		 879 aa  195  3e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.368466  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2162  DNA topoisomerase I  29.17 
 
 		 867 aa  194  5e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.010806  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07540  DNA topoisomerase I  29.11 
 
 		 691 aa  194  6e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00641456  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1614  DNA topoisomerase I  29.23 
 
 		 865 aa  194  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.848842  hitchhiker  0.000000000000466003 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0161  DNA topoisomerase I  28.36 
 
 		 695 aa  194  7e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1846  DNA topoisomerase I  29.23 
 
 		 865 aa  194  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.996923  normal  0.0120486 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1841  DNA topoisomerase I  29.23 
 
 		 865 aa  193  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.253396  hitchhiker  0.0000000000877757 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0406  DNA topoisomerase I  28.75 
 
 		 841 aa  193  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.064646  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1432  DNA topoisomerase I  29.23 
 
 		 865 aa  193  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0283977  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1904  DNA topoisomerase I  29.23 
 
 		 865 aa  193  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.42777  hitchhiker  2.78185e-16 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3826  DNA topoisomerase I  31.94 
 
 		 852 aa  193  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.801079  normal  0.0383535 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0393  DNA topoisomerase I  28.74 
 
 		 884 aa  192  2e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000925228  unclonable  0.0000000013775 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1474  DNA topoisomerase I  27.51 
 
 		 865 aa  192  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00320061  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2658  DNA topoisomerase I  29.85 
 
 		 859 aa  192  2.9999999999999997e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00218044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1729  DNA topoisomerase I  29.02 
 
 		 894 aa  192  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0724746 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01250  DNA topoisomerase I  27.72 
 
 		 865 aa  191  4e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.856005  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2375  DNA topoisomerase I  27.72 
 
 		 865 aa  191  4e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000189026  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2489  DNA topoisomerase I  29.67 
 
 		 880 aa  191  4e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.297791  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1855  DNA topoisomerase I  29.67 
 
 		 880 aa  191  4e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000497797 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3287  DNA topoisomerase I  30.32 
 
 		 870 aa  191  4e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2693  DNA topoisomerase I  30.15 
 
 		 813 aa  191  4e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305019  normal  0.0402807 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2609  DNA topoisomerase I  29.67 
 
 		 880 aa  191  4e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0281339  decreased coverage  0.00102405 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1383  DNA topoisomerase I  27.72 
 
 		 865 aa  191  4e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01260  hypothetical protein  27.72 
 
 		 865 aa  191  4e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.742047  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2354  DNA topoisomerase I  27.72 
 
 		 865 aa  191  4e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.01053  unclonable  0.0000000472675 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1021  DNA topoisomerase I  28.47 
 
 		 669 aa  191  4e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0905515  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0016  DNA topoisomerase I  27.82 
 
 		 851 aa  191  5.999999999999999e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.954343  normal  0.0614036 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0015  DNA topoisomerase I  27.82 
 
 		 851 aa  191  5.999999999999999e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1498  DNA topoisomerase I  27.72 
 
 		 865 aa  191  5.999999999999999e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1660  DNA topoisomerase I  28.69 
 
 		 894 aa  191  7e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.367793  unclonable  0.0000368554 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1906  DNA topoisomerase I  27.72 
 
 		 865 aa  191  7e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.176274  hitchhiker  0.000000000000101765 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0916  DNA topoisomerase I  28.44 
 
 		 693 aa  190  9e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000916095  hitchhiker  0.000814664 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>