70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1045 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1045  hypothetical protein  100 
 
 
277 aa  580  1.0000000000000001e-165  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1447  hypothetical protein  48.36 
 
 
280 aa  275  7e-73  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.814616  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0040  hypothetical protein  41.2 
 
 
274 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.25968  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0326  hypothetical protein  37.04 
 
 
276 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2361  methyltransferase type 12  33.33 
 
 
291 aa  154  1e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2360  methyltransferase type 12  34.01 
 
 
319 aa  150  2e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.328542  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0058  methyltransferase type 11  33.2 
 
 
287 aa  145  5e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1588  Methyltransferase type 12  34.78 
 
 
293 aa  143  4e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0308513  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1590  Methyltransferase type 11  34.4 
 
 
298 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0369722  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1471  methyltransferase type 11  29.96 
 
 
279 aa  129  8.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0487894  normal  0.185117 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2033  methyltransferase  30.94 
 
 
302 aa  127  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.931745  normal  0.810156 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1469  methyltransferase type 11  31.75 
 
 
280 aa  124  1e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00000470965  normal  0.0590447 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1924  methyltransferase type 12  30.49 
 
 
291 aa  123  4e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.302412  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2016  methyltransferase  29.23 
 
 
283 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1177  ribosomal RNA adenine dimethylase  28.06 
 
 
274 aa  117  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0005  Methyltransferase type 11  28.16 
 
 
293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0234268 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2737  methyltransferase  29.47 
 
 
278 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000116085  decreased coverage  0.0000479797 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1317  ribosomal RNA adenine dimethylase  27.85 
 
 
279 aa  107  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.222413  normal  0.0120668 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1090  methyltransferase  30.12 
 
 
283 aa  107  3e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000294134  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0245  ribosomal RNA adenine dimethylase  30.95 
 
 
278 aa  104  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.14559  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1320  putative methyltransferase  30.77 
 
 
291 aa  95.1  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0114884 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0429  methyltransferase type 12  27.11 
 
 
275 aa  92.8  5e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0122  SAM-binding motif-containing protein  26.32 
 
 
286 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.350495 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3701  methyltransferase type 12  27.83 
 
 
279 aa  82.4  0.000000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1495  hypothetical protein  28.02 
 
 
273 aa  79.3  0.00000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000420591  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0235  methyltransferase type 12  31.52 
 
 
254 aa  79.3  0.00000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1781  SAM (and some other nucleotide) binding motif  25.36 
 
 
286 aa  79  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.183763  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1285  methyltransferase type 12  28.02 
 
 
273 aa  79  0.00000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0369  methyltransferase type 12  31.52 
 
 
254 aa  78.6  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.151072  normal  0.249023 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2275  methyltransferase type 12  27.56 
 
 
279 aa  77.8  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1473  methyltransferase type 12  27.57 
 
 
270 aa  77.8  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0046  methyltransferase type 12  25.17 
 
 
283 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.165361  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1271  hypothetical protein  31.25 
 
 
277 aa  73.2  0.000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000529075  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26420  hypothetical protein  27.27 
 
 
265 aa  66.6  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0492105  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1216  hypothetical protein  26.03 
 
 
286 aa  66.2  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.43284  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1916  putative SAM-dependent methyltransferase  27.27 
 
 
299 aa  65.9  0.0000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0150  methyltransferase  27.92 
 
 
269 aa  65.5  0.0000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.520005  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1224  hypothetical protein  25.82 
 
 
277 aa  64.3  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0472515 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0225  hypothetical protein  33.33 
 
 
294 aa  63.5  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1550  hypothetical protein  30 
 
 
275 aa  60.5  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0301305  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1672  hypothetical protein  29.11 
 
 
268 aa  60.1  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.51834  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1037  methyltransferase type 12  32.39 
 
 
256 aa  60.1  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1950  putative methyltransferase  23.42 
 
 
270 aa  59.3  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0292125 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0812  hypothetical protein  25.32 
 
 
271 aa  59.3  0.00000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.158523  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0032  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
288 aa  57.8  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0327  putative SAM-dependent methyltransferase  32.8 
 
 
323 aa  57.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1288  serine protease  28.12 
 
 
279 aa  54.7  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00462648  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1481  hypothetical protein  27.85 
 
 
279 aa  54.7  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1982  hypothetical protein  24.43 
 
 
268 aa  54.7  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3030  methyltransferase type 12  28.57 
 
 
274 aa  53.1  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01690  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  26.29 
 
 
291 aa  53.5  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.160618  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2505  Methyltransferase type 11  37.97 
 
 
267 aa  52.8  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.618552  normal  0.420988 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1983  hypothetical protein  21.51 
 
 
295 aa  52.4  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0206  hypothetical protein  29.33 
 
 
268 aa  52  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0297191  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0281  hypothetical protein  20.22 
 
 
263 aa  50.8  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0250  hypothetical protein  25.57 
 
 
273 aa  49.7  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2002  hypothetical protein  52.38 
 
 
289 aa  48.9  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.419802 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3103  methyltransferase type 11  25.93 
 
 
276 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3567  hypothetical protein  27.56 
 
 
284 aa  47.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.109401 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1127  methyltransferase type 12  27.19 
 
 
302 aa  47  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.287777  hitchhiker  0.00000151267 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0817  methyltransferase  30.19 
 
 
253 aa  45.8  0.0008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1645  hypothetical protein  21.26 
 
 
292 aa  45.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0146326 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0207  hypothetical protein  23.04 
 
 
287 aa  43.5  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0172227  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0682  SAM-binding motif-containing protein  25 
 
 
191 aa  43.5  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.206315  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0383  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
277 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  25.26 
 
 
263 aa  43.1  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6087  Methyltransferase type 12  41.82 
 
 
263 aa  42.7  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1527  hypothetical protein  38.1 
 
 
244 aa  42.7  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.807875  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8959  hypothetical protein  25.42 
 
 
261 aa  42.7  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233397  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09260  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  24.43 
 
 
352 aa  42.4  0.009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.505356  normal  0.0667798 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>