More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0900 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0900  hypothetical protein  100 
 
 
397 aa  818    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0374108 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2178  UDP-glucose 6-dehydrogenase  61.46 
 
 
388 aa  522  1e-147  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112663  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2641  UDP-glucose 6-dehydrogenase  61.21 
 
 
388 aa  519  1e-146  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1203  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.45 
 
 
388 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.699954  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1330  UDP-glucose 6-dehydrogenase  63.48 
 
 
388 aa  513  1e-144  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.143594  decreased coverage  0.000414466 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1373  UDP-glucose 6-dehydrogenase  61.96 
 
 
388 aa  509  1e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1256  transcriptional regulator, XRE family  61.31 
 
 
491 aa  510  1e-143  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1387  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  61.21 
 
 
388 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.496605  hitchhiker  0.0000966488 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3019  nucleotide sugar dehydrogenase  62.22 
 
 
397 aa  504  1e-141  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0876853 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0800  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  61.31 
 
 
391 aa  501  1e-140  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001761  UDP-glucose dehydrogenase  59.95 
 
 
388 aa  496  1e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00706  nucleotide sugar dehydrogenase  59.45 
 
 
388 aa  495  1e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2850  nucleotide sugar dehydrogenase  61.71 
 
 
388 aa  494  9.999999999999999e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.217055  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1202  nucleotide sugar dehydrogenase  58.94 
 
 
389 aa  491  1e-137  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.988641  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2929  nucleotide sugar dehydrogenase  57.68 
 
 
388 aa  488  1e-137  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01930  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.68 
 
 
388 aa  486  1e-136  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.586017  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1629  nucleotide sugar dehydrogenase  57.68 
 
 
388 aa  486  1e-136  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00733567  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1614  nucleotide sugar dehydrogenase  57.68 
 
 
388 aa  485  1e-136  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.812894 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2418  udp-glucose 6-dehydrogenase  57.43 
 
 
388 aa  484  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233828 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2259  udp-glucose 6-dehydrogenase  57.43 
 
 
388 aa  484  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.389868  normal  0.025931 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01916  hypothetical protein  57.68 
 
 
388 aa  486  1e-136  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.656876  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1349  nucleotide sugar dehydrogenase  57.68 
 
 
388 aa  486  1e-136  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2205  udp-glucose 6-dehydrogenase  57.43 
 
 
388 aa  484  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.638468  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3861  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.15 
 
 
398 aa  487  1e-136  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0444005  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2319  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.68 
 
 
388 aa  485  1e-136  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1795  nucleotide sugar dehydrogenase  59.45 
 
 
389 aa  485  1e-136  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2849  nucleotide sugar dehydrogenase  59.19 
 
 
388 aa  486  1e-136  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2961  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.68 
 
 
388 aa  486  1e-136  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000204361 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00992  nucleotide sugar dehydrogenase  59.34 
 
 
395 aa  485  1e-136  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000137814  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1418  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.69 
 
 
388 aa  485  1e-136  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1032  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.93 
 
 
388 aa  487  1e-136  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.366892 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1572  nucleotide sugar dehydrogenase  58.44 
 
 
388 aa  484  1e-135  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2308  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.43 
 
 
388 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0186642 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2306  udp-glucose 6-dehydrogenase  57.18 
 
 
388 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0255325 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3483  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  59.39 
 
 
389 aa  481  1e-135  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.956099  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0919  nucleotide sugar dehydrogenase  56.93 
 
 
388 aa  483  1e-135  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00213667  normal  0.147124 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1510  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  58.15 
 
 
390 aa  481  1e-134  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0720  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.94 
 
 
388 aa  480  1e-134  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875671  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1968  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.19 
 
 
389 aa  478  1e-133  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2115  DNA gyrase, subunit A  58.69 
 
 
388 aa  473  1e-132  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.539484 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3978  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  57.18 
 
 
409 aa  471  1e-132  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1067  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.29 
 
 
391 aa  474  1e-132  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.575864  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2679  nucleotide sugar dehydrogenase  57.18 
 
 
388 aa  468  1.0000000000000001e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0071  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  57.43 
 
 
387 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4687  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.93 
 
 
387 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3885  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  56.68 
 
 
409 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4273  nucleotide sugar dehydrogenase  57.18 
 
 
387 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1498  nucleotide sugar dehydrogenase  56.64 
 
 
389 aa  467  9.999999999999999e-131  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4328  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  56.68 
 
 
387 aa  463  1e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4468  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  56.68 
 
 
387 aa  464  1e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1563  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.89 
 
 
397 aa  464  1e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.03127  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4088  phosphoglycerate mutase  56.68 
 
 
409 aa  463  1e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0591  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.67 
 
 
388 aa  461  9.999999999999999e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1737  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.14 
 
 
388 aa  412  1e-114  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0150  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.49 
 
 
372 aa  407  1.0000000000000001e-112  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0958685  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0275  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase, dimerisation  48.5 
 
 
422 aa  386  1e-106  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0309187  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0592  nucleotide sugar dehydrogenase  41.88 
 
 
389 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.887508 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0568  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  41.88 
 
 
389 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00339328  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0599  nucleotide sugar dehydrogenase  41.88 
 
 
389 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2277  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.91 
 
 
451 aa  186  7e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00280919  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  34.54 
 
 
427 aa  180  4e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.44 
 
 
451 aa  175  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0608813  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0606  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.7 
 
 
442 aa  171  1e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.641401  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1121  nucleotide sugar dehydrogenase  30.08 
 
 
447 aa  169  7e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396392  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3767  nucleotide sugar dehydrogenase  34.89 
 
 
473 aa  168  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0312169 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4994  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.08 
 
 
456 aa  168  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0866  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.99 
 
 
467 aa  168  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.359864 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1502  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.33 
 
 
438 aa  168  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.842125  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2846  nucleotide sugar dehydrogenase  33.6 
 
 
489 aa  166  5e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0952  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.24 
 
 
404 aa  166  5e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.134556  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5321  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.15 
 
 
441 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3180  nucleotide sugar dehydrogenase  33.88 
 
 
449 aa  166  8e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000062373  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0034  nucleotide sugar dehydrogenase  32.6 
 
 
440 aa  166  1.0000000000000001e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.250011 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3255  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.61 
 
 
434 aa  165  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.564317  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5049  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.61 
 
 
462 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5290  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.61 
 
 
456 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000221682 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5434  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.42 
 
 
441 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5638  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.51 
 
 
441 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000154055 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5366  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.61 
 
 
456 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3551  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.61 
 
 
438 aa  164  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1948  nucleotide sugar dehydrogenase  33.61 
 
 
434 aa  164  3e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.286781  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1642  nucleotide sugar dehydrogenase  31.51 
 
 
427 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4879  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.34 
 
 
462 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4894  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.61 
 
 
462 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4824  nucleotide sugar dehydrogenase  32.88 
 
 
435 aa  163  4.0000000000000004e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0713  nucleotide sugar dehydrogenase  31.44 
 
 
437 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.227984 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0618  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  32.42 
 
 
434 aa  163  6e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0769  nucleotide sugar dehydrogenase  32.42 
 
 
434 aa  163  6e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1344  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.87 
 
 
439 aa  162  7e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.73347 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1116  nucleotide sugar dehydrogenase  32.31 
 
 
437 aa  162  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1185  nucleotide sugar dehydrogenase  32.31 
 
 
437 aa  162  9e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5308  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.07 
 
 
456 aa  161  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3028  nucleotide sugar dehydrogenase  33.61 
 
 
438 aa  162  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2224  nucleotide sugar dehydrogenase  33.33 
 
 
434 aa  161  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.339815 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5192  nucleotide sugar dehydrogenase  33.43 
 
 
440 aa  162  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.602765  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3252  nucleotide sugar dehydrogenase  33.61 
 
 
438 aa  162  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22770  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.59 
 
 
460 aa  161  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0986  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.81 
 
 
467 aa  161  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4606  nucleotide sugar dehydrogenase  33.61 
 
 
456 aa  160  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.094228  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1853  nucleotide sugar dehydrogenase  32.5 
 
 
441 aa  160  3e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.85941  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>