132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0886 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0886  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  262  1e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0454668  hitchhiker  0.00000000702025 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0927  hypothetical protein  45.79 
 
 		 109 aa  98.2  4e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.430224  normal  0.445553 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1637  DNA polymerase beta subunit  45.36 
 
 		 106 aa  85.5  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0686  DNA polymerase beta subunit  50.54 
 
 		 96 aa  82.4  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0348  DNA polymerase beta subunit  51.16 
 
 		 94 aa  82.8  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1762  nucleotidyltransferase family protein  45.16 
 
 		 97 aa  80.1  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.324196 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0862  DNA polymerase beta domain protein region  39.13 
 
 		 101 aa  77  0.00000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000634599  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0374  DNA polymerase beta subunit  39.8 
 
 		 108 aa  76.3  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.509035  normal  0.373075 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0028  nucleotidyltransferase family protein  39.78 
 
 		 96 aa  74.7  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.422617  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3031  DNA polymerase beta subunit  40.86 
 
 		 96 aa  73.6  0.0000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.424813  normal  0.471509 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2422  DNA polymerase, beta-like region  37.63 
 
 		 109 aa  71.6  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0142  nucleotidyltransferase  45.33 
 
 		 86 aa  70.1  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1162  DNA polymerase beta subunit  45.12 
 
 		 100 aa  69.7  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1784  nucleotidyltransferase  38.78 
 
 		 97 aa  68.2  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0241  DNA polymerase beta subunit  35.48 
 
 		 99 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0867  DNA polymerase beta domain protein region  44.44 
 
 		 96 aa  67  0.00000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0506  DNA polymerase beta subunit  42.86 
 
 		 96 aa  66.6  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3039  DNA polymerase beta domain protein region  35.48 
 
 		 99 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0638  nucleotidyltransferase  38.71 
 
 		 101 aa  65.5  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0547  DNA polymerase beta subunit  41.3 
 
 		 100 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.790238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0845  DNA polymerase beta subunit  49.32 
 
 		 96 aa  65.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  0.358781 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2493  DNA polymerase beta domain-containing protein region  36.56 
 
 		 96 aa  64.7  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1691  DNA polymerase beta domain protein region  36.67 
 
 		 101 aa  64.7  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2529  DNA polymerase beta subunit  39.02 
 
 		 104 aa  63.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400211 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2532  DNA polymerase beta subunit  39.02 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0127103 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0900  DNA polymerase beta subunit  33.7 
 
 		 103 aa  62.8  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0088  DNA polymerase beta subunit  39.77 
 
 		 103 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0340868 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0627  DNA polymerase beta subunit  32.38 
 
 		 101 aa  61.2  0.000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0052  DNA polymerase beta subunit  32.38 
 
 		 101 aa  61.2  0.000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0550488  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3265  DNA polymerase beta subunit  40.96 
 
 		 87 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00407875  normal  0.255152 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0409  DNA polymerase beta subunit  35.71 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0548  DNA polymerase beta domain protein region  36.36 
 
 		 102 aa  59.7  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0548  nucleotidyltransferase family protein  37.35 
 
 		 93 aa  58.9  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1036  DNA polymerase beta domain protein region  32.95 
 
 		 96 aa  58.9  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0795086  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2757  nucleotidyltransferase family protein  34.15 
 
 		 102 aa  58.2  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0697  DNA polymerase beta subunit  35.56 
 
 		 96 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.424952 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0053  DNA polymerase beta subunit  40.24 
 
 		 102 aa  57.8  0.00000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0582464  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2462  DNA polymerase beta subunit  38.3 
 
 		 98 aa  57  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.266656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1475  DNA polymerase beta domain protein region  41.98 
 
 		 129 aa  57  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.125283  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5818  DNA polymerase beta domain protein region  34.41 
 
 		 96 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1877  DNA polymerase beta domain protein region  39.51 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1883  DNA polymerase, beta-like region  35.96 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1851  DNA polymerase beta domain protein region  39.51 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1803  DNA polymerase beta domain protein region  38.2 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0152  DNA polymerase  40.96 
 
 		 100 aa  55.5  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3743  DNA polymerase beta domain protein region  43.21 
 
 		 98 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0626  DNA polymerase beta subunit  39.02 
 
 		 102 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.717752  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0703  DNA polymerase beta domain protein region  27.37 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000025763  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2704  DNA polymerase beta domain-containing protein region  39.56 
 
 		 95 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.272306 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0871  DNA polymerase beta domain protein region  37.84 
 
 		 99 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0202  DNA polymerase beta domain protein region  31.09 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.368731 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1075  DNA polymerase beta domain protein region  34.41 
 
 		 97 aa  55.1  0.0000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.796392  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1789  DNA polymerase beta domain protein region  39.02 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1292  DNA polymerase beta domain protein region  42.86 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.114397  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0943  DNA polymerase beta subunit  35.11 
 
 		 97 aa  54.7  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.744259 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0854  DNA polymerase beta subunit  32.97 
 
 		 96 aa  53.5  0.0000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0157  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 109 aa  53.5  0.0000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2017  DNA polymerase beta domain protein region  36.49 
 
 		 103 aa  53.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.538218  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1694  DNA polymerase beta subunit  30.77 
 
 		 97 aa  52.8  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.366424  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3676  DNA polymerase beta domain protein region  38.46 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.839378  normal  0.137366 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2036  DNA polymerase beta domain protein region  38.46 
 
 		 98 aa  52.4  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.18823  normal  0.524072 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1188  DNA polymerase beta domain protein region  34.78 
 
 		 113 aa  52.4  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0844  DNA polymerase beta subunit  39.51 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.909458  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0279  DNA polymerase beta domain protein region  35.24 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.155068  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0332  DNA polymerase beta domain protein region  32.56 
 
 		 94 aa  52  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3960  DNA polymerase beta subunit  40.51 
 
 		 104 aa  51.6  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.886641  normal  0.332553 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2495  DNA polymerase beta domain protein region  32.61 
 
 		 113 aa  51.2  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3147  DNA polymerase beta domain protein region  38 
 
 		 96 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.949814 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1320  DNA polymerase, beta-like region  32.98 
 
 		 106 aa  51.2  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0315  DNA polymerase beta domain protein region  30.34 
 
 		 97 aa  51.2  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0889475 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2672  DNA polymerase, beta-like region  36.36 
 
 		 96 aa  50.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.836328  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1148  DNA polymerase beta subunit  32.97 
 
 		 115 aa  50.8  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0949  DNA polymerase beta subunit  36.14 
 
 		 102 aa  50.8  0.000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.878884  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3618  DNA polymerase beta domain protein region  32.97 
 
 		 96 aa  50.8  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0274  hypothetical protein  34.83 
 
 		 112 aa  50.8  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0337  DNA polymerase beta domain protein region  36.59 
 
 		 86 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1934  DNA polymerase beta domain protein region  39.76 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.739683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1203  DNA polymerase, beta-like region  40 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.229672  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3948  DNA polymerase beta subunit  35.53 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  41.79 
 
 		 169 aa  49.3  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3786  DNA polymerase beta domain protein region  36.71 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.123289  normal  0.700807 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1207  DNA polymerase beta domain protein region  32.98 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3213  DNA polymerase beta domain protein region  36.62 
 
 		 96 aa  47.8  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0015  hypothetical protein  34.67 
 
 		 95 aa  47  0.00009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3538  DNA polymerase beta subunit  34.04 
 
 		 98 aa  47  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.114192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0479  DNA polymerase, beta-like region  37.8 
 
 		 105 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0374  DNA polymerase, beta-like region  33.33 
 
 		 121 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2714  DNA polymerase, beta-like region  28.16 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.505964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0898  DNA polymerase, beta-like region  34.85 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1241  DNA polymerase beta domain-containing protein region  30.69 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.282265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1806  DNA polymerase beta domain protein region  39.39 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.943156  normal  0.843762 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0587  DNA polymerase, beta-like region  39.13 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.204552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0208  hypothetical protein  42.19 
 
 		 120 aa  46.2  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0639288  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3117  DNA polymerase beta subunit  34.62 
 
 		 110 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3557  DNA polymerase beta subunit  32.47 
 
 		 254 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0946906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0273  DNA polymerase, beta-like region  29.41 
 
 		 98 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0369  DNA polymerase beta subunit  27.78 
 
 		 105 aa  45.1  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.832865  normal  0.194305 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2416  DNA polymerase beta subunit  43.33 
 
 		 103 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.606985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5548  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 93 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.861724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2453  DNA polymerase beta subunit  38.36 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00090311  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>