More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0801 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0801  hypothetical protein  100 
 
 		 366 aa  754    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000530348 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0931  radical SAM domain-containing protein  57.97 
 
 		 369 aa  409  1e-113  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.297129  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1324  radical SAM domain-containing protein  56.04 
 
 		 369 aa  406  1.0000000000000001e-112  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.527969 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1323  Radical SAM domain protein  53.59 
 
 		 360 aa  372  1e-102  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1169  radical SAM family protein  51.5 
 
 		 372 aa  370  1e-101  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.198127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0720  Fe-S oxidoreductase  45.41 
 
 		 377 aa  320  3e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0902  radical SAM domain-containing protein  39.63 
 
 		 369 aa  280  2e-74  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.981157  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1044  radical SAM domain-containing protein  39.36 
 
 		 369 aa  281  2e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.877972 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1633  radical SAM domain-containing protein  39.63 
 
 		 369 aa  280  3e-74  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.806615  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0523  radical SAM domain-containing protein  45.06 
 
 		 371 aa  276  4e-73  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1469  radical SAM family Fe-S protein  42.99 
 
 		 368 aa  272  6e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1062  radical SAM domain-containing protein  41.62 
 
 		 372 aa  270  2e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0686  radical SAM domain-containing protein  43.65 
 
 		 378 aa  246  6e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1049  radical SAM domain-containing protein  38.5 
 
 		 398 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1034  radical SAM domain-containing protein  41.64 
 
 		 393 aa  232  1e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.851598  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0766  radical SAM domain-containing protein  37.73 
 
 		 397 aa  222  6e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0742  radical SAM domain-containing protein  37.47 
 
 		 397 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0750  Radical SAM domain protein  40.45 
 
 		 405 aa  220  3.9999999999999997e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2409  radical SAM domain-containing protein  36.06 
 
 		 495 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.523158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1283  Radical SAM domain protein  38.41 
 
 		 451 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.340157  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1890  radical SAM domain-containing protein  34.3 
 
 		 398 aa  166  8e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1443  radical SAM domain-containing protein  33.76 
 
 		 410 aa  162  1e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.664587  normal  0.058788 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0311  radical SAM domain-containing protein  35.19 
 
 		 393 aa  161  2e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1202  radical SAM domain-containing protein  32.2 
 
 		 412 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0238  radical SAM domain-containing protein  29.45 
 
 		 461 aa  110  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.140637  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0558  radical SAM domain-containing protein  33.23 
 
 		 430 aa  106  7e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.236601  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0391  radical SAM domain-containing protein  31.34 
 
 		 435 aa  100  4e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1693  radical SAM family protein  29.04 
 
 		 467 aa  100  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2198  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  32.08 
 
 		 446 aa  99.4  9e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.972973  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3058  radical SAM domain-containing protein  26.15 
 
 		 529 aa  95.5  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111955  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1100  radical SAM domain-containing protein  24.93 
 
 		 470 aa  95.1  2e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1255  radical SAM domain-containing protein  25.08 
 
 		 441 aa  94.7  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3608  radical SAM domain-containing protein  29.93 
 
 		 459 aa  94.4  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1178  radical SAM domain-containing protein  26.28 
 
 		 439 aa  90.1  5e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1795  cobalamin B12-binding  25.88 
 
 		 529 aa  90.1  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1404  radical SAM domain-containing protein  27.72 
 
 		 562 aa  89.7  8e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00022345  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  27.59 
 
 		 1250 aa  89.4  8e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0570  RNA modification enzyme, MiaB family  29.55 
 
 		 447 aa  89  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0097  MiaB-like tRNA modifying enzyme  25.92 
 
 		 434 aa  89  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.698002  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1724  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.84 
 
 		 440 aa  89.4  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0097  MiaB-like tRNA modifying enzyme  26.2 
 
 		 434 aa  88.6  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.81672  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0774  RNA modification enzyme, MiaB family  29.71 
 
 		 455 aa  88.2  2e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0255462  normal  0.23064 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1200  cobalamin B12-binding domain-containing protein  24.45 
 
 		 441 aa  88.6  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0871  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  27.36 
 
 		 554 aa  87.8  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5168  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 527 aa  87.8  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3057  Radical SAM domain protein  28.15 
 
 		 518 aa  87  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00748759  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2195  Radical SAM domain protein  27.99 
 
 		 460 aa  87.4  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.565929  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0093  Radical SAM domain protein  30 
 
 		 490 aa  86.3  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0584264  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0831  radical SAM family protein  28.52 
 
 		 444 aa  85.9  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00311604  normal  0.515432 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2167  radical SAM family protein  27.3 
 
 		 444 aa  85.5  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.208329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3304  Radical SAM domain protein  25.86 
 
 		 487 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.542811  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0944  Radical SAM domain protein  28.29 
 
 		 488 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000117321 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0876  radical SAM family Fe-S protein  27.93 
 
 		 461 aa  85.1  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.430138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3127  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.07 
 
 		 440 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00194876  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1171  radical SAM family protein  27.4 
 
 		 563 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000834486  normal  0.0316133 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0897  Radical SAM domain protein  28.39 
 
 		 564 aa  84  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000336813  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2041  radical SAM domain-containing protein  36.43 
 
 		 529 aa  83.6  0.000000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1243  radical SAM domain-containing protein  23.79 
 
 		 533 aa  83.6  0.000000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.445572  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1946  radical SAM domain-containing protein  25.54 
 
 		 523 aa  83.2  0.000000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0208  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.28 
 
 		 449 aa  83.2  0.000000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1648  Radical SAM domain protein  24.28 
 
 		 450 aa  83.2  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1282  RNA modification enzyme, MiaB family  24.93 
 
 		 434 aa  82.4  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0671  Radical SAM domain protein  26.47 
 
 		 468 aa  82.4  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0076  Radical SAM domain protein  30.12 
 
 		 616 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.3742100000000001e-34 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0820  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.84 
 
 		 437 aa  82.4  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.696196  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1155  Radical SAM domain protein  26.5 
 
 		 522 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3165  Fe-S oxidoreductase  26.71 
 
 		 459 aa  82  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00148517 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2296  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.04 
 
 		 441 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00249706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1621  Elongator protein 3/MiaB/NifB  24.71 
 
 		 522 aa  81.6  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0718144 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2873  radical SAM domain-containing protein  27.73 
 
 		 520 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000297506  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3556  Radical SAM domain protein  27.52 
 
 		 450 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2340  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.15 
 
 		 524 aa  80.9  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00700  putative SAM/TRAM family methylase protein  25.94 
 
 		 482 aa  80.9  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2355  RNA modification protein  28.28 
 
 		 466 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3195  Radical SAM domain protein  26.55 
 
 		 552 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00554212 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0605  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.59 
 
 		 457 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0859  Radical SAM domain protein  27.36 
 
 		 557 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0689  Radical SAM domain protein  25.99 
 
 		 459 aa  80.1  0.00000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3217  RNA modification enzyme, MiaB family  28.13 
 
 		 435 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000221997  hitchhiker  0.000000785503 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1463  radical SAM domain-containing protein  27.55 
 
 		 528 aa  80.1  0.00000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2203  cobalamin B12-binding domain protein  26 
 
 		 475 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02131  Fe-S oxidoreductase  26.19 
 
 		 524 aa  79.7  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3770  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.97 
 
 		 467 aa  79.7  0.00000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3614  radical SAM domain-containing protein  25.25 
 
 		 451 aa  79.3  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0367  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.57 
 
 		 440 aa  79.3  0.00000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.313304  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3285  RNA modification enzyme, MiaB family  27.89 
 
 		 497 aa  78.2  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0343128  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3911  RNA modification enzyme, MiaB family  27.25 
 
 		 483 aa  78.2  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27690  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.53 
 
 		 494 aa  78.6  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.751852 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3387  Radical SAM domain protein  26.85 
 
 		 557 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.384607  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0873  radical SAM family Fe-S protein  24.41 
 
 		 501 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0874  radical SAM family Fe-S protein  23.28 
 
 		 501 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0969  MiaB-like tRNA modifying enzyme  27.45 
 
 		 421 aa  78.2  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1852  RNA modification enzyme, MiaB family  31.65 
 
 		 440 aa  77.4  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.417031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2351  Radical SAM domain protein  24.37 
 
 		 426 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0893  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  28.48 
 
 		 474 aa  77  0.0000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.188426  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1369  radical SAM domain-containing protein  27.66 
 
 		 556 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000805279  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0248  BchE/P-methylase family protein  24.93 
 
 		 428 aa  77  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2173  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.6 
 
 		 442 aa  76.6  0.0000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4019  Radical SAM domain protein  24.82 
 
 		 529 aa  77  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000347162 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2738  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.52 
 
 		 447 aa  77  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000461297  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>