More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0785 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0785  alpha-phosphoglucomutase / phosphomannomutase  100 
 
 
458 aa  939    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00879985  unclonable  0.000000000000213638 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0714  phosphomannomutase  54.8 
 
 
460 aa  504  1e-141  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.079186  normal  0.0391719 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0486  Phosphoglucosamine mutase  54.08 
 
 
455 aa  491  1e-137  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0755  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  53.38 
 
 
456 aa  488  1e-137  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0117608  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1197  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  50.55 
 
 
453 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0464554 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0721  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  42.08 
 
 
452 aa  348  1e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0831033  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2115  phosphoglucosamine mutase  40.41 
 
 
448 aa  338  9e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2225  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  40.32 
 
 
458 aa  331  2e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.161781  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1538  Phosphoglucosamine mutase  42.2 
 
 
450 aa  324  3e-87  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0505376  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0084  Phosphoglucosamine mutase  40.98 
 
 
454 aa  312  6.999999999999999e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1740  Phosphoglucosamine mutase  40.53 
 
 
454 aa  307  2.0000000000000002e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.533946  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0496  Phosphoglucosamine mutase  39.21 
 
 
480 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1188  Phosphoglucosamine mutase  38.22 
 
 
455 aa  295  1e-78  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2256  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  37.31 
 
 
453 aa  290  2e-77  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.361439  decreased coverage  0.00522565 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0852  Phosphoglucosamine mutase  39.1 
 
 
454 aa  290  4e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.198816  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0223  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  35.1 
 
 
452 aa  275  1.0000000000000001e-72  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00762456  normal  0.0119193 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0224  phosphoglucosamine mutase  35.76 
 
 
449 aa  267  2e-70  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2342  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  37.27 
 
 
433 aa  263  6e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0286234  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1084  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  36.65 
 
 
442 aa  248  1e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2021  phosphoglucomutase  36.47 
 
 
434 aa  246  6.999999999999999e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.63108 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1132  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  38.06 
 
 
437 aa  245  9.999999999999999e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.303022  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0400  phosphoglucosamine mutase  34.74 
 
 
446 aa  243  7e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2253  Phosphoglucosamine mutase  35.21 
 
 
434 aa  239  9e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.329457  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1316  Phosphoglucosamine mutase  34 
 
 
450 aa  236  5.0000000000000005e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3046  Phosphoglucosamine mutase  34.9 
 
 
445 aa  233  6e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1344  Phosphoglucosamine mutase  36.96 
 
 
446 aa  233  7.000000000000001e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0528  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  33.71 
 
 
430 aa  228  2e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0512  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  32.89 
 
 
447 aa  228  2e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0433  phosphoglucosamine mutase  33.33 
 
 
452 aa  227  3e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.732829  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0504  phosphoglucosamine mutase  33.94 
 
 
430 aa  227  3e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.730223  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0282  Phosphoglucosamine mutase  32.96 
 
 
416 aa  225  1e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1384  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  34.9 
 
 
454 aa  224  3e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_469  phosphomannomutase  33.49 
 
 
430 aa  223  4.9999999999999996e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0330  phosphoglucosamine mutase  32.81 
 
 
437 aa  223  7e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.256489  hitchhiker  0.00063167 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1582  phosphoglucosamine mutase  32.95 
 
 
437 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.0060705  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1785  Phosphomannomutase  31.94 
 
 
458 aa  218  1e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2740  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  34.24 
 
 
445 aa  217  2.9999999999999998e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1760  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  30.65 
 
 
470 aa  212  1e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00061927  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2668  Phosphoglucosamine mutase  32.22 
 
 
478 aa  210  5e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000530484  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1019  phosphoglucosamine mutase  33.48 
 
 
447 aa  206  5e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0512  Phosphoglucosamine mutase  32.47 
 
 
460 aa  206  6e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0294  phosphoglucosamine mutase  33.92 
 
 
444 aa  206  7e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000894137  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0423  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  29.45 
 
 
478 aa  205  1e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0481  phosphoglucosamine mutase  34.86 
 
 
445 aa  204  2e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0973  phosphoglucosamine mutase  33.47 
 
 
447 aa  202  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0440805 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0454  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  29.74 
 
 
467 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2566  phosphoglucosamine mutase  33.55 
 
 
466 aa  200  5e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.711802  normal  0.813668 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3490  phosphoglucosamine mutase  32.39 
 
 
450 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.731606  normal  0.0664049 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1688  phosphoglucosamine mutase  32.54 
 
 
465 aa  198  2.0000000000000003e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0304007  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3195  phosphoglucosamine mutase  32.17 
 
 
450 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0667  hypothetical protein  33.92 
 
 
419 aa  197  3e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0479  phosphoglucosamine mutase  33.55 
 
 
452 aa  197  3e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1286  phosphoglucosamine mutase  33.33 
 
 
451 aa  197  3e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0527928  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0887  phosphoglucosamine mutase  32.96 
 
 
450 aa  197  4.0000000000000005e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00143709  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0315  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  34.09 
 
 
418 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.660935 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0717  phosphoglucosamine mutase  33.33 
 
 
444 aa  197  5.000000000000001e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1134  phosphomannomutase  30.18 
 
 
472 aa  196  6e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.579862  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0945  phosphoglucosamine mutase  33.2 
 
 
461 aa  195  1e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2246  phosphoglucosamine mutase  32.9 
 
 
444 aa  195  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000153354  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1175  phosphomannomutase  30.63 
 
 
447 aa  195  1e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3018  phosphoglucosamine mutase  33.78 
 
 
450 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0396425 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1599  phosphoglucosamine mutase  32.4 
 
 
454 aa  195  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3484  phosphomannomutase  29.13 
 
 
467 aa  195  2e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0611643 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2822  phosphoglucosamine mutase  32.18 
 
 
450 aa  195  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1487  phosphoglucosamine mutase  34.44 
 
 
450 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.152305  normal  0.438843 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1783  phosphoglucosamine mutase  32.55 
 
 
450 aa  195  2e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.363404  normal  0.362539 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1204  phosphoglucosamine mutase  33.86 
 
 
449 aa  194  3e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0154  phosphoglucosamine mutase  30.52 
 
 
449 aa  194  3e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0158  phosphoglucosamine mutase  31.06 
 
 
448 aa  194  3e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.135407  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1001  phosphoglucosamine mutase  32.54 
 
 
460 aa  194  3e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00128114  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3862  phosphoglucosamine mutase  33.33 
 
 
451 aa  194  3e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0189  phosphoglucosamine mutase  32.05 
 
 
448 aa  194  3e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165004  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1163  phosphoglucosamine mutase  32.88 
 
 
449 aa  194  3e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2635  phosphoglucosamine mutase  32.74 
 
 
454 aa  193  4e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2888  phosphoglucosamine mutase  33.56 
 
 
450 aa  194  4e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0016  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  28.41 
 
 
464 aa  193  5e-48  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0386  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  28.18 
 
 
472 aa  193  5e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00260149  normal  0.0316294 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0150  phosphoglucosamine mutase  32.05 
 
 
448 aa  192  8e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.250899  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0409  phosphoglucosamine mutase  32.88 
 
 
451 aa  192  8e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000346871  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1690  phosphoglucosamine mutase  33.63 
 
 
451 aa  192  9e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1634  phosphoglucosamine mutase  33.63 
 
 
451 aa  192  9e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1094  phosphomannomutase  29.28 
 
 
462 aa  192  1e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.205287 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01560  phosphoglucosamine mutase  32.44 
 
 
449 aa  192  1e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2305  phosphoglucosamine mutase  33.19 
 
 
447 aa  192  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.181279  normal  0.714962 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1333  phosphoglucosamine mutase  33.86 
 
 
450 aa  192  1e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.951592  hitchhiker  0.00110502 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2670  phosphoglucosamine mutase  32.61 
 
 
446 aa  192  1e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3629  phosphoglucosamine mutase  32.75 
 
 
450 aa  192  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.917297  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5135  phosphoglucosamine mutase  31.83 
 
 
448 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1205  phosphoglucosamine mutase  33.33 
 
 
452 aa  190  2.9999999999999997e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.713344  normal  0.913107 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0151  phosphoglucosamine mutase  31.83 
 
 
448 aa  190  4e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.205668  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4504  phosphomannomutase  31.73 
 
 
462 aa  190  5e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1224  phosphoglucosamine mutase  33.26 
 
 
459 aa  190  5e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2100  hypothetical protein  31.99 
 
 
450 aa  190  5.999999999999999e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000873821  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1398  phosphoglucosamine mutase  33.56 
 
 
450 aa  189  7e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.033665 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21950  phosphoglucosamine mutase  32.62 
 
 
450 aa  189  8e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.292895  hitchhiker  0.00779909 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0586  phosphoglucosamine mutase  31.06 
 
 
453 aa  189  1e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2228  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  33.5 
 
 
418 aa  189  1e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2612  phosphoglucosamine mutase  34.44 
 
 
449 aa  188  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0616  phosphoglucosamine mutase  33.62 
 
 
455 aa  188  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.508325 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2324  phosphoglucosamine mutase  31.26 
 
 
449 aa  188  2e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.4434  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>