More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1113 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1113  hypothetical protein  100 
 
 		 307 aa  627  1e-179  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.416676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1954  cation diffusion facilitator family transporter  51.79 
 
 		 328 aa  324  1e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0446  cation diffusion facilitator family transporter  53.97 
 
 		 328 aa  316  4e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.48861  normal  0.265047 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0526  cation diffusion facilitator family transporter  55.15 
 
 		 327 aa  308  6.999999999999999e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1127  cation diffusion facilitator family transporter  47.24 
 
 		 323 aa  288  6e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  47.49 
 
 		 307 aa  285  5.999999999999999e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1521  cation diffusion facilitator family transporter  50 
 
 		 309 aa  282  4.0000000000000003e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1683  cation diffusion facilitator family transporter  47.96 
 
 		 308 aa  266  2.9999999999999995e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000676071  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0724  cation diffusion facilitator family transporter  47.37 
 
 		 315 aa  265  5e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152803  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  44.04 
 
 		 311 aa  263  3e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  45.99 
 
 		 285 aa  262  6.999999999999999e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  43.38 
 
 		 311 aa  261  8.999999999999999e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2400  cation diffusion facilitator family transporter  44.44 
 
 		 307 aa  256  2e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  43.38 
 
 		 311 aa  242  6e-63  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2000  cation diffusion facilitator family transporter  45.79 
 
 		 285 aa  217  2e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.7679  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2574  cation diffusion facilitator family transporter  43.71 
 
 		 310 aa  208  7e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  33.8 
 
 		 314 aa  194  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1731  cation diffusion facilitator family transporter  36.49 
 
 		 315 aa  187  1e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.560975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1483  cation diffusion facilitator family transporter  34.9 
 
 		 308 aa  182  7e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0225  cation diffusion facilitator family transporter  37.76 
 
 		 312 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1043  cation efflux protein  34.83 
 
 		 320 aa  179  4e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2073  cation diffusion facilitator family transporter  35.23 
 
 		 308 aa  179  4.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0980  cation diffusion facilitator family transporter  33.11 
 
 		 305 aa  172  5.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1114  cation efflux protein  35.56 
 
 		 305 aa  171  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2446  cation diffusion facilitator family transporter  35.85 
 
 		 304 aa  170  3e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.526861  normal  0.400869 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1850  cation diffusion facilitator family transporter  34.97 
 
 		 315 aa  169  6e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2294  cation diffusion facilitator family transporter  35.47 
 
 		 306 aa  169  7e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38282  normal  0.177312 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3075  cation diffusion facilitator family transporter  33.9 
 
 		 304 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3261  cation efflux system protein  36.6 
 
 		 305 aa  167  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2568  cation diffusion facilitator family transporter  31.17 
 
 		 332 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1770  cation diffusion facilitator family transporter  34.62 
 
 		 315 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1582  cation diffusion facilitator family transporter  36.15 
 
 		 299 aa  165  8e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1021  cation diffusion facilitator family transporter  34.81 
 
 		 346 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2239  cation diffusion facilitator family transporter  35.66 
 
 		 302 aa  163  3e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0407082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2025  cation diffusion facilitator family transporter  30.82 
 
 		 313 aa  163  3e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0165078  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1801  cation efflux family protein  34.36 
 
 		 376 aa  161  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0942158  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0084  pantothenate metabolism flavoprotein  32.89 
 
 		 311 aa  160  2e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00694286  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0867  cation diffusion facilitator family transporter  35.21 
 
 		 295 aa  159  8e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.851238 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1379  cation diffusion facilitator family transporter  34.12 
 
 		 481 aa  159  8e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.892961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1661  cation diffusion facilitator family transporter  31.87 
 
 		 331 aa  158  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1026  cation efflux family protein  33.33 
 
 		 295 aa  157  2e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1171  cation efflux family protein  32.97 
 
 		 295 aa  157  2e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0972  cation efflux family protein  33.33 
 
 		 295 aa  157  2e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0710  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 		 476 aa  157  2e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2871  cation efflux protein  35.42 
 
 		 317 aa  156  3e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0597  cation diffusion facilitator family transporter  33.59 
 
 		 302 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2106  cation diffusion facilitator family transporter  34.62 
 
 		 315 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2873  cation diffusion facilitator family transporter  35.96 
 
 		 314 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1439  cation efflux protein  33.45 
 
 		 293 aa  155  6e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0109958  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0791  cation diffusion facilitator family transporter  37 
 
 		 312 aa  155  7e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5864  cation diffusion facilitator family transporter  31.77 
 
 		 300 aa  155  7e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.499716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3065  cation diffusion facilitator family transporter  33.1 
 
 		 295 aa  151  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.686004  normal  0.910257 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0050  cation diffusion facilitator family transporter  33.57 
 
 		 317 aa  151  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2795  ferrous iron efflux protein F  32.62 
 
 		 301 aa  151  1e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00102947  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3290  cation diffusion facilitator family transporter  33.1 
 
 		 295 aa  152  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2658  cation diffusion facilitator family transporter  34.09 
 
 		 295 aa  151  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1178  cation diffusion facilitator family transporter  34.28 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00185198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0470  cation diffusion facilitator family transporter  30.39 
 
 		 337 aa  150  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5513  cation diffusion facilitator family transporter  33.71 
 
 		 295 aa  149  6e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281094  normal  0.363198 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2530  cation diffusion facilitator family transporter  33.11 
 
 		 460 aa  149  7e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2468  cation diffusion facilitator family transporter  32.4 
 
 		 295 aa  149  8e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1598  cation diffusion facilitator family transporter  35.91 
 
 		 302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2804  cation diffusion facilitator family transporter  31.02 
 
 		 303 aa  147  3e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1013  metal cation efflux protein CzrB  32.64 
 
 		 302 aa  147  3e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.323499  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07750  cation diffusion facilitator family transporter  30.41 
 
 		 330 aa  146  4.0000000000000006e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2198  cation diffusion facilitator family transporter  32.64 
 
 		 293 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.776966  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2809  cation diffusion facilitator family transporter  33.58 
 
 		 304 aa  146  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.252612  normal  0.010552 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3476  putative cation efflux family protein, CzcD-like protein  32.14 
 
 		 296 aa  145  6e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606573  normal  0.771262 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0432  cation diffusion facilitator family transporter  29.11 
 
 		 331 aa  145  6e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0974  cation diffusion facilitator family transporter  31.05 
 
 		 466 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1568  cation efflux family protein  33.9 
 
 		 302 aa  145  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1514  cation efflux family protein  33.9 
 
 		 302 aa  145  1e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0023  cation diffusion facilitator family transporter  32.84 
 
 		 295 aa  144  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5667  cation diffusion facilitator family transporter  32.53 
 
 		 328 aa  145  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1206  cation diffusion facilitator family transporter  32.52 
 
 		 316 aa  144  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3300  iron and zinc efflux system protein  31.65 
 
 		 318 aa  145  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.831799  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0847  cation efflux protein  31.64 
 
 		 297 aa  143  4e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1256  cation diffusion facilitator family transporter  34.29 
 
 		 303 aa  143  4e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.513971  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3707  cation diffusion facilitator family transporter  33.1 
 
 		 319 aa  142  6e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0354783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0487  cation diffusion facilitator family transporter  33.1 
 
 		 319 aa  142  7e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3146  cation efflux family protein  35.23 
 
 		 296 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440371  hitchhiker  0.000651912 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4244  cation diffusion facilitator family transporter  34.78 
 
 		 339 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.337864 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3435  cation diffusion facilitator family transporter  34.8 
 
 		 478 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0253813 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2019  cation diffusion facilitator family transporter  36.03 
 
 		 459 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.40781 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0745  cation diffusion facilitator family transporter  31.14 
 
 		 460 aa  139  4.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3264  cation diffusion facilitator family transporter  34.09 
 
 		 295 aa  139  6e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4753  cation diffusion facilitator family transporter  31.66 
 
 		 296 aa  138  8.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.36054  decreased coverage  0.00983844 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3931  cation diffusion facilitator family transporter  30.04 
 
 		 289 aa  138  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146752  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0846  cation diffusion facilitator family transporter  31.34 
 
 		 459 aa  137  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0034385  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4669  cation diffusion facilitator family transporter  32.99 
 
 		 332 aa  136  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4385  cation efflux family protein  32.85 
 
 		 301 aa  136  5e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.592721  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0263  cation diffusion facilitator family transporter  29.35 
 
 		 296 aa  135  8e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000665998  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0263  cation diffusion facilitator family transporter  29.35 
 
 		 296 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0369  cation diffusion facilitator family transporter  30.31 
 
 		 293 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000868845  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0258  cation diffusion facilitator family transporter  29.01 
 
 		 296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0238617  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4333  cation efflux protein  32.5 
 
 		 297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2245  cation diffusion facilitator family transporter  34.48 
 
 		 483 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0256  cation diffusion facilitator family transporter  29.97 
 
 		 290 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.015822  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0051  cation diffusion facilitator family transporter  29.17 
 
 		 306 aa  132  5e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0047  cation diffusion facilitator family transporter  28.94 
 
 		 325 aa  133  5e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.408108  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>