More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0776 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_0860  Sigma 54 interacting domain protein  62.21 
 
 
731 aa  776    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1038  ATP-dependent protease Lon  64.09 
 
 
765 aa  794    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1408  peptidase S16, Lon-like protease  58.82 
 
 
631 aa  721    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3532  ATP-dependent protease Lon  65.43 
 
 
698 aa  845    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2822  Sigma 54 interacting domain protein  61.87 
 
 
778 aa  759    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0976  ATP-dependent protease Lon  72.85 
 
 
680 aa  887    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.01926  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2897  ATP-dependent protease Lon  61.72 
 
 
711 aa  790    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.512346  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0776  ATP-dependent protease Lon  100 
 
 
632 aa  1279    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000293467  unclonable  0.000000000000496506 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0880  ATP-dependent protease Lon  67.82 
 
 
637 aa  852    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2694  ATP-dependent protease Lon  72.28 
 
 
638 aa  920    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0597  ATP-dependent protease Lon  67.61 
 
 
635 aa  849    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2391  ATP-dependent protease Lon  73.7 
 
 
662 aa  905    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.654963 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0276  ATP-dependent protease Lon  73.66 
 
 
645 aa  934    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000589663  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3199  ATP-dependent protease Lon  63.62 
 
 
693 aa  779    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.11002 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0404  Lon-B peptidase  32.52 
 
 
692 aa  299  9e-80  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.175581  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0502  peptidase S16, Lon-like protease  35.01 
 
 
685 aa  221  3.9999999999999997e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.85369  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1487  peptidase S16, Lon-like protease  34.26 
 
 
693 aa  220  5e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0433  peptidase S16, Lon-like protease  33.92 
 
 
692 aa  218  2e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.317598  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1350  peptidase S16, Lon-like protease  32.99 
 
 
703 aa  212  2e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.966121  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1394  AAA ATPase central domain protein  47.5 
 
 
496 aa  208  2e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195644  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3302  endopeptidase La  29.64 
 
 
648 aa  139  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.468611  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3354  Sigma 54 interacting domain protein  30.26 
 
 
575 aa  139  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.398468  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2742  endopeptidase La  28.74 
 
 
558 aa  137  7.000000000000001e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2560  ATPase central domain-containing protein  26.78 
 
 
571 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23310  Sporulation protease LonC  27.23 
 
 
639 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1020  ATP-dependent protease  28.15 
 
 
803 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0708  peptidase S16, lon domain protein  28.13 
 
 
819 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4369  Sigma 54 interacting domain protein  29.4 
 
 
579 aa  131  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3583  ATP-dependent protease-like  25.12 
 
 
660 aa  131  4.0000000000000003e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0720  peptidase S16, lon domain protein  27.47 
 
 
819 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.59212e-16 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1654  endopeptidase La  28.38 
 
 
566 aa  129  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14920  Sporulation protease LonB  28.39 
 
 
558 aa  128  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.989264  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05096  ATP-dependent protease  27.59 
 
 
786 aa  128  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1359  peptidase S16, lon domain-containing protein  28.35 
 
 
807 aa  128  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4930  Sigma 54 interacting domain protein  29.41 
 
 
652 aa  128  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.327719  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2309  peptidase S16 lon domain protein  27.47 
 
 
817 aa  128  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1645  ATP-dependent protease LonB  28.51 
 
 
570 aa  127  7e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1383  ATP-dependent protease LonB  28.73 
 
 
570 aa  126  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.447835  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1843  Sigma 54 interacting domain protein  29.72 
 
 
558 aa  122  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.331882  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3103  peptidase S16, lon-like protein  26.2 
 
 
810 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2534  putative ATP-dependent protease La  27.13 
 
 
670 aa  122  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000500974  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001230  ATP-dependent protease La Type II  26.85 
 
 
786 aa  122  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1104  ATP-dependent protease LonB  28.86 
 
 
537 aa  122  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.286767 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1477  peptidase S16, lon domain-containing protein  29.33 
 
 
563 aa  120  6e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.448657  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0928  peptidase S16, lon domain-containing protein  25.99 
 
 
794 aa  120  7e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00182033  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2088  peptidase S16 lon domain protein  27.66 
 
 
803 aa  120  7.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2079  peptidase S16, lon domain-containing protein  27.72 
 
 
802 aa  120  7.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0020  ATP-dependent protease, putative  24.74 
 
 
823 aa  120  9e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140592  normal  0.225222 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0981  peptidase S16 lon domain protein  27.46 
 
 
831 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000165888  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3350  Lon-A peptidase  35.74 
 
 
812 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4350  Sigma 54 interacting domain protein  28.34 
 
 
650 aa  118  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3051  peptidase S16 lon domain protein  27.82 
 
 
825 aa  117  5e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1270  peptidase S16, lon domain-containing protein  28.51 
 
 
805 aa  117  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3496  ATP-dependent protease La  40.96 
 
 
812 aa  117  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.473507  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2719  peptidase S16, lon domain-containing protein  26.32 
 
 
810 aa  117  7.999999999999999e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.220264  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1411  Lon-A peptidase  39.79 
 
 
811 aa  117  7.999999999999999e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000104589  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0812  Sigma 54 interacting domain protein  25.74 
 
 
560 aa  117  7.999999999999999e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.181262  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1230  peptidase S16, lon domain-containing protein  26.21 
 
 
805 aa  117  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.813888  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3432  ATP-dependent protease La  40.21 
 
 
819 aa  117  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1159  ATP-dependent protease, putative  26.21 
 
 
805 aa  117  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1160  ATP-dependent protease, putative  26.21 
 
 
805 aa  117  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2463  peptidase S16 lon domain-containing protein  27.11 
 
 
816 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.572002  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3407  peptidase S16 lon domain protein  30.07 
 
 
806 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.025789  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4987  ATP-dependent protease La  39.58 
 
 
824 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00166311  normal  0.674678 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3185  sporulation protease LonB  28.82 
 
 
556 aa  115  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0950  peptidase S16 lon domain-containing protein  25.29 
 
 
794 aa  114  6e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0177  peptidase S16 lon domain protein  28.68 
 
 
818 aa  114  7.000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.16877  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0133  endopeptidase La  30.29 
 
 
655 aa  114  7.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126751  normal  0.379491 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0906  ATP-dependent protease La  37.31 
 
 
810 aa  114  7.000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1519  peptidase S16, lon-like protein  25.21 
 
 
787 aa  114  8.000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0866  ATP-dependent protease LonB  29.17 
 
 
557 aa  114  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3391  ATP-dependent protease, putative  25.58 
 
 
806 aa  113  9e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2433  ATP-dependent protease, putative  28.51 
 
 
821 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0936  ATP-dependent protease La  36.79 
 
 
810 aa  113  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1493  ATP-dependent protease La  40.88 
 
 
802 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0489479  normal  0.577481 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1294  peptidase S16, lon domain-containing protein  26.43 
 
 
805 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.506125  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3060  peptidase S16, lon domain protein  26.43 
 
 
805 aa  112  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0329616  hitchhiker  0.000400818 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2806  Lon-A peptidase  39.78 
 
 
802 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2586  ATP-dependent protease LonB  27.62 
 
 
556 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000324965  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1662  peptidase S16 lon domain-containing protein  25.47 
 
 
788 aa  111  4.0000000000000004e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0740  peptidase S16 lon domain-containing protein  28.57 
 
 
843 aa  111  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.493577 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0840  putative Lon protease  25.33 
 
 
777 aa  111  5e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2563  ATP-dependent protease La  39.01 
 
 
807 aa  111  5e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.574534  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3418  ATP-dependent protease La  31.83 
 
 
810 aa  110  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.136554  normal  0.0269191 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1297  peptidase S16, lon domain-containing protein  27.12 
 
 
786 aa  110  7.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000625582  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1171  Lon-A peptidase  39.79 
 
 
804 aa  110  7.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.618926  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1328  peptidase S16 lon domain-containing protein  27.11 
 
 
805 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.047879 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1777  ATP-dependent protease La  31.31 
 
 
802 aa  110  7.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.169591  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1230  ATP-dependent protease La  37.31 
 
 
805 aa  109  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2363  ATP-dependent protease La  37.31 
 
 
805 aa  109  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1463  ATP-dependent protease La  37.31 
 
 
805 aa  109  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114197  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1675  Lon-A peptidase  39.56 
 
 
805 aa  110  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0439877 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2479  ATP-dependent protease La  37.31 
 
 
805 aa  109  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.71727  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1674  peptidase S16, ATP-dependent protease La  38.02 
 
 
812 aa  110  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.37162  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2681  ATP-dependent protease La  37.97 
 
 
806 aa  109  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492035  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2122  ATP-dependent protease La  37.31 
 
 
806 aa  109  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3350  ATP-dependent protease La  37.31 
 
 
805 aa  109  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00464678  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4316  sporulation protease LonB  29.41 
 
 
556 aa  110  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1908  ATP-dependent protease La  37.31 
 
 
807 aa  109  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.261934  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2418  ATP-dependent protease La  37.97 
 
 
806 aa  109  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.679519  normal  0.805498 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>