More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0817 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0817  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
132 aa  266  5e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0011  regulatory protein, ArsR  57.84 
 
 
120 aa  120  5e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1033  transcriptional regulator, ArsR family  56.44 
 
 
108 aa  116  9e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0013  regulatory protein, ArsR  52.34 
 
 
127 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0423  regulatory protein, ArsR  54.9 
 
 
128 aa  114  5e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2405  ArsR family transcriptional regulator  46.73 
 
 
110 aa  107  6e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.673414  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0684  transcriptional regulator, ArsR family  46.3 
 
 
115 aa  105  2e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0873  ArsR family transcriptional regulator  42.98 
 
 
134 aa  95.1  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.107087  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0018  ArsR family transcriptional regulator  51.47 
 
 
108 aa  78.2  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3335  transcriptional regulator, ArsR family  42.5 
 
 
110 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0506  ArsR family transcriptional regulator  44.3 
 
 
118 aa  73.2  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2434  transcriptional regulator, ArsR family  48.53 
 
 
111 aa  71.2  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0671  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 
112 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3359  ArsR family transcriptional regulator  49.21 
 
 
107 aa  68.2  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  38.82 
 
 
120 aa  67  0.00000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  38.67 
 
 
125 aa  67  0.00000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2322  transcriptional regulator, ArsR family  38.96 
 
 
111 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2373  transcriptional regulator, ArsR family  38.96 
 
 
111 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000354964  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  34.83 
 
 
125 aa  64.7  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0417  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
120 aa  64.3  0.0000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.853765  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1112  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
132 aa  63.9  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1847  ArsR family transcriptional regulator  47.46 
 
 
105 aa  63.2  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.006299  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12351  ArsR family regulatory protein  36.99 
 
 
90 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  39.47 
 
 
127 aa  62.4  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0726  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
90 aa  62.8  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.676551  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0688  ArsR family transcriptional regulator  43.55 
 
 
112 aa  62  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.812814  normal  0.550052 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0438  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
106 aa  62  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.729784  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
104 aa  61.2  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  35.71 
 
 
336 aa  61.6  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  35.8 
 
 
120 aa  61.6  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  34.12 
 
 
119 aa  61.2  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1722  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 
116 aa  60.8  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.416614 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1705  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
115 aa  60.5  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0202215  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3658  transcriptional regulator, ArsR family  37.14 
 
 
105 aa  60.5  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  36.76 
 
 
337 aa  60.5  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2832  regulatory protein, ArsR  36.67 
 
 
128 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.119331 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2556  transcriptional regulator, ArsR family  44.07 
 
 
119 aa  60.1  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000387773  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4284  transcriptional regulator, ArsR family  39.47 
 
 
104 aa  60.1  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2876  ArsR family transcriptional regulator  46.77 
 
 
134 aa  60.1  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.557946  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4523  ArsR family transcriptional regulator  24.56 
 
 
125 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4610  ArsR family transcriptional regulator  24.56 
 
 
125 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11041  regulatory proteins, ArsR family protein  39.44 
 
 
92 aa  60.1  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.74054 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 
115 aa  59.3  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4906  ArsR family transcriptional regulator  24.56 
 
 
125 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  37.18 
 
 
127 aa  59.3  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3047  transcriptional regulator, ArsR family  30.48 
 
 
129 aa  59.3  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  37.68 
 
 
124 aa  58.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
123 aa  58.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  36.62 
 
 
95 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  34.52 
 
 
126 aa  58.9  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 
120 aa  58.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  35.14 
 
 
349 aa  58.2  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  38.24 
 
 
119 aa  57.8  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  34.67 
 
 
116 aa  57.8  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  39.71 
 
 
117 aa  57.8  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
127 aa  57.4  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  41.27 
 
 
120 aa  57.4  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0112  ArsR family transcriptional regulator  37.68 
 
 
119 aa  57.4  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0936  regulator of arsenical resistance  41.27 
 
 
113 aa  57.4  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.59 
 
 
113 aa  57  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0576  transcriptional regulator, ArsR family  34.21 
 
 
108 aa  57.4  0.00000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00300248  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  40.85 
 
 
116 aa  57  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2262  transcriptional regulator, ArsR family  29.46 
 
 
119 aa  56.2  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3114  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 
110 aa  57  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.114989  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0581  ArsR family transcriptional regulator  30.21 
 
 
115 aa  56.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2579  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
120 aa  56.2  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
123 aa  56.6  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  37.88 
 
 
317 aa  56.6  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  36.36 
 
 
123 aa  56.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2879  ArsR family transcriptional regulator  41.56 
 
 
110 aa  56.6  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1628  transcriptional regulator, ArsR family  38.16 
 
 
122 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.548833  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1741  transcriptional regulator, ArsR family  27.68 
 
 
119 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  32.47 
 
 
126 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2209  ArsR family transcriptional regulator  36.62 
 
 
124 aa  56.2  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000625729  normal  0.041755 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0627  transcriptional regulator, ArsR family  41.79 
 
 
103 aa  55.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.960217  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  40.32 
 
 
114 aa  55.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3390  ArsR family transcriptional regulator  40.32 
 
 
115 aa  55.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1161  regulatory protein, ArsR  30 
 
 
121 aa  55.8  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.358448  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9265  putative transcriptional regulator, ArsR family  30.23 
 
 
122 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2426  ArsR family transcriptional regulator  32.5 
 
 
97 aa  55.1  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.575206  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1731  arsenical resistance operon repressor  42.86 
 
 
105 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0861085  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3653  transcriptional regulator, ArsR family  35.94 
 
 
347 aa  55.1  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3175  ArsR family transcriptional regulator  38.71 
 
 
126 aa  55.5  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164371  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1965  ArsR family transcriptional regulator  28.71 
 
 
120 aa  55.1  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  35.06 
 
 
127 aa  55.5  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2774  ArsR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
108 aa  55.5  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.111393  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  28.16 
 
 
125 aa  55.1  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  44.78 
 
 
121 aa  55.1  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1492  ArsR family transcriptional regulator  34.12 
 
 
127 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220175  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2302  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
309 aa  55.1  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  38.1 
 
 
183 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0208  transcriptional regulator, ArsR family  38.24 
 
 
133 aa  54.7  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  40 
 
 
125 aa  54.7  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1123  transcriptional regulator, ArsR family  35.62 
 
 
126 aa  54.3  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000269044  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1925  SAM-dependent methyltransferase  31.51 
 
 
306 aa  54.3  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000216904  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  36.76 
 
 
112 aa  54.3  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0727  transcriptional regulator, ArsR family  45.16 
 
 
119 aa  54.3  0.0000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2324  transcriptional regulator, ArsR family  32.43 
 
 
94 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1541  cadmium efflux system accessory protein  27.71 
 
 
125 aa  53.9  0.0000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.558701  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
115 aa  54.3  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>